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标题:[求助]帮忙分析流式测凋亡的图片

一叶[使用道具]
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先说AP的那两张:
处理后明显出现AP,但是应该是subG1,而不包括荧光强度很小的那群,因为细胞特点不一样,也不好就百分百排除,但是凋亡既然是精巧调控的PCD,其过程也是有规律的,所以发生凋亡的细胞的DNA loss程度也应该有生物聚集特性,而荧光强度低的那群很有可能是debris containing few DNA fragments,所以跟subG1区别很明显。如果是大流式,建议sorting出来sub-sub和subG1这两群,再拿回光镜下看应该区别很明显的。
至于细胞周期,都诱导凋亡了,cycle能不紊乱吗!所有期的细胞DNA都被切割,所以G2期荧光强度减弱至原来S期的强度,S期的减弱至G1甚至subG1,G1减弱至subG1。而不是S期增值旺盛,再说都凋亡了,还增值啥呀!多思考,想清楚,否则就出现明显的判断失误了。

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bohe老师说的极是,要多思考,想清楚,不过我对bohe老师的说法有些不同看法

1.关于周期紊乱的说法: 某些类型的细胞发生凋亡时具有细胞周期特异性,即有些药物只诱导处于某一细胞周期的细胞凋亡,当细胞凋亡发生在G0G1期时,subG1在GOG1前清晰可见,而选择性发生在S或G2的凋亡,能否用PI单染检测尚有不同看法

2.关于不是S期增值旺盛的说法:如果搂主的实验是选择性诱导G0G1期细胞凋亡,那么S期增值旺盛是有可能的,另外,搂主问的是和正常细胞比较,我的理解,这里的正常细胞应该是正常二倍体细胞,而不是未经诱导的实验组阴性对照细胞

欢迎批评指正,共同提高
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一叶[使用道具]
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非常感谢您的解答,请教cllly22,按道理讲凋亡增多,S期应该低吧,为什么反而高了那?做凋亡的那个老师说最前面的那个峰是凋亡,G0G1前面的亚二倍体峰不知是怎么回事。请问亚二倍体是怎么回事?多谢指教

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1. 多数情况下,可能是会出现按道理讲出现的情况,出现不按道理的结果未尝不是好事,再查一下你用的药物是诱导哪期细胞凋亡的,如果多次结果都如此,一定是有原因的,找找原因,可能你的科研会有突破,另你的正常对照是否为未诱导实验细胞?

2.最前面的峰不是凋亡,多是碎片,G0G1前面的亚二倍体峰就是GOG1前面的那个小峰,基本是正态分布的

3.亚二倍体和是正常二倍体相比较而言的,这就是为什么我们实验要做正常细胞的原因了,把凋亡峰的平均荧光强度与正常二倍体GOG1峰的平均荧光强度多比值,小于1.0,直观上亚二倍体峰在正常二倍体峰的前面。

4. 既然做了凋亡的实验,对细胞周期就应该有一定的了解,建议看一下这方面的基础内容
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bohe221[使用道具]
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1.关于周期紊乱的说法: 某些类型的细胞发生凋亡时具有细胞周期特异性,即有些药物只诱导处于某一细胞周期的细胞凋亡,当细胞凋亡发生在G0G1期时,subG1在GOG1前清晰可见,而选择性发生在S或G2的凋亡,能否用PI单染检测尚有不同看法

2.关于不是S期增值旺盛的说法:如果搂主的实验是选择性诱导G0G1期细胞凋亡,那么S期增值旺盛是有可能的,另外,搂主问的是和正常细胞比较,我的理解,这里的正常细胞应该是正常二倍体细胞,而不是未经诱导的实验组阴性对照细胞

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判断周期是否紊乱最关键在于细胞DNA含量分布是否仍然保持相对规律,不管subG1出现没有,我们要判断细胞周期的变化总得还能准确清晰地分辨细胞周期啊。和第一张图相比,第二张图上从原来G1到G2的荧光强度分布区间里,细胞的分布早已没有规律可言,就算用cycle软件模拟,能看到的也是和分布曲线很不吻合的模拟“细胞周期”,反倒是细胞荧光强度呈相对连续无起伏的弥散分布,这是胞内DNA相对不规则损失的强有力证据,也就是说细胞群里每个细胞DNA含量都失去细胞周期的特有聚集性,无法呈现规律性,而只呈现相对随机性。那么怎么判断SPF呢?又怎么判断SPF显著增加呢?
另外,楼主说的正常细胞应该是指“正常”也就是没有诱导前的传代细胞(是不是肿瘤细胞就不知道了)。
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园丁##[使用道具]
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两位分析得都有道理。看得出都是流式高手兼cell cycle & apoptosis的专业人事!

大家学术讨论,希望以文会友,彼此学习,共同进步!

对于楼上说的“当细胞凋亡发生在G0G1期时,subG1在GOG1前清晰可见,而选择性发生在S或G2的凋亡,能否用PI单染检测尚有不同看法”,俺也考虑过,有可能!其实和bohe兄说的“所有期的细胞DNA都被切割,所以G2期荧光强度减弱至原来S期的强度,S期的减弱至G1甚至subG1,G1减弱至subG1”是一个道理。而这就使subG1法受到怀疑,没有查到相关文献,自己也很想弄清楚!两位能否推荐给我看一下?

对楼上说的“即有些药物只诱导处于某一细胞周期的细胞凋亡”的说法有点异议。个人认为更多情况下是“有些药物诱导的细胞凋亡只在某一期发生”!

关于楼主的图,俺认为这样的图用来看看趋势还是可以的,想发文章还差一点点! 试着多做几次,多几个剂量和时间点,更好的图更加利于分析。第二张图的确不好说!
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birdfish[使用道具]
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谢谢各位指教。我的对照是未处理的肿瘤细胞。溺水的小鱼 ,您好。能否发一张您做的图呀。多谢。
毕业在即,能否拿这两张图做毕业论文?这些图到底有没有意义呀?
急!
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一叶[使用道具]
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你的这两张图其实还是可以的,不用担心。
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kuaizige[使用道具]
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我的凋亡的荧光图还是有很漂亮的,但是很惭愧的是我的流式图也作的很不漂亮,还不如楼主的能说明问题,真不好意思。如果你想看看具体的凋亡图,我可以给你的。
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