蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【讨论帖】包涵体蛋白的纯化及复性讨论专贴

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:【讨论帖】包涵体蛋白的纯化及复性讨论专贴

applebook=213[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 74101
精华 6
积分 525
帖子 405
信誉分 112
可用分 2981
专家分 60
阅读权限 255
注册 2011-10-5
状态 离线
81
 
我曾经使用过PH 9.5成功复性目的蛋白
顶部
ukonptp[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 103464
精华 5
积分 796
帖子 992
信誉分 110
可用分 5846
专家分 50
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
82
 


QUOTE:
原帖由 applebook=213 于 2013-4-10 15:57 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
我曾经使用过PH 9.5成功复性目的蛋白

如上所述,缓冲液的PH是根据你的目的蛋白的等电点而确定的,呵呵.
顶部
finger[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 71816
精华 0
积分 574
帖子 787
信誉分 100
可用分 4799
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-8-31
状态 离线
83
 

复性是一个十分复杂的过程,解决得方法也是多种多样。首先是选择合适的表达载体和表达菌株,尽量少产生包含体。可以先进行预实验确定表达条件,我建议采用正交分析法来进行。一般的我采用4因素3水平的正交实验,因素主要考虑培养温度、诱导物加入量、加入诱导物时的菌浓度和诱导时间。每个因素考虑小、中、大三个水平。我曾经使用这种方法,很好的选择了一个蛋白的表达条件,使其大部分以可溶形式表达。
再谈包含体的复性,在采用通常的方法不行的条件下,可以考虑加入一些化学试剂,一般报道的有PEG、丁酸和多糖。
顶部
ukonptp[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 103464
精华 5
积分 796
帖子 992
信誉分 110
可用分 5846
专家分 50
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
84
 


QUOTE:
原帖由 finger 于 2013-4-10 15:58 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

复性是一个十分复杂的过程,解决得方法也是多种多样。首先是选择合适的表达载体和表达菌株,尽量少产生包含体。可以先进行预实验确定表达条件,我建议采用正交分析法来进行。一般的我采用4因素3水平的正交实验,因素主要考 ...

这位战友说的是正确的.
但是如果表达载体和表达菌一旦确定以后,想在根据温度、IPTG等来控制包涵体的形成我想并不是很现实,因为每次你加入的母液的浓度总是不一样的,即使是做成了,这种实验的可重复性也是比较差的。因为不稳定性因素太多了,呵呵。
顶部
memory[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 76531
精华 0
积分 378
帖子 436
信誉分 100
可用分 2962
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-7
状态 离线
85
 

用Trition -100可以洗涤任何包涵体吗?会不会有什么影响?

谢谢!
顶部
ukonptp[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 103464
精华 5
积分 796
帖子 992
信誉分 110
可用分 5846
专家分 50
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
86
 


QUOTE:
原帖由 memory 于 2013-4-10 16:01 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

用Trition -100可以洗涤任何包涵体吗?会不会有什么影响?

谢谢!

曲拉通是一种表面活化剂,润湿及洗涤剂。
在洗涤包涵体的时候是把它当作洗涤剂来用的,也就是主要是把它当作一种去垢剂,用它来洗涤一些杂质或是分子量很大的一些杂蛋白。不能说可以洗涤任何包涵体,因为“任何”包括的太多了。但是我想绝大多数的包涵体还是可以用曲拉通来洗涤的,我也曾经试过用PBS来当作曲拉通来洗涤,效果也还可以,所以说曲拉通的洗涤只是一个可有可无的过程,对于整个包涵体蛋白的纯化来说不是很主要的一个过程。
顶部
ukonptp[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 103464
精华 5
积分 796
帖子 992
信誉分 110
可用分 5846
专家分 50
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
87
 

看了些资料,发到自己的帖子上面,呵呵。

菌体/细胞裂解法:

