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标题:【讨论帖】western blot问题解答

tie8[使用道具]
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内参呢?

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今天做的内参 没有做出来 不知道是不是因为二抗时间久了
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fei1226com[使用道具]
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你好,我的一抗是Abcam的(ab74734,兔多抗whole serum),二抗Santa,内参博奥森的Beta-actin。目的和内参都做不出,很是着急,不知哪些环节可能有问题。
组织:人心肌组织,目的蛋白是膜蛋白,分子量97KD,用碧云天P0013裂解液提取全蛋白,测浓度20-30mg/ml。
上样量:20微升
电泳仪:Bio-Rad Mini-PROTEAN Tetra
电泳:5%浓缩胶60v、30min,8%分离胶120v、60min(胶用考马斯亮蓝染色后,目的分子量周围条带清晰分明)
转膜:冰浴恒流300mA 60min(0.22的PDVF膜,1.5mm厚胶 转膜后染胶没有条带,染膜隐隐约约有,但不确定是不是)
封闭:碧云天封闭液室温封闭1小时
一抗:碧云天一抗稀释液稀释1:1000(说明书说1:300到1:4000),摇床上4度过夜
内参稀释1:1000(说明书1:1000到1:1500)
洗膜:TBST洗10min*3遍
二抗:碧云天二抗稀释液稀释1:2000,摇床上室温摇1h
洗膜:TBST洗10min*3遍
显色:ECL显色未见荧光,压片10分钟也什么都没有(稀释过的二抗直接加发光剂显影定影没有问题)

请问可能是哪些环节有问题?
1.组织在-80℃放了半年,有无影响?提取蛋白的方法有无问题,膜蛋白能用总蛋白做出来吗?
2.心肌组织是不是不能用Beta-actin作内参?
3.一抗-20℃放了4个月,期间一共就冻融过3次,会不会已经失效,如何验证?
4.转膜条件有无问题?转膜液配方:Tris 3g,甘氨酸14.4g,甲醇200ml,SDS 1g,加水至1000ml,有无问题?
5.Beta-actin和GAPDH 适合的转膜条件是多少?
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cwcwcww[使用道具]
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TLR4我们就在做
不同公司的分子量是不同的

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那能请问老师做的是TLR4哪个方面的实验吗?我做的是人癌细胞TLR4受体表达,也需要外源性TLR4,我找的R&D公司的TLR4,但价格偏高,老师能推荐一下哪个公司的外源性TLR4价格稍便宜吗?
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老师好,我又来提问啦,我做的是运动对骨骼肌信号通路的影响,运动刺激包括中等、大强度运动,最近我想把内参从beta-actin改成GAPDH,但我犹豫的一点是:GAPDH在肌肉中的表达量是否受运动影响?它是糖代谢中的一种关键酶,那我们的试验中,大鼠进行不同强度运动时,或多或少会影响到骨骼肌糖代谢,那么会影响到GAPDH的表达量吗?我担心,我的内参的不一致不是因为定量不均引起的,而会是运动强度引起的。
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is2011[使用道具]
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老师好,我又来提问啦,我做的是运动对骨骼肌信号通路的影响,运动刺激包括中等、大强度运动,最近我想把内参从beta-actin改成GAPDH,但我犹豫的一点是:GAPDH在肌肉中的表达量是否受运动影响?它是糖代谢中的一种关键酶,那我们的试验中,大鼠进行不同强度运动时,或多或少会影响到骨骼肌糖代谢,那么会影响到GAPDH的表达量吗?我担心,我的内参的不一致不是因为定量不均引起的,而会是运动强度引起的。

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缺氧条件下糖酵解途径活性增加,GAPDH表达量也增加。骨骼肌里面的白纤维是专门进行无氧呼吸的,本底GAPDH表达量是其他组织的数倍。如果是RT-PCR的话肯定是不行的,不清楚你的实验细节所以不好说对WB是否有影响。

[ 本帖最后由 is2011 于 2013-4-3 09:42 编辑 ]
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windy+++[使用道具]
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老师你好,请问一抗可以重复使用么?可以的话最多使用几次?
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老师麻烦帮忙分析下原因!最近在做分子量为115的磷酸化蛋白和非磷酸化蛋白的WB,一般是先显磷酸化蛋白,然后strip,重新封闭孵育抗体再显非磷酸化蛋白。步骤如下:
1.配制10%的分离胶,再灌注5%的分离胶。
2.预电泳30V 10分钟,电泳时间先用60v的跑,待mark分开之后再用80v的跑个120分钟左右待溴酚蓝跑到底部。
3.再200mA转膜120分钟(恒流,冰浴)。最后一般mark也会转过来。
4.转膜后用5%的BSA四度封闭20小时左右(封闭时间略长应该没问题的吧)。
5.5%的BSA孵一抗1:1000(按cst推荐比例)过夜,TBST漂洗10min×3次
6.5%的BSA二抗浓度1:5000(按说明书),室温轻摇60-70分钟,TBST漂洗10min×3次。
8.ECL曝光。
9.然后strip6小时或过夜,重新用5%脱脂奶粉封闭,孵非磷酸化蛋白的一抗,再孵二抗显影。
0.45um的pvdf膜
最后的结果如图背景很深,做了几次都是这样,到底是什么原因呢,抗体都是只有一次的,都不敢回收用,全都买的cst的抗体


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对了,第一张是actin的感觉还行,第二张是磷酸化蛋白的,第三张是非磷酸化蛋白,后面两张背景都很深
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kswl870[使用道具]
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内参文献中有用GAPDH,beta-actin等
后面这个问题不懂

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谢谢老师的回到。我了解的文献是细胞膜的蛋白是用的Na-K ATP酶的内参,细胞浆蛋白用的是GAPDH做内参。在我的理解是GAPDH,beta-actin是细胞浆蛋白的内参。关于GSK就是我们做的P-GSK3β能出,但是膜再生后的GSK3β却总是做不出来,抗体均为CST 兔单克隆的,不知道是抗体的缘故还是这个蛋白有什么特殊之处
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duoduo[使用道具]
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老师您好,我做WB转膜的时候经常碰到这种问题,Marker在跑电泳的时候都很正常,很直,但是转膜后却出现了问题,观察到的Maker转花掉了,然后上抗出现的就是这样的条带,我的转膜条件是300mA,1h

这个到底是什么问题呢!。我做WB失败的只有这一步了。。。。非常感谢


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