蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【讨论帖】western blot问题解答

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:【讨论帖】western blot问题解答

owanaka[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 76900
精华 0
积分 395
帖子 510
信誉分 100
可用分 3337
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-10
状态 离线
4821
 
你好,我是第一次做WB,要做人肝癌的p16,p16蛋白分子量是16KD,想问问有做过的么,选用什么一抗比较好?内参选什么?非常感谢

====================================

一抗进口还是所谓国产(or 国内分装)?
内参选择beta-actin,GAPDH等都可以
顶部
owanaka[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 76900
精华 0
积分 395
帖子 510
信誉分 100
可用分 3337
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-10
状态 离线
4822
 
请问为什么我的内参会跑成这样呢?蛋白上样40ug,10%分离胶,5%浓缩胶,80v,110v电泳,电泳液新配的。谢谢!

=========================================

把你跑完SDS——PAGE后考染的胶图放上来看看
顶部
owanaka[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 76900
精华 0
积分 395
帖子 510
信誉分 100
可用分 3337
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-10
状态 离线
4823
 
老师,我们做未知大小蛋白的western blot,预测大小在160kd-220kd之间,老师可以提供电泳和转膜的电压,时间条件么,师姐师兄们说大蛋白不好跑的,需要注意些什么呢?使用设备是北京六一的

==============================

转膜:300mA 恒流,2h至2h30min
顶部
owanaka[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 76900
精华 0
积分 395
帖子 510
信誉分 100
可用分 3337
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-10
状态 离线
4824
 
请问,多次重复western blot如下步骤,除了内参,其余指标均无任何成像,漆黑一片。请问到底哪里出问题了?急需大家帮助,谢谢!我做的是SD大鼠脑组织
1)12%+5%的sds-page胶,组织上样50ug。
2)电泳60V至彩虹maker条带初步分离,改100V至样本跑至底部。
2)转膜:采用湿转。70KD以下小分子量蛋白转膜58分钟,70KD以上大分子量蛋白转膜88分钟。转膜中散热良好。转膜后用考马斯亮蓝染page胶,仅剩少量蛋白。
3)封闭:用碧云天封闭液室温摇床封闭2.5-3小时。
4)一抗孵育(没有剪PVDF膜):所有抗体均为cell signaling technology公司进口原装产品,用碧云天一抗稀释液或者脱脂奶粉1:500—1:1000稀释一抗(NF-KB、IKB、p-IKB、TLR4,抗兔),4℃摇床孵育过夜(约12h)。
5)洗涤:TBST洗涤三次,时间均为10分钟。
6)二抗:BioRad公司进口原装,二抗室温孵育50分钟。
7)洗涤:TBST洗涤三次,时间分别为10分钟、10分钟、15分钟。
8)成像:碧云天显影液A+B显影,强曝12分钟。
9)结果:4个指标均无任何条带显示。
10) 用丽春红染料染pvdf膜,无论大分子还是小分子蛋白,膜上条带清晰。

==============================================

1、弃用碧云天的一抗稀释液,自己配制封闭及一抗稀释液
2、TBST是你自己配制的还是买现成的?
3、把你的内参图放上来看看
顶部
bring[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 74282
精华 0
积分 597
帖子 914
信誉分 100
可用分 5326
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-9
状态 离线
4825
 
前辈,实验有进展了,电泳及转膜都没有问题,内参跑出来了。但是背景有些高,二抗用了开始用的1:5000,改为1:7500还是有些高。另外做了一个目的蛋白但不知为什么同样条件下目的蛋白背景更高,似乎有了目的条带,但背景太高,不好区别,不知道是什么原因。望老师指点。
顶部
NBA[使用道具]
五级
Rank: 5Rank: 5


UID 75229
精华 6
积分 2497
帖子 4006
信誉分 114
可用分 20946
专家分 70
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
4826
 
前辈,实验有进展了,电泳及转膜都没有问题,内参跑出来了。但是背景有些高,二抗用了开始用的1:5000,改为1:7500还是有些高。另外做了一个目的蛋白但不知为什么同样条件下目的蛋白背景更高,似乎有了目的条带,但背景太高,不好区别,不知道是什么原因。望老师指点。

=============================

二抗改用1:10000及1:20000试试
ECL用的是什么公司的?
顶部
xue258[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 75643
精华 0
积分 746
帖子 1171
信誉分 100
可用分 6696
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-26
状态 离线
4827
 
转膜条件基本可以
一抗与二抗浓度均较高
建议:先做二抗的稀释度(同时不同的ECL均需检测)
用点杂交
用1倍TBS或PBS稀释二抗
做不同的梯度
比如1:1000,1:2000,1:4000
稀释好后各取1ul点在NC膜上
RT干燥
加发光液
曝光
确定二抗的合适稀释度

下一步
做一抗的稀释度
一抗也可以做几个不同的稀释度来摸条件
转膜后把膜剪成小条,加不同的稀释度的一抗
孵育进行后续步骤

good luck

==========================================================================================================

楼主你好!最近换了个二抗,结果就很不好看了~看了楼主的帖子,我也打算摸一下现在的二抗。我用的是PVDF膜,那如楼主所说要做二抗梯度的话,PVDF膜要预先泡过甲醇活化了之后再加稀释好的二抗,然后室温干燥之后再加发光剂吗?谢谢!
顶部
fox_79[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 76205
精华 0
积分 546
帖子 691
信誉分 100
可用分 4423
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-2
状态 离线
4828
 

请教一个问题:我做电泳,电泳缓冲液新配,配方如下:

10 X 电泳液(pH8.3)

Tris-Base 30g,Glycine 144g, 溶于700 ml 蒸馏水,调pH 至8.3;

加入10% SDS 146 ml,蒸馏水定容至 1000 ml。
稀释之后电泳时,感觉电流很大,120V恒压时达到70mA左右,前几天做的时候,电流才15mA左右,请问高手这是否有问题?谢谢!
顶部
fox_79[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 76205
精华 0
积分 546
帖子 691
信誉分 100
可用分 4423
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-2
状态 离线
4829
 

版主你好,我有如下问题:
1 “HRP比AP的灵敏度高”,这个说法有根据么?
2 western blot HRP和AP的灵敏度可以检测到哪个级别?(ng?pg?)
3 我使用biorad的半干转仪,25v恒压,电流在200mA左右,30min,观察到Fermentas预染marker上红色条带(70kDa)完全转过去了(在胶上没有条带了,而且在最下面的滤纸上有清晰的红色条带),我需要的目的位置是48kDa,我这种转膜方式是转膜正常么?
抱歉,现在图片不在手边,没法上图了。
顶部
NBA[使用道具]
五级
Rank: 5Rank: 5


UID 75229
精华 6
积分 2497
帖子 4006
信誉分 114
可用分 20946
专家分 70
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
4830
 
楼主你好!最近换了个二抗,结果就很不好看了~看了楼主的帖子,我也打算摸一下现在的二抗。我用的是PVDF膜,那如楼主所说要做二抗梯度的话,PVDF膜要预先泡过甲醇活化了之后再加稀释好的二抗,然后室温干燥之后再加发光剂吗?谢谢!

=============================

用NC做点膜
PVDF没做过
我觉得做不了
你可以尝试下,完了把结果放上来
顶部