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标题:【讨论帖】western blot问题解答

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请教高手楼主一个问题,我最近用的一个抗体,蛋白质的分子量是15kDa,做了两次都发现不在15kDa的范围内出现,而是在140kDa,很是迷惑,对应Marker的15kDa处非常干净,希望高手多多指教,真是愁死我了
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tuuu2[使用道具]
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请教版主:因为western是目的蛋白与内参的半定量比值,那假如我从肝组织中分离某种细胞,如果该细胞的目的蛋白的半定量值与同一肝组织的目的蛋白半定量值相差很大的话,是否可以说该目的蛋白可能还在肝组织的其他细胞上有表达呢?
说的比较啰嗦,谢谢了!
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S6044[使用道具]
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会不会是蛋白降解了?我最近也遇到这种问题,突然就再也做不出来了,不知道是不是和我蛋白多次在室温融化有关,多多交流啊
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你好,我刚开始接触实验室,懂得很少。
我想问的是:做wb实验时,每个实验组需要有多少条带,才有统计意义。
如果仅仅定性又需要多少呢。
谢谢
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49888[使用道具]
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谢谢版主回复
我是因为做wb 一直做不出来
考染和丽春红染都是35以下没有条带
所以怀疑样品蛋白含量低,想做浓缩
我的样品室脊髓,每个只有大概三毫米长,
想请问具体如何浓缩

下边的网址为我做的染膜和胶,刚开始做的不清晰不好看
后来做的清晰的好看一些的结果也和发的差不多,都是35以下没有条带,我做内参(40多)能做出来,目的蛋白35和14,17做不出来。
cuturl('http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=65&id=17281809&sty=1')
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楼主你好,本人最近作western发现电泳时条带不是压成一条线,而是很宽,请您分析一下原因,以前我做好像不是这样的。谢谢
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谢谢老师的回答,具体地说我是要提取人血液标本的蛋白做SOD1的WB,老板只是这样说的,没有其他要求,按你的意思是离心取血清,用PBS稀释一下,加上样缓冲液煮沸就可以做了,是么。。。
不用提取血细胞里的蛋白咯?

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不用提取血细胞蛋白
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最近western原来很容易出来的蛋白却都是白板;
一抗,有很多种抗体,但都是白板,一些做免疫荧光试了一下能出来,应该不是一抗的问题
二抗,新买的,也有借别人的,只有actin杂出来带,1分钟就淬灭了
奶粉,伊利的脱脂高钙奶粉,以前用得很好,最近出现问题后看奶粉过期了,换了新的还不行
ECL,pierce的,康为的,借的别人的millipore的效果都一样
测了TBST的PH值,7到8之间
显定液,直接爆了光的一下就显黑,说明都没问题

现在的问题是,出不来条带是什么造成的?哪位高人遇到这种情况过?怎么解决的?要被逼疯了

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1、做免疫荧光没有问题并不说明一抗就没有问题,一抗的保存条件是否得当
2、淬灭与ECL,二抗浓度、膜是否污染等有关
3、样品呢?
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转膜及跑胶应该不成问题,预染的marker转的很漂亮,同样条件原来很容易出来的现在却死都不出来,这是为什么呢?

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用丽春红等染色后再确定转膜有没有问题!

在进行WB前先对蛋白电泳后的SDS-PAGE进行染色观察样品
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老师您好!
最近做WB遇到很多问题,想请老师帮忙解答:
我做小鼠小肠H2AX 17kd和Ku70+ku80,之前用10%的胶,觉得ku70和80的两条带距离太近,H2AX的带又很粗而且连成线,后来改用15%的胶做H2Ax,8%的胶做ku70+ku80。蛋白浓度4ug/ul,上样量8-12ul都试过。电泳60V 30min,100V 45min,转膜用半干转,18V 30min,转ku时也用过20V 45min。一抗都是abcam的,H2Ax 1:1000,ku 1:600(推荐1:300-1000),二抗1:1000,抗体都用1%BSA-TBST稀释。

我的问题是这样的:
1.用8%的胶后ku就没做出来,其他条件都没变,近两次H2Ax也没条带了,丽春红染是有带的,但70、80分子量处一直都不明显。抗体一般会重复用3-4次,可以前用过1个月还能出条带的,大约5cm2大小的膜敷1.5ml抗体。是重复用抗体的原因吗?可以用10%的胶做ku吗?
2.actin曝光出的条带都像方括号一样连在一起,而且中间泳道条带粗,两边细,因为目的蛋白条带也是两边泳道的细,以至于不能确定是真的连actin表达量都低了还是电泳的原因。这和电泳槽电压有关吗?而且开始跑时内槽会缓慢漏液,漏一段时间就停了,我需要中途暂停补加电泳液。条带连线我也怀疑过上样量的问题,但ku蛋白的条带很细,我怕上样少了ku的做不出来,如果不在同一块胶上跑又怕结果不可靠。
3.H2AX有的表达比actin强很多,条带连线,有的很弱,上样量怎么控制呢?
4.转膜条件可以吗?H2AX的膜7.5*3cm大小,ku的7.5*2cm,是不是这样的条件对于ku的效果不太好?
5.在浓缩胶中跑大概10min左右时就会有一些样的溴酚蓝从孔下边的角漏出来,漏到浓缩胶和分离胶的界限为止,速度很快,而且并不沿泳道往正下方漏,而是随意的方向,漏的孔和样也是随机的,但都漏过,随着样进入分离胶后,那些漏出来的溴酚蓝也跟着一起被压入分离胶了。因为目的蛋白是核蛋白,我用的是RIPA裂解液,每次提蛋白时都会有胶状的DNA,我已经尽可能少吸DNA了,但是不能完全避免。这些漏出来的会不会是DNA在作怪呢?浓缩胶我一般会凝3h的,应该能凝好啊
另外附上曝光的图片,第一张是actin的,第二张是ku的,最后是H2AX的,希望老师能帮忙解答!谢谢!

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1、8%的胶分离70-80效果要好于10%
2、重复3、4次,里面的BSA还没坏?
3、actin像括号是因为上样量太大,另外是转膜后抗体孵育不完全造成两边细
4、上样量控制的看预实验条带啊。。。
5、转膜我没用过恒压
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