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标题:【讨论帖】western blot问题解答

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QUOTE:
原帖由 hot_hot_hot 于 2013-3-7 15:45 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
你好,我有两个问题请教一下
1.我的WB重复性很不好,同样的条件,这一次很容易就能做出来,而下一次却怎么也做不出来,这期间试剂、抗体浓度、时间都没有改变,转膜完了立春红染色条带也很好,请问是怎么回事儿呢?

2.我的目的蛋白 ...

电泳完成后染过胶吗?
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hot_hot_hot[使用道具]
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没有染过,有什么问题么?
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xue258[使用道具]
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回答楼上的问题:
1.我们做western的重复性都很好,很稳定,但是我相信只要是实验条件一样的话,应该是经得起重复的。
2.关于跑胶的问题,本实验室的条件是先100伏跑十分钟,然后加大电压到160,一直跑到底。这样做的目的是使sample跑胶时在同一水平。还有就是sample之间蛋白量要严格一致,这点要注意。
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zhenxin[使用道具]
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称取组织重量后,在冰上把组织剪碎
加入裂解液用电动匀浆器等匀浆,干嘛用超声???
如果提取出来的粘稠,可以用DNase I或者超声短暂处理一下
380K蛋白可以用梯度胶做

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版主您好,匀浆的方法又提了蛋白,感觉还行,因为没有配梯度胶的仪器,还是用的4%浓缩胶和7.5%分离胶,但是380kd的versican还是做的不行,曝光要么有时能出带,但是感觉像是在点样孔的位置,因为我的浓缩胶基本上没切,只把竖条切了,怀疑是非特异;要么什么都没有。
曝完光之后,用立春红染了膜,虽然有带,但是好像是在点样孔以及浓缩胶与分离胶的界线处,是不是这些位置经常会出非特异的带呢?谢谢
还有一个小问题:转膜的时候选择稳压或者稳流有什么区别么?在什么情况下选择什么条件呢?谢谢
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1.我们做western的重复性都很好,很稳定,但是我相信只要是实验条件一样的话,应该是经得起重复的。
2.关于跑胶的问题,本实验室的条件是先100伏跑十分钟,然后加大电压到160,一直跑到底。这样做的目的是使sample跑胶时在同一水平。还有就是sample之间蛋白量要严格一致,这点要注意。

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谢谢你的答复

1.我的WB的条件没有变动过,每次都按一样的条件进行的,而且做的过程中也仔细观察,就是为了防止出现什么意外;
2.我们实验室WB跑胶一直用的是恒流的方法,20mA跑10min左右,然后25mA到底这样子的
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831226[使用道具]
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版主您好,匀浆的方法又提了蛋白,感觉还行,因为没有配梯度胶的仪器,还是用的4%浓缩胶和7.5%分离胶,但是380kd的versican还是做的不行,曝光要么有时能出带,但是感觉像是在点样孔的位置,因为我的浓缩胶基本上没切,只把竖条切了,怀疑是非特异;要么什么都没有。
曝完光之后,用立春红染了膜,虽然有带,但是好像是在点样孔以及浓缩胶与分离胶的界线处,是不是这些位置经常会出非特异的带呢?谢谢
还有一个小问题:转膜的时候选择稳压或者稳流有什么区别么?在什么情况下选择什么条件呢?谢谢

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找到了:
“鬼带”就是在跑大分子构象复杂的蛋白质分子时,常会出现在泳道顶端(有时在浓缩胶中)的一些大分子未知条带或加样孔底部有沉淀,主要由于还原剂在加热的过程中被氧化而失去活性,致使原来被解离的蛋白质分子重新折叠结合和亚基重新缔合,聚合成大分子,其分子量要比目标条带大,有时不能进入分离胶。但它却与目标条带有相同的免疫学活性,在WB反应中可见其能与目标条带对应的抗体作用。
处理办法:在加热煮沸后,再添加适量的DTT或Beta巯基乙醇,以补充不足的还原剂;或可加适量EDTA来阻止还原剂的氧化。
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您好,请教个问题
我要跑凋亡相关的蛋白,提取细胞蛋白时一定要收集漂浮细胞吗?
原先做时都是去上清,pbs洗后,加裂解液用刮刀刮的
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我想请问:
1.可否试着在8%的胶跑两个蛋白:127、37KD?湿转的转膜条件怎样较好?
2、电泳液、电转液一般用几次就要更换?如何判断失效不能用?
3、如何判断一抗是否失效?
4、曝光时,发光液加在PVDF膜上,是否一定要区分膜与凝胶接触的那一面?加完发光液是否要等待几分钟再压片?若压片十分钟后条带很淡,可否再压新片至三十分钟,条带会否浓些?

恳请指教,谢谢!
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NBA[使用道具]
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版主您好,匀浆的方法又提了蛋白,感觉还行,因为没有配梯度胶的仪器,还是用的4%浓缩胶和7.5%分离胶,但是380kd的versican还是做的不行,曝光要么有时能出带,但是感觉像是在点样孔的位置,因为我的浓缩胶基本上没切,只把竖条切了,怀疑是非特异;要么什么都没有。
曝完光之后,用立春红染了膜,虽然有带,但是好像是在点样孔以及浓缩胶与分离胶的界线处,是不是这些位置经常会出非特异的带呢?谢谢
还有一个小问题:转膜的时候选择稳压或者稳流有什么区别么?在什么情况下选择什么条件呢?谢谢

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1、7.5%的胶marker你跑到什么位置?
2、最好把浓缩胶切掉
3、稳压与稳流都有人采用,我用稳流,取决于实验室及个人的习惯
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NBA[使用道具]
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您好,请教个问题
我要跑凋亡相关的蛋白,提取细胞蛋白时一定要收集漂浮细胞吗?
原先做时都是去上清,pbs洗后,加裂解液用刮刀刮的

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贴壁还是悬浮细胞?
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