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标题:【讨论帖】western blot问题解答

wood533[使用道具]
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楼主,最近做WB发现位置不对。本来90kD大小目的蛋白跑到120kD的位置,不知道怎么回事,请教一下。谢谢!

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1、marker有可能不准,不要相信marker一定就准
2、不同胶浓度marker的表观位置是不一样的
3、目的蛋白会有修饰等变化,分子量会发生改变
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wsll[使用道具]
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楼主,你真的很牛啊!
我今天才发现,目的蛋白糖基化后被修饰而改变大小,但是,我怎么去证明被糖基化了呢?目的蛋白是膜蛋白!
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NBA[使用道具]
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楼主,你真的很牛啊!
我今天才发现,目的蛋白糖基化后被修饰而改变大小,但是,我怎么去证明被糖基化了呢?目的蛋白是膜蛋白!

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这个我就不太懂了
建议你看看相关蛋白糖基化方面的文献
我记得有一本书好像名称是糖基化蛋白
你可以搜搜看
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66+77[使用道具]
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如果用WB来检测
完全没有必要用膜提取试剂盒来提取蛋白
你做什么蛋白?

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大麻素受体
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yonger[使用道具]
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楼主你好啊:
这里很热闹啊!我是做western blot的新手,已经做了一个月了,前面的蛋白提取、电泳转膜都没问题,我转膜后都用丽春红染色了,转莫很好。我的上样量是40ug,蛋白浓度差不多都是4-6ug/ul。转膜之后5%脱脂奶粉封闭室温1h,一抗是abcam的原装抗体,比例是1:1000(兔多克隆),4度过夜,次日洗膜TBS10分钟*3次,二抗(抗兔)1:6000室温1h,洗膜TBS10分钟*3次,配制发光液,但是整张膜都在发光,也可以看到目的条带在发光,我改怎么调整啊!做了很久了,很苦恼啊!我也怀疑是没洗干净,或封闭不好,但是别的蛋白也是这么做的,没出现这种情况,为此我每次洗膜的时候倒很多TBS,封闭的时候也用很多脱脂奶粉,还是这样啊!
注:抗体没问题,都是新买的
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yonger[使用道具]
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老师您好:
我在做脑组织膜蛋白,western .一直都没有做出来,之前做细胞系,小肠的全都做出来了,可脑组织的就是做不出来,不知道脑组织膜蛋白提取与其他部位有什么不同,特殊的么?非常感谢!
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yapuyapu[使用道具]
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您好,我这段时间一直在做WB,但是一直没有做好,所以想向您请教几个问题,还麻烦您能给予指导:
1,我的目的蛋白在50到65kb之间,我用的胶是12%,跑胶时的电压分别是:浓缩胶100v,分离胶80v,大概一个半小时跑完,我的这一步的问题是:我的蛋白marker跑胶之后,条带很淡,而在别人的电泳装置上,用我的marker,跑的却比较好,不知何故?
2,转膜:我用的半干转,我原来用的电流是35mA,1小时20分钟,现在用的是50mA,50min,一抗稀释比1:5000到10000,我的问题是:转膜时,我本来就很弱的蛋白marker条带,转到膜上更少,最后发光显影时,条带现在很弱。是不是我转膜的时间和电流不够啊,我想问楼主半干转时转膜的时间和电流多少为宜啊?
十分的感谢!
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summerxx[使用道具]
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高手如云啊!现在也在做WB,遇到很多问题,会经常来向大家请教的,呵呵
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老师,你好。请教下。我最近做了很多次。总是效果不好。我把我的条件说下
1.目的蛋白是HIF-a。130kd
2.浓缩胶的浓度为5%,分离胶为8%。胶的厚度为1mm。上样量为30ul
3.浓缩胶时电压120V,分离胶180V.跑到最大的MARKER 170KD到分离胶后我就停了,大约为210min
4.转膜是湿转,膜为PVDF(孔径不太清楚,好像是0.2的)用的BIO-RAD transfer,300mA横流转250min.
5.封闭液为5%的脱脂奶粉,37°封闭2h
6.一抗为SIGMA的,用TBST稀释,1:200. 4°过夜
7.二抗是SIGMA的,用TBST稀释,1:200,37°2个小时
8.显影液为碧云天的ECL。显影时间为1min
9.每次洗涤用TBST 3*10MIN
10.抗体是重复使用的(我老板告诉我,他在美国的实验室一抗可以用3个月、二抗可以用一个月,所以只能重复使用啦)
出现的问题是
1.在MARKER 130KD处的那个条带很模糊或者看不到,在75KD左右出现2条带,这两条带很浓密而且每条都连成一条线。
2.背景很高,有时候刚好把条带遮住,我相当的郁闷。
3.降低二抗的浓度,有可能显影后没有条带

我想问的问题:
1.为什么 130KD处的那个条带很模糊或者看不到,在75KD左右出现2条带,这两条带很浓密而且每条都连成一条线?是弥散还是甚么问题?
2.湿转何如知道多少分子量要用多少的电流转多久?
3.湿转是不是很容易使蛋白弥散?
4.如何调整抗体的浓度及比例?
5.对ECL如何使用才能得到好的结果?

麻烦老师帮我解答下。万分感谢!
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老师您好:
我在做脑组织膜蛋白,western .一直都没有做出来,之前做细胞系,小肠的全都做出来了,可脑组织的就是做不出来,不知道脑组织膜蛋白提取与其他部位有什么不同,特殊的么?非常感谢!

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小肠也是组织啊
脑组织蛋白的提取没什么特殊的要求
同小肠组织蛋白提取
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