蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【讨论帖】western blot问题解答

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:【讨论帖】western blot问题解答

NBA[使用道具]
五级
Rank: 5Rank: 5


UID 75229
精华 6
积分 2497
帖子 4006
信誉分 114
可用分 20946
专家分 70
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
2111
 
楼主最近得你的指点,弄明白了很多问题。再次感谢!这次我用脑组织提的蛋白做WB的actin,蛋白用BCA试剂盒定量,上样量分别是左65ug和右100ug。转膜完用立春红染色什么没有,然后继续做封闭1h,一抗1:400过夜,二抗1:4000两小时。加底物时看见右道光较明显,左道光很弱,但是有光。压片两次分别3min和30min,显影结果如图:3min的只能看见右道有黑点,大小在45附近差不多对,30min才勉强看到左道有浅浅的东西。后来考染膜的图像在右侧。请问:
1,我爆出来的椭圆形黑点是带吗?实验室有人说不是带,是背景,带应该是条形。
2,膜用立春红染没有带,后来考染有带是什么原因?是上样量少吗?可是我上了65-100ug不够多吗。
3,我在北方,长春,冬季很冷,暗室里也凉,这对底物反应和显色曝光有没有影响?明明左道有光却曝的极弱是什么原因?
4,看我考染的膜,条带不是很清晰,是转膜的问题吗?该怎么改进?
谢谢!

==============================================

你用的是纯化后的蛋白吗?
考染的结果有点像纯化后的膜
不像是提取组织总蛋白的条带,我认为问题可能出现在这
你提的蛋白条带太少了
顶部
wood533[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 76132
精华 0
积分 863
帖子 1385
信誉分 100
可用分 7745
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-1
状态 离线
2112
 
dot blot你可以搜我以前的帖子,有详细的说明,需要用NC膜来做
PVDF膜封闭放置4度没试过
-20度半年没问题
如果你需要半定量的时候就需要做内参
内参怎么做方法同你目的蛋白的抗体孵育及检测

=====================================================

谢谢前辈的指点,已经放-20度保存了,准备慢慢的用来优化条件
顶部
wood533[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 76132
精华 0
积分 863
帖子 1385
信誉分 100
可用分 7745
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-1
状态 离线
2113
 
你用的是纯化后的蛋白吗?
考染的结果有点像纯化后的膜
不像是提取组织总蛋白的条带,我认为问题可能出现在这
你提的蛋白条带太少了

=============================================================================================================

我的蛋白就是组织提取的总蛋白,没经过纯化。我单独跑过蛋白胶考染,蛋白条带实际上是很多的,如图的前两道。转完膜就是这个样子,请问是什么原因?


查看积分策略说明
附件
2013-3-1 15:56
19791749.snap.jpg (18.92 KB)
 
顶部
NBA[使用道具]
五级
Rank: 5Rank: 5


UID 75229
精华 6
积分 2497
帖子 4006
信誉分 114
可用分 20946
专家分 70
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
2114
 
我的蛋白就是组织提取的总蛋白,没经过纯化。我单独跑过蛋白胶考染,蛋白条带实际上是很多的,如图的前两道。转完膜就是这个样子,请问是什么原因?

====================

1,膜过期没有
2,用什么转移体系?
3,转移条件
顶部
yonger[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 74174
精华 0
积分 572
帖子 803
信誉分 100
可用分 4861
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-7
状态 离线
2115
 
ECL液冲洗膜式什么意思?
ECL孵育还是ECL孵育完成后把ECL洗去?

==============================================================================================================

是ecl现象的时间,不是把ecl洗去。另外楼主请教您个问题,我要把b-actin蛋白制成0.25mg每ml的浓度 ,上样10微克,可actin得斑点总也出不来,请问是我的溶液配制的不对吗?我用1倍sample buffer溶解的b-actin。谢谢
顶部
gemei0115[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 76303
精华 0
积分 530
帖子 658
信誉分 101
可用分 4191
专家分 10
阅读权限 255
注册 2011-11-3
状态 离线
2116
 
请教楼主:

最近做western总出问题,一直在改善条件,最近又出新问题了,请教老师帮分析一下:
1 发光以后背景很高,好像是所有蛋白条带都有,目的条带强一些,可是图没法用,而且蛋白marker没有条带,但是在暗室可以看到目的条带,看不到发光MARKER,压片后很多非特异性的条带。
2 又做一次换了NC膜,转完膜整个膜都花了,有些地方膜上白色的东西掉了,像掉漆了一样,一片一片的,无法继续试验,是膜的问题还是其他问题?有人说是膜干了,但用之前用转膜缓冲液浸泡了10分钟的。电泳100伏45分钟浓缩胶,150伏70分钟跑分离胶,跑完胶上有9条预染MARKER的条带。转膜用300毫安120分钟,预染MARKER转到膜上了,很淡,但是用TBST漂洗后就掉了,会是什么原因呢?

