标题:
[求助]JC-1分析结果求助
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作者:
+小生怕怕+
时间:
2012-3-20 12:42
标题:
[求助]JC-1分析结果求助
各位大虾们,小弟来求教。我做了流式,利用JC-1染色分析某种细胞的线粒体膜电位受损情况。结果让我很困惑。跟书上说的完全不一样啊。是不是我参数设置有问题?上流式时比较匆忙,有个老师帮***作。他也没有说清楚到底是什么原理。
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95553280.jpeg
(2012-3-20 12:42, 44.93 KB) / 该附件被下载次数 20
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=11197
作者:
66+77
时间:
2012-3-20 12:42
你分析的是什么细胞?
做的什么处理?
标记的是哪些东西?
阴性对照图呢?
作者:
+小生怕怕+
时间:
2012-3-20 12:42
分析的是癌细胞,加了药物刺激。做的是JC-1染色。没有做阴性对照,做了阳性对照。上面那张是正常组图。
作者:
+小生怕怕+
时间:
2012-3-20 12:43
这是我按试剂盒说明书里做的阳性对照结果。
图片附件:
10143958.jpeg
(2012-3-20 12:43, 40.75 KB) / 该附件被下载次数 16
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=11198
作者:
+小生怕怕+
时间:
2012-3-20 12:43
这张是我加药最高浓度的结果。
图片附件:
57020921.jpeg
(2012-3-20 12:43, 39.04 KB) / 该附件被下载次数 12
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=11199
作者:
+小生怕怕+
时间:
2012-3-20 12:43
流式那的老师说,看象限里,Q2是正常细胞,Q4里是线粒体膜电位变化的细胞。这样看是对的么?如果我要分析结果。是不是把Q2:Q4的比值给做个柱形变化图就可以了?
作者:
66+77
时间:
2012-3-20 12:44
会不会是组别弄错了?
再做一次试试吧!
作者:
66+77
时间:
2012-3-20 12:44
流式那的老师说,看象限里,Q2是正常细胞,Q4里是线粒体膜电位变化的细胞。这样看是对的么?如果我要分析结果。是不是把Q2:Q4的比值给做个柱形变化图就可以了?
——————————————————————————————————————————
不是这样的,这时不要用比例值,而应该用平均荧光强度。
用FL2的平均荧光强度值/FL1的平均荧光强度值评价线粒体损伤情况,值越高,损伤越利害。
作者:
+小生怕怕+
时间:
2012-3-20 12:45
QUOTE:
原帖由
66+77
于 2012-3-20 12:44 发表
bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '
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')
流式那的老师说,看象限里,Q2是正常细胞,Q4里是线粒体膜电位变化的细胞。这样看是对的么?如果我要分析结果。是不是把Q2:Q4的比值给做个柱形变化图就可以了?
————————————————————————————— ...
FL2和FL1?我这里有的数据是 PI-A,和FITC-A的MEAN值。
是不是这样算也行的?
作者:
66+77
时间:
2012-3-20 12:45
FL1就是第一荧光通道,就是你的FITC通道。
FL2就是第二荧光通道,应该就是你的PI通道。
平均荧光强度就是通道的Mean值。
看你的图细胞没有明显的阴阳性区分,最好不要用阳性比例作为你的结果,最好用平均荧光强度。
而且JC-1染色一般也是要求结果是FL1和FL2之间平均荧光强度的比值。
作者:
+小生怕怕+
时间:
2012-3-20 12:45
标题:
回复 #10 66+77 的帖子
谢谢你的不吝赐教。
我的mean值是分象限的。在象限里相互比较有意义么?
作者:
+小生怕怕+
时间:
2012-3-20 12:46
下面这张是正常组的数据图。
图片附件:
20731145.jpeg
(2012-3-20 12:46, 47.96 KB) / 该附件被下载次数 16
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=11200
作者:
hulu呼噜
时间:
2012-3-20 12:46
参见我的一个回帖
cuturl('http://cell.dxy.cn/bbs/topic/17240753')
应将log scale转换为 arithmetic scale,分别得到红、绿荧光的arithmetic mean (AM),然后计算比值Ratio,Ratio=AM红/AM绿。线粒体膜电位受损时,Ratio值降低。
作者:
66+77
时间:
2012-3-20 12:47
不要分象限。分象限比较没有意义,因为象限是根据细胞的阴阳性区分的,你的细胞根本就没有阴阳性之分,象限也就没有意义了。或者说,你划的十字线对于你的这种染色结果来说根本就是错误的。
所以,如果你的图要放到文献中,需要去掉十字线。
作者:
+小生怕怕+
时间:
2012-3-20 12:47
参见我的一个回帖
cuturl('http://cell.dxy.cn/bbs/topic/17240753')
应将log scale转换为 arithmetic scale,分别得到红、绿荧光的arithmetic mean (AM),然后计算比值Ratio,Ratio=AM红/AM绿。线粒体膜电位受损时,Ratio值降低。
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WinMDI 2.9。这个软件,我已经下载安装了,但是全是英文。我还没摸清楚如何使用。
作者:
+小生怕怕+
时间:
2012-3-20 12:47
不要分象限。分象限比较没有意义,因为象限是根据细胞的阴阳性区分的,你的细胞根本就没有阴阳性之分,象限也就没有意义了。或者说,你划的十字线对于你的这种染色结果来说根本就是错误的。
所以,如果你的图要放到文献中,需要去掉十字线。
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原来如此,这个图误导了我。谢谢!
这图是做流式的老师给我的,关于这个结果,我还是要重复再做的。
作者:
hulu呼噜
时间:
2012-3-20 12:48
WinMDI 2.9。这个软件,我已经下载安装了,但是全是英文。我还没摸清楚如何使用。
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以下是你的结果(density plot)。你的细胞群的位置有点问题,在下图的坐标中,control细胞群的位置宜摆在近象限中点心处,这样受试组的结果会比较好看。
分析方法:
按邮件里所述方法分别计算红、绿色荧光直方图(histogram)的数学均值(AM),以表示细胞群的平均荧光强度。计算Ratio值(Ration=AM红/AM绿),反映线粒体膜电位的平均水平。
图片附件:
20003589.snap.jpg
(2012-3-20 12:48, 35.27 KB) / 该附件被下载次数 12
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=11201
作者:
hulu呼噜
时间:
2012-3-20 12:49
.....
用FL2的平均荧光强度值/FL1的平均荧光强度值评价线粒体损伤情况,值越高,损伤越利害。
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好像弄反了吧?
FL2采集的是J-aggregates(富集于线粒体)的红色荧光,FL1采集的是JC-1 monomer(胞浆中)的绿色荧光。线粒体损伤时应该是J-aggregates减少而JC-1 monomer增多,应红色荧光减弱而绿色荧光增强,故上述值越低,损伤越利害。
作者:
66+77
时间:
2012-3-20 12:49
不好意思。
的确是我弄反了。
那么楼主的结果是正确的。可以直接分析了。
作者:
bohe221
时间:
2012-3-20 12:50
我觉得LZ用象限区分阴性和阳性区域来呈现结果是正确的做法。
参见陈朱波,曹雪涛 所著《流式细胞术》(科学出版社);梁智辉 等所著,《流式细胞术基本原理与使用方法》(华中科技大学出版社)
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