Board logo

标题: [求助]JC-1分析结果求助 [打印本页]

作者: +小生怕怕+    时间: 2012-3-20 12:42     标题: [求助]JC-1分析结果求助




各位大虾们,小弟来求教。我做了流式,利用JC-1染色分析某种细胞的线粒体膜电位受损情况。结果让我很困惑。跟书上说的完全不一样啊。是不是我参数设置有问题?上流式时比较匆忙,有个老师帮***作。他也没有说清楚到底是什么原理。


图片附件: 95553280.jpeg (2012-3-20 12:42, 44.93 KB) / 该附件被下载次数 20
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=11197


作者: 66+77    时间: 2012-3-20 12:42


你分析的是什么细胞?
做的什么处理?
标记的是哪些东西?
阴性对照图呢?

作者: +小生怕怕+    时间: 2012-3-20 12:42


分析的是癌细胞,加了药物刺激。做的是JC-1染色。没有做阴性对照,做了阳性对照。上面那张是正常组图。

作者: +小生怕怕+    时间: 2012-3-20 12:43


这是我按试剂盒说明书里做的阳性对照结果。


图片附件: 10143958.jpeg (2012-3-20 12:43, 40.75 KB) / 该附件被下载次数 16
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=11198


作者: +小生怕怕+    时间: 2012-3-20 12:43


这张是我加药最高浓度的结果。


图片附件: 57020921.jpeg (2012-3-20 12:43, 39.04 KB) / 该附件被下载次数 12
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=11199


作者: +小生怕怕+    时间: 2012-3-20 12:43


流式那的老师说,看象限里,Q2是正常细胞,Q4里是线粒体膜电位变化的细胞。这样看是对的么?如果我要分析结果。是不是把Q2:Q4的比值给做个柱形变化图就可以了?

作者: 66+77    时间: 2012-3-20 12:44

会不会是组别弄错了?
再做一次试试吧!

作者: 66+77    时间: 2012-3-20 12:44

流式那的老师说,看象限里,Q2是正常细胞,Q4里是线粒体膜电位变化的细胞。这样看是对的么?如果我要分析结果。是不是把Q2:Q4的比值给做个柱形变化图就可以了?

——————————————————————————————————————————

不是这样的,这时不要用比例值,而应该用平均荧光强度。
用FL2的平均荧光强度值/FL1的平均荧光强度值评价线粒体损伤情况,值越高,损伤越利害。

作者: +小生怕怕+    时间: 2012-3-20 12:45



QUOTE:
原帖由 66+77 于 2012-3-20 12:44 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
流式那的老师说,看象限里,Q2是正常细胞,Q4里是线粒体膜电位变化的细胞。这样看是对的么?如果我要分析结果。是不是把Q2:Q4的比值给做个柱形变化图就可以了?

————————————————————————————— ...


FL2和FL1?我这里有的数据是 PI-A,和FITC-A的MEAN值。
是不是这样算也行的?

作者: 66+77    时间: 2012-3-20 12:45

FL1就是第一荧光通道,就是你的FITC通道。
FL2就是第二荧光通道,应该就是你的PI通道。
平均荧光强度就是通道的Mean值。
看你的图细胞没有明显的阴阳性区分,最好不要用阳性比例作为你的结果,最好用平均荧光强度。
而且JC-1染色一般也是要求结果是FL1和FL2之间平均荧光强度的比值。

作者: +小生怕怕+    时间: 2012-3-20 12:45     标题: 回复 #10 66+77 的帖子

谢谢你的不吝赐教。
我的mean值是分象限的。在象限里相互比较有意义么?
作者: +小生怕怕+    时间: 2012-3-20 12:46


下面这张是正常组的数据图。


图片附件: 20731145.jpeg (2012-3-20 12:46, 47.96 KB) / 该附件被下载次数 16
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=11200


作者: hulu呼噜    时间: 2012-3-20 12:46


参见我的一个回帖

cuturl('http://cell.dxy.cn/bbs/topic/17240753')

应将log scale转换为 arithmetic scale,分别得到红、绿荧光的arithmetic mean (AM),然后计算比值Ratio,Ratio=AM红/AM绿。线粒体膜电位受损时,Ratio值降低。

作者: 66+77    时间: 2012-3-20 12:47


不要分象限。分象限比较没有意义,因为象限是根据细胞的阴阳性区分的,你的细胞根本就没有阴阳性之分,象限也就没有意义了。或者说,你划的十字线对于你的这种染色结果来说根本就是错误的。
所以,如果你的图要放到文献中,需要去掉十字线。

作者: +小生怕怕+    时间: 2012-3-20 12:47

参见我的一个回帖

cuturl('http://cell.dxy.cn/bbs/topic/17240753')

应将log scale转换为 arithmetic scale,分别得到红、绿荧光的arithmetic mean (AM),然后计算比值Ratio,Ratio=AM红/AM绿。线粒体膜电位受损时,Ratio值降低。

————————————————————————————————————————

WinMDI 2.9。这个软件,我已经下载安装了,但是全是英文。我还没摸清楚如何使用。
作者: +小生怕怕+    时间: 2012-3-20 12:47

不要分象限。分象限比较没有意义,因为象限是根据细胞的阴阳性区分的,你的细胞根本就没有阴阳性之分,象限也就没有意义了。或者说,你划的十字线对于你的这种染色结果来说根本就是错误的。
所以,如果你的图要放到文献中,需要去掉十字线。

————————————————————————————————

原来如此,这个图误导了我。谢谢!
这图是做流式的老师给我的,关于这个结果,我还是要重复再做的。

作者: hulu呼噜    时间: 2012-3-20 12:48

WinMDI 2.9。这个软件,我已经下载安装了,但是全是英文。我还没摸清楚如何使用。

————————————————————————————————————————————————————————————————

以下是你的结果(density plot)。你的细胞群的位置有点问题,在下图的坐标中,control细胞群的位置宜摆在近象限中点心处,这样受试组的结果会比较好看。

分析方法:
按邮件里所述方法分别计算红、绿色荧光直方图(histogram)的数学均值(AM),以表示细胞群的平均荧光强度。计算Ratio值(Ration=AM红/AM绿),反映线粒体膜电位的平均水平。


图片附件: 20003589.snap.jpg (2012-3-20 12:48, 35.27 KB) / 该附件被下载次数 12
http://bbs.antpedia.com/attachment.php?aid=11201


作者: hulu呼噜    时间: 2012-3-20 12:49

.....
用FL2的平均荧光强度值/FL1的平均荧光强度值评价线粒体损伤情况,值越高,损伤越利害。

—————————————————————————————————————————————————————————————————

好像弄反了吧?

FL2采集的是J-aggregates(富集于线粒体)的红色荧光,FL1采集的是JC-1 monomer(胞浆中)的绿色荧光。线粒体损伤时应该是J-aggregates减少而JC-1 monomer增多,应红色荧光减弱而绿色荧光增强,故上述值越低,损伤越利害。

作者: 66+77    时间: 2012-3-20 12:49


不好意思。
的确是我弄反了。
那么楼主的结果是正确的。可以直接分析了。

作者: bohe221    时间: 2012-3-20 12:50


我觉得LZ用象限区分阴性和阳性区域来呈现结果是正确的做法。

参见陈朱波,曹雪涛 所著《流式细胞术》(科学出版社);梁智辉 等所著,《流式细胞术基本原理与使用方法》(华中科技大学出版社)





欢迎光临 分析测试百科 (http://bbs.antpedia.com/) Powered by Discuz! 5.5.0