一、反复冻融法:
1、将细胞在-20度以下冰冻,室温融解,反复几次,由于细胞内冰粒形成和剩余细胞液的盐浓度增高引起溶胀,使细胞结构破碎。
2、至少3次以上冻溶。
3、IFCC推荐法:
收集细胞悬液,4℃低温离心(3000rpm,5min),弃上清,加入一定量PBS(200ul),轻轻吹打混匀,-200C 冷冻30 min,370C 解冻,如此反复3次,可形成细胞裂解液。
步骤如下:
1) 收集细胞悬液
2)40C 低温离心(3000rpm,5min)
3)弃上清,加入一定量PBS(200ul),轻轻吹打混匀,-200C 冷冻30 min,
370C 解冻,如此反复3次,可形成细胞裂解液。
4、用液氮冻融三四次就可以了,细胞冻住后,取出放37度水浴,溶解后震荡,再冻

二、超声波处理法
1、要设定好超声时间和间隙时间,一般超声时间不超过5秒,间隙时间最好大于超声时间,这些都有利于保护酶的活性。我的实验超声时间5秒、间隙时间10秒、工作次数20次。
注意事项:
1)、一个细胞超声仪可以配备不同尺寸的探头,根据你实验中收集细胞的容器大小选择合适规格的探头。
2)、另外冰浴非常重要,空化效应会局部产热,从而使细胞内酶失活,所以我通常将收集细胞的离心管置于冰盒中。
3)、要设定好超声时间和间隙时间,一般超声时间不超过5秒,间隙时间最好大于超声时间,这些都有利于保护酶的活性。我的实验超声时间5秒、间隙时间10秒、工作次数20次,镜下观察细胞破碎效果很好,供参考。不同细胞实验条件得具体摸索。
4)、最后好好看仪器说明书,探头到液面下的距离及与容器底部的距离都有要求。
2、每个样本超声时间5秒,每个间隔5秒,粉碎5次。
3、100ml菌液离心,用8ml缓冲液悬浮,加8mg溶菌酶,冰浴30min,然后超声处理。750W 40%功率。5秒超声,9秒间隔。超声至少90min。超声完毕后,菌液应该是澄清的,略显油状。
4、综合冻融和超声的方法:
1500g离心,弃除上清。冰上,用小体积PBS重悬细胞。
将重悬液集中,1500g离心浓缩,弃除上清。液氮骤冷。用约5倍体积的PBS缓冲液重悬细胞,并搅拌。
可选择:4℃下超声破碎细胞。加入终浓度为0.25M的KCl,15mM的DTT。4℃下111500g×60min离心裂解液。取出上清。过柱子。

三、渗透法:
冰冷的20 mmol/L Tris-Cl(pH8.0),2.5 mmol/L EDTA处理,冰浴放置10min。
《精编分子生物学实验指南》

四、裂解液处理法:
1、细胞裂解液:50 mmol/L Tris-Cl pH 6.8,100 mmol/L DTT,2% SDS,0.1%溴酚蓝,10%甘油。SDS是阴离子型表面活性剂、极易促溶、强变性作用。
2、在loading buffer加SDS,100度5分钟,是变性方法。SDS与蛋白等量结合,可以通过条带位移判断蛋白大小,考染不会影响结果。
3、如果是做小量菌液,跑PAGE胶看其表达情况的话,可以直接加蛋白loading buffer煮沸5分钟即可,需注意的是上样前要离心12000rpm至少5分钟,然后上样时,枪头别吸最底下的。
4、20毫升细胞裂解液配方:40 μL 0.5M EDTA (PH8.0),4 ml 10% SDS,1 ml 1M Tris-cl(PH6.8),14.96 ml 蒸馏水。可以适当加入几种蛋白酶的抑制剂,如PMSF,leupeptin等。
5、检测蛋白诱导:
从培养的不同时期各取出1ml,12000g×1min离心。将沉淀重悬于100ul 1×SDS上样缓冲液(50mM Tris-Cl(pH6.8),100mM DTT,2%SDS,0.1%溴酚蓝,10%甘油)中,100℃加热3min,然后12000g×1min离心。上样15ul,6%SDS-PAGE电泳。
《分子克隆》P826
7、5-10秒离心,弃除上清,用50ul蒸馏水重悬沉淀。加入1ul PMSF,再加入50ul热的2×SDS上样缓冲液(100℃加热)。迅速混匀后100℃加热3-5min。将样品冰上放置(或-20℃放置),然后再溶解,煮沸1min。离心30秒。上样5ul进行SDS-PAGE电泳。
2×SDS上样缓冲液:250mM Tris-Cl,6.2%(w/v)DTT,8%SDS,0.002%(w/v)溴酚蓝,40%甘油。
Purification of GST-Fusion Proteins from E. coli。
顶部
831226[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 79782
精华 0
积分 770
帖子 1240
信誉分 100
可用分 6976
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-12-15
状态 离线
88
 
