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标题:【讨论帖】western blot问题解答

greenbee[使用道具]
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请教楼主:

最近做western总出问题,一直在改善条件,最近又出新问题了,请教老师帮分析一下:
1 发光以后背景很高,好像是所有蛋白条带都有,目的条带强一些,可是图没法用,而且蛋白marker没有条带,但是在暗室可以看到目的条带,看不到发光MARKER,压片后很多非特异性的条带。
2 又做一次换了NC膜,转完膜整个膜都花了,有些地方膜上白色的东西掉了,像掉漆了一样,一片一片的,无法继续试验,是膜的问题还是其他问题?有人说是膜干了,但用之前用转膜缓冲液浸泡了10分钟的。电泳100伏45分钟浓缩胶,150伏70分钟跑分离胶,跑完胶上有9条预染MARKER的条带。转膜用300毫安120分钟,预染MARKER转到膜上了,很淡,但是用TBST漂洗后就掉了,会是什么原因呢?
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想问下您知道dtt母液如何配制及保存条件吗?
做双向的时候要用
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请教一个关于2×SDS样品缓冲液的配制问题:

参阅《分子克隆实验指南》(第2版),配方如下:

100mmol/L Tris.HCl,pH 6.8
200mmol/L DTT(二硫苏糖醇)
4% SDS
0.2% 溴酚蓝
20% 甘油

书中提到不含DTT的缓冲液可室温保存,临用前加入1mol/L DTT贮存液。1mol/L DTT贮存液的配制方法:用20ml 0.01mol/L乙酸钠溶液(pH5.2)溶解3.09g DTT,过滤除菌后分装成1ml小份贮存于-20℃。

请问这个怎么过滤啊?
是不是这个过滤步骤是必须的?
是否可以不加DTT?

谢谢!
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请教楼主,ecl液冲洗膜的时间多久比较好,有的是冲一下即可,有的人要放好几分钟。请问这有什么根据吗

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ECL液冲洗膜式什么意思?
ECL孵育还是ECL孵育完成后把ECL洗去?
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楼主我近期做了两次WB,有一个共同的问题是转膜没转上,转后丽春红染色没有带,别人转的膜我一起染了有很清晰的带。我和别人用的不同的PVDF膜,不同的甲醇,不同的电泳仪。我的膜是bio rad的PVDF 0.2微米,一直保存在4度冰箱,有塑料袋包裹,不知道保存多长时间了,看盒子上也没有使用期限,没有保存温度。甲醇我用的是北京化工厂的,10块一瓶的,09年产。电泳仪我的比较低挡,以前是跑DNA电泳的,不能恒流,我是手动一直看着它维持电流在200mA左右,不稳,在190-210mA间浮动,我的蛋白30-40KD,转3h。蛋白上样量100ug,蛋白提的没问题,我跑过蛋白胶考染很漂亮。我的操作自认为问题不大,跟别人的一样,就算有瑕疵也不会造成完全转不上膜的情况。近两次WB丽春红染后虽然没带,有一次继续做免疫反应和曝光,没有任何着色。
通过我的这些描述,楼主你能指出我的问题在哪吗?

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用你同学的PVDF膜试试
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请教楼主:
凝胶转膜后,PVDF膜经封闭后,可以在4度放多长时间呢?还有怎样做内参呢,在什么情况下需要做内参?二抗的稀释度怎样测?二抗的说明书上的检测方法是dot/blot,不明白这是什么意思?谢谢前辈了

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dot blot你可以搜我以前的帖子,有详细的说明,需要用NC膜来做
PVDF膜封闭放置4度没试过
-20度半年没问题
如果你需要半定量的时候就需要做内参
内参怎么做方法同你目的蛋白的抗体孵育及检测
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请教楼主:

最近做western总出问题,一直在改善条件,最近又出新问题了,请教老师帮分析一下:
1 发光以后背景很高,好像是所有蛋白条带都有,目的条带强一些,可是图没法用,而且蛋白marker没有条带,但是在暗室可以看到目的条带,看不到发光MARKER,压片后很多非特异性的条带。
2 又做一次换了NC膜,转完膜整个膜都花了,有些地方膜上白色的东西掉了,像掉漆了一样,一片一片的,无法继续试验,是膜的问题还是其他问题?有人说是膜干了,但用之前用转膜缓冲液浸泡了10分钟的。电泳100伏45分钟浓缩胶,150伏70分钟跑分离胶,跑完胶上有9条预染MARKER的条带。转膜用300毫安120分钟,预染MARKER转到膜上了,很淡,但是用TBST漂洗后就掉了,会是什么原因呢?

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你用湿转还是半干转?
背景的问题与洗膜及二抗浓度太高有关
加大洗膜次数
降低二抗浓度
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想问下您知道dtt母液如何配制及保存条件吗?
做双向的时候要用

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2M DTT,MQ水配制
-20度分装保存
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请教一个关于2×SDS样品缓冲液的配制问题:

参阅《分子克隆实验指南》(第2版),配方如下:

100mmol/L Tris.HCl,pH 6.8
200mmol/L DTT(二硫苏糖醇)
4% SDS
0.2% 溴酚蓝
20% 甘油

书中提到不含DTT的缓冲液可室温保存,临用前加入1mol/L DTT贮存液。1mol/L DTT贮存液的配制方法:用20ml 0.01mol/L乙酸钠溶液(pH5.2)溶解3.09g DTT,过滤除菌后分装成1ml小份贮存于-20℃。

请问这个怎么过滤啊?
是不是这个过滤步骤是必须的?
是否可以不加DTT?

谢谢!

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常用的是还原电泳,需要用DTT,如果不用可以用beta-巯基乙醇代替
我一般都不过滤
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楼主最近得你的指点,弄明白了很多问题。再次感谢!这次我用脑组织提的蛋白做WB的actin,蛋白用BCA试剂盒定量,上样量分别是左65ug和右100ug。转膜完用立春红染色什么没有,然后继续做封闭1h,一抗1:400过夜,二抗1:4000两小时。加底物时看见右道光较明显,左道光很弱,但是有光。压片两次分别3min和30min,显影结果如图:3min的只能看见右道有黑点,大小在45附近差不多对,30min才勉强看到左道有浅浅的东西。后来考染膜的图像在右侧。请问:
1,我爆出来的椭圆形黑点是带吗?实验室有人说不是带,是背景,带应该是条形。
2,膜用立春红染没有带,后来考染有带是什么原因?是上样量少吗?可是我上了65-100ug不够多吗。
3,我在北方,长春,冬季很冷,暗室里也凉,这对底物反应和显色曝光有没有影响?明明左道有光却曝的极弱是什么原因?
4,看我考染的膜,条带不是很清晰,是转膜的问题吗?该怎么改进?
谢谢!


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