你用湿转还是半干转?
背景的问题与洗膜及二抗浓度太高有关
加大洗膜次数
降低二抗浓度

谢谢楼主:
我用的是湿转。洗膜TBST洗10分钟3次。二抗1:5000稀释。


查看积分策略说明
附件
2013-3-1 16:01
75808267.jpg (49.66 KB)
 
顶部
huifeng0516[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 76210
精华 0
积分 552
帖子 783
信誉分 100
可用分 4731
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-2
状态 离线
2117
 

1 上面是改进后的图,背景太高,应该出现两条距离很近的带,可是基本分不清楚。以为条带很亮,只压片30秒,显影时一看到条带就定影大概20秒。请教老师,压片,显影,定影的时间一般是多久。如何调整好一些?
2 这次条带发光时间特别短只有1~2分钟就焠灭了,基本没时间调整,往常会亮十分钟左右,不知道是什么原因?
顶部
NBA[使用道具]
五级
Rank: 5Rank: 5


UID 75229
精华 6
积分 2497
帖子 4006
信誉分 114
可用分 20946
专家分 70
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
2118
 
请教楼主:

最近做western总出问题,一直在改善条件,最近又出新问题了,请教老师帮分析一下:
1 发光以后背景很高,好像是所有蛋白条带都有,目的条带强一些,可是图没法用,而且蛋白marker没有条带,但是在暗室可以看到目的条带,看不到发光MARKER,压片后很多非特异性的条带。
2 又做一次换了NC膜,转完膜整个膜都花了,有些地方膜上白色的东西掉了,像掉漆了一样,一片一片的,无法继续试验,是膜的问题还是其他问题?有人说是膜干了,但用之前用转膜缓冲液浸泡了10分钟的。电泳100伏45分钟浓缩胶,150伏70分钟跑分离胶,跑完胶上有9条预染MARKER的条带。转膜用300毫安120分钟,预染MARKER转到膜上了,很淡,但是用TBST漂洗后就掉了,会是什么原因呢?

你用湿转还是半干转?
背景的问题与洗膜及二抗浓度太高有关
加大洗膜次数
降低二抗浓度

谢谢楼主:
我用的是湿转。洗膜TBST洗10分钟3次。二抗1:5000稀释。

===================

你只上了一个样品吗?
顶部
NBA[使用道具]
五级
Rank: 5Rank: 5


UID 75229
精华 6
积分 2497
帖子 4006
信誉分 114
可用分 20946
专家分 70
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
2119
 
1 上面是改进后的图,背景太高,应该出现两条距离很近的带,可是基本分不清楚。以为条带很亮,只压片30秒,显影时一看到条带就定影大概20秒。请教老师,压片,显影,定影的时间一般是多久。如何调整好一些?
2 这次条带发光时间特别短只有1~2分钟就焠灭了,基本没时间调整,往常会亮十分钟左右,不知道是什么原因?

==================================

二抗浓度还是太高
荧光淬灭与HRP浓度有关,太高淬灭快
另外金属物质也容易造成这种现象
顶部
鸽子不哭[使用道具]
二级
Rank: 2


UID 73545
精华 0
积分 145
帖子 69
信誉分 100
可用分 1056
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-9-24
状态 离线
2120
 
你只上了一个样品吗?

==========================================================================================================

谢谢楼主:
1.扫描的时候片子是竖放的,上了8个样。有一个是对照,条带都出来了,就是不清楚,应该有两条的,发光时也可以看到两条,但是压片后就融合了,而且背景很高,条带不清晰。
2.封闭完了要洗膜吗?用TBST?
3.请教TBST与TBS在作用上有什么不同?什么时候用TBS?什么时候用TBST?
顶部