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标题:【讨论帖】western blot问题解答

loli[使用道具]
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各位战友,本人也是初做western,做了几周都没有结果。
转膜没有问题,丽春红染色显示有条带。一抗稀释比是1:100-1000,1:400,1:200,都用了,二抗说明书上说1:5000-10000,我用了1:500的时候才把内参做出来。但以后作别的基因二抗的这个稀释比又做不出来了。western不但没有条带连背景都没有,胶片上光光的,什么都没有,不知道这是什么原因呢?急,烦请高手指点!!!
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jujuba[使用道具]
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最近在跑目的蛋白96kD大小的蛋白,但是每次都是在marker的120kD的位置发现条带
请问——
目的蛋白的位置和marker的位置不一致是怎么回事?
在120kD位置的条带会不会不是我想要的目的蛋白啊?
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jujuba[使用道具]
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请问一下,如果我提取的蛋白浓度比较高,想要稀释的话,是不是必须在变性前稀释?

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用什么稀释??PBS还是什么啊?
谢谢您!
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老师您好,我是一边看您前面的解答一遍结合我的情况提问题,因此可能问题比较多,也组织的不好,请您见谅!
我最近做睾丸组织bax 21kd bcl-2 26kd蛋白,一直没做出来,请教。
制样时,一半的组织是-80℃保存半年后制样,一半的组织是新鲜组织-80℃保存一个星期后制样。将组织从-80℃拿出,取小块,称重,放入玻璃匀浆器,一般5-8分钟,然后加裂解液。
上海生工RIPA裂解液ii(PL006),1:5加入,带有蛋白酶抑制剂,但没加PMSF,玻璃匀浆器冰上匀浆20次,冰上放置60min等起裂解。12000g×30min 4℃离心。上清上层有一层白色的物质,好像是油脂,取上清时没管它,吸到了就吸到了。
(注:问题同dxyjy wrote:另外,蛋白提取时有絮状物,14000rpm*60min或30min都不能沉淀下去。我是35mm的一瓶细胞加1ml RIPA和10ul PMSF,操作严格按说明书进行,提很多次了,都这样,别人也用同一瓶试剂,都没有这种情况,会不会是蛋白的问题导致了WB结果这样呢?)
BCA法测蛋白浓度为8-12微克/微升。分光光度计测量。
100微升分装-80℃保存,使用时拿出加上样缓冲液,100℃4min,4℃保存。一般使用4-5次。
上样量10微升。胶的厚度为0.75mm。
我一般用5%浓缩胶,12%分离胶,跑胶。
转膜缓冲液为:tris 3g 甘氨酸 14.5g 甲醇200ml 蒸馏水800ml
bio-rad basic机器。
PVDF膜。0.45孔径。
以下为摸条件时,转膜后胶考染图片。
转膜恒压25V,电流35-43mA。在转移缓冲液中平衡15-30min。由于没有海绵,三明治两边全用滤纸夹。
上排15%胶,从左至右转膜时间0min,40min,40min,60min。
下排12%胶,左至右转膜时间0min,20min,40min,60min。
膜丽春红染色后都有条带。
此后用一直用12%胶,25v左右,55min左右转膜。
3%BSA PBST封闭1h,其中吐温20含量 0.5%。
一抗为博士德兔抗大鼠的多抗稀释比例1:100稀释,(推荐稀释比例1:100-1:400)室温孵育2h,(5月份的室温)
PBST洗膜10min×3次。
博士德进口分装二抗1:2000或1:3000稀释,(推荐稀释比例1:3000-1:6000)
PBST洗膜10min×3次。
ECL曝光1min。吉泰买的thermo ECL。内参和hsp70滴上去10几秒就发光了。
bax无条带,bcl-2二抗1:2000稀释时出现4个条带,1:3000时无条带。图在下面。

用同样步骤,做actin、GAPDH内参,转膜时间加40min,其他相同,内参各做3次,曝光良好。
同样转膜电压调为40v,电流36mA转膜时间90min做HSP70也能做出来。actin、GAPDH,HSP70一抗二抗都来自博士德。
我自己总结认为可能的问题1、样品,可能要做的蛋白含量较低。
2、转膜时间,浏览园子里其他战友类似大小蛋白一般都用80-100v转膜1h,和我的和不一样。是不是由于胶的厚度不同导致的。
3、一抗问题,也许要换好的一抗。
呵呵,现在郁闷得很,希望你能帮我看看可能有什么问题。
谢谢!

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要说几点
1、先把蛋白SDS-PAGE做好
2、用ECL检测二抗的稀释度
3、最后考虑一抗
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接上面由于不知如何同时传两张图,只好分两次传。
这个是总蛋白的条带,用10%胶跑的,上样从左至右10,8,5微升
接着问:是不是就算总蛋白条带有,有些条带弥散是不是蛋白降解了?这个条带是不是跑的不好,上样量大了是不是也会导致蛋白爆不出来?
谢谢!

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5ul的上样量都已经大了
这几天我在做Bax与BCl-2
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接着问:For Western blot analysis,200μg of protein was resolved on a 12% SDS polyacrylamide gel at 160V in a Mini-Protean II Cell(Bio-Rad).
睾丸样品200微克的上样量做出如下的图 说明目标蛋白的丰度是高还是低?

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200ug才这样的效果啊!
已经超出SDS-PAGE的分辨率了

我用20ug做
结果还不错
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这个是我用1:2000二抗时爆出的条带,呵呵不是很好看。内参还有,但左边bcl-2那边都是杂带,看不出目标抗体,右边而bax似乎看见条带发光,但是曝光时就淬灭了。
二抗体为1:3000时就暴不出bax那样的条带了。

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抗体是那一家的?
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最近在跑目的蛋白96kD大小的蛋白,但是每次都是在marker的120kD的位置发现条带
请问——
目的蛋白的位置和marker的位置不一致是怎么回事?
在120kD位置的条带会不会不是我想要的目的蛋白啊?

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请参考抗体说明书
分子量位置有出入是很正常的
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各位战友,本人也是初做western,做了几周都没有结果。
转膜没有问题,丽春红染色显示有条带。一抗稀释比是1:100-1000,1:400,1:200,都用了,二抗说明书上说1:5000-10000,我用了1:500的时候才把内参做出来。但以后作别的基因二抗的这个稀释比又做不出来了。western不但没有条带连背景都没有,胶片上光光的,什么都没有,不知道这是什么原因呢?急,烦请高手指点!!!

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换二抗或者ECL
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老师 关于那个marker 转上去了 而目的蛋白没有转上去是不是和上样量有关系 我做的是94KD的蛋白。。。是不是上样量要大一些。。。

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转膜条件呢
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