蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【讨论帖】western blot问题解答

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:【讨论帖】western blot问题解答

NBA[使用道具]
五级
Rank: 5Rank: 5


UID 75229
精华 6
积分 2497
帖子 4006
信誉分 114
可用分 20946
专家分 70
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
2351
 
请问制胶的时候胶老是不凝最常见的是什么问题?已经排除过硫酸铵。

==========

温度
APS
TEMED
顶部
NBA[使用道具]
五级
Rank: 5Rank: 5


UID 75229
精华 6
积分 2497
帖子 4006
信誉分 114
可用分 20946
专家分 70
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
2352
 
老师您好,请教个问题
最近我们的western blot 配胶 ,4度过夜,第二天加marker,发现,电泳过程中,marker逐渐消失,从大分子量到小分子量逐渐消失的,不知道您遇到过这种情况没?请指点
我们更换了电泳液,重新定制了AA胶,或者自己配置tris,换了进口的电泳槽,这些方法都实验过了,但是仍然没有改善,不知问题出在哪里了。

=============

marker降解
顶部
NBA[使用道具]
五级
Rank: 5Rank: 5


UID 75229
精华 6
积分 2497
帖子 4006
信誉分 114
可用分 20946
专家分 70
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
2353
 
版主您好,我想问一下,蛋白分子量是44KD和89kD到转膜恒流300mA要转多长时间。

==============

1h for 44K
1h30min for 89K
顶部
NBA[使用道具]
五级
Rank: 5Rank: 5


UID 75229
精华 6
积分 2497
帖子 4006
信誉分 114
可用分 20946
专家分 70
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
2354
 
竹你好,我最近做的western blot结果很不理想,结果见图,上面是我的蛋白170kd,下面是内参GAPDH,上面的条带明显都散开了。
我的条件是10%的胶,先80V跑,再换120V跑。湿法转膜恒流350mA,90min。脱脂奶粉封闭2h,后孵一抗摇2h后放冰箱4℃过夜,洗膜后二抗稀释5000倍孵一小时,然后停电了我就让他在室温静置了4个多小时,然后手震荡洗膜1个多小时。
由于是新手,很多问题还不明白,望斑竹不吝赐教啊,谢谢!

===========

什么蛋白?
抗体呢?
顶部
NBA[使用道具]
五级
Rank: 5Rank: 5


UID 75229
精华 6
积分 2497
帖子 4006
信誉分 114
可用分 20946
专家分 70
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
2355
 
我在做western的时候,遇到了一个问题,希望老师能够给予帮助,我在这里先谢谢了!
我提的是小鼠肿瘤组织的蛋白,想考察三种蛋白,VEGF,P53,HIF,在显影的时候就发现,无论我的一抗是什么,都会在50-70Kd之间出现三条带,而且强度要高于我的目标条带,P53条带自然也就看不到了,被掩盖在里面了。我想问一下老师,这个是怎么回事啊?有遇到过这个情况的吗?
我附的图上面很浓的几条就是我不知道的条带,下面的是我的目的条带。
这个倒是可以剪下来,但是P53的条带刚好在那个区间里面,就没法做了,请老师指教。

===============

样品被污染了?
顶部
NBA[使用道具]
五级
Rank: 5Rank: 5


UID 75229
精华 6
积分 2497
帖子 4006
信誉分 114
可用分 20946
专家分 70
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
2356
 
请问一下
我做的是Cyclin E、CDK2和p21三个蛋白
12%的胶80v跑到溴酚蓝到最底部
Cyclin E Bio-Red半干转膜仪30min 0.45um PVDF膜
CDK2 半干转膜20min 0.45um PVDF膜
p21 半干转膜10min 0.22um PVDF膜
试过很多条件预染MARKER 很清楚的转过去了
考染转完的胶也基本上没剩下多少东西
一抗都是CST的推荐配比1:1000,室温孵育1-2h,4度过夜
二抗CST的抗兔1:1000;SC的抗鼠1:2000,室温孵育1-2h
TMB显色
Cyclin E 可以看到一些模糊的、不清楚的条带
其他两种蛋白只有一些背景完全看不到条带
一抗的配比最高试过1:600也没有什么改善
麻烦楼主帮我分析一下吧
谢谢

==============================

TMB敏感性要稍差
建议换ECL或者其他更加敏感的方法
延长转膜时间
顶部
ero11[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 75131
精华 0
积分 684
帖子 1028
信誉分 100
可用分 5953
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-19
状态 离线
2357
 
1.mTOR(250KD左右)和p21 半干转(PVDF膜)的转膜条件,每平方厘米XX毫安是要根据膜的大小计算一下电流值吗,例如1*5cm 要多大电流?
2.如果转膜时间长,pvdf膜甲醇激活多长时间合适,滤纸可以多垫几层吗?
3.分离胶mtor用8%,p21 用12%(还是用15%好些?)可以吗?
4.未染marker 丽春红染色能看否看见
谢谢!!!
顶部
abc816[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 77362
精华 0
积分 775
帖子 1190
信誉分 100
可用分 6817
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-16
状态 离线
2358
 

你好,我刚刚开始跑western,用RIPA提的总蛋白,BCA法测定在5ug/ul左右,上样50ug,8%分离胶电泳,恒压110V电转NC膜,配方是tris3g,甘氨酸14.4,甲醇200ml,定容1000ml,marker非常清晰,然后5%牛奶封闭RT2h,一抗1;1000 4°过夜,二抗1:2000 RT1h,然后用碧云天的ECL孵育曝光。36KD的GAPDH加上ECL后很快产生荧光,但是用保鲜膜包裹后发现荧光变弱。同样操作条件下,GAPDH的条带很强,10s就可以,但是56KD,120KD,142KD的目的蛋白从来没出现过(即使曝光10min也没有条带,56KD的曾用Thermo的发光液出现过一次,但是不太好)。
问题:
1.抗体浓度太低会不出现条带,而太高也会没条带吗?
2.发光液对结果影响很大吗?对于难检测的蛋白是不是灵敏度越高越好(比如GE Advanced ECL)?
3.孵育1抗2抗的时候,用的是铝制小盒,会不会对蛋白造成影响?
4.某个发光液的说明书上说,曝光可以长达1~10h,对于表达量很低的蛋白可以很好的显影,这样说有没有道理?
5.一抗是鼠单抗的,写着抗“哺乳动物”或“未在其他物种测试过”,除了可以用在人的蛋白检测之外,是否可以用在其他物种?比如,兔?
6,对于100KD以上的蛋白,电转时可否用乙醇代替甲醇?延长电转时间是否会效果好点?是否有更好的电转液配方适合100KD以上的大蛋白?
7.如何避免ECL荧光的迅速淬灭?
谢谢
顶部
98776langtao[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 74068
精华 0
积分 275
帖子 290
信誉分 100
可用分 2191
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-4
状态 离线
2359
 

楼主您好。我的条带跑出来宽窄不一,我搜了一下论坛,有人说跟样品的盐离子浓度有关系,楼主能否解释一下这其中的道理,还有如何降低样品盐离子浓度呢?谢谢
顶部
yonger[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 74174
精华 0
积分 572
帖子 803
信誉分 100
可用分 4861
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-7
状态 离线
2360
 

老师,你好。最近做SRC1 ABCAM的抗体 上面介绍的 SRC1的分子量为160 但是说条带出现在200处 这是什么原因啊 做这个大分子量的蛋白 条件是什么啊 转膜液有什么要求 谢谢!
顶部