我看到你的这个专区很高兴,我正在做这方面的实验,有很多问题想请教你,谢谢。
“Tris缓冲液:
50mM Tris
0.5mM EDTA
50mM Nacl
5%或10%甘油
如果有条件加入1%的甘氨酸或精氨酸和谷胱甘肽会更好些。也可以在其中
加入氧化还原系统,如双型谷胱甘肽、DTT等。
PH理论上是要根据你蛋白的等电点来确定的,应该是比等电点稍高一些。但是PH7.9、8.0我都试过,效果没区别。 ”
关于你提到的Tris缓冲液,请问我用的是20mM Tris,没有加Nacl,有影响吗?甘油有什么作用?
我的蛋白复性后上离子交换柱,无论是阴离子还是阳离子柱,都是大部分穿透,不知是不是复性效果不好造成的。
谢谢!!!急。。。
顶部
ukonptp[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 103464
精华 5
积分 796
帖子 992
信誉分 110
可用分 5846
专家分 50
阅读权限 255
注册 2013-1-11
状态 离线
89
 


QUOTE:
原帖由 831226 于 2013-4-10 16:16 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
我看到你的这个专区很高兴,我正在做这方面的实验,有很多问题想请教你,谢谢。
“Tris缓冲液:
50mM Tris
0.5mM EDTA
50mM Nacl
5%或10%甘油
如果有条件加入1%的甘氨酸或精氨酸和谷胱甘肽会更好些。也可以在其中
加入氧化还原 ...

请教不敢当,互相学习吧。

1、关于你提到的Tris缓冲液,请问我用的是20mM Tris,没有加Nacl,有影响吗?
我觉得影响不会很大。
因为包含体蛋白透析主要是根据透析样品中尿素的浓度差的原理来进行的。其实有文献报道透析的复性率只能达到40%(我对这个数字表示怀疑),所以我认为透析这个过程与其说是复性的过程倒不如说是个纯化的过程。

2、甘油有什么作用?
甘油在整个缓冲体系中起到的是稳定蛋白的作用。还有就是保存蛋白的作用,就像细菌保种的时候要加入甘油一样的,如果你想长时间保存就多加点甘油,如果保存时间较短就少加点。

3、我的蛋白复性后上离子交换柱,无论是阴离子还是阳离子柱,都是大部分穿透,不知是不是复性效果不好造成的。
这个我不敢说,因为在没有纯化蛋白之前我考虑了几种纯化方法,最后选择了HIS纯化柱,没用离子交换这种方法,所以知道的不是很多。就我所知道的给您提点建议吧,希望我没有理解错。
我觉得您的这种情况肯定是跟复性的效果有关系的,而且我觉得多数是跟PH值有关,因为离子交换纯化跟缓冲液的PH值以及你蛋白的等电点有很大关系。以ph7的缓冲液为例,如果你的目标蛋白等电点小于7,呢就带负电荷,用阴离子交换的柱子,如果是大于7,那选择阳离子交换的柱子,如果等电点是7,那上样的缓冲液pH大于它的等电点用阴离子,小于7的用阳离子,如此类推就可以.

关于离子交换我只知道这么多了,呵呵。

建议你还是先看一下相关的资料和教材吧。武大赵俊芳编的<生物化学实验技术和基本原理>挺好挺详细的。还有一本冷泉港实验室的蛋白质提取纯化的书也挺好的。具体链接如下:
cuturl('http://blog.molezz.org/read.php?143')

希望对你有所帮助。
顶部
NBA[使用道具]
五级
Rank: 5Rank: 5


UID 75229
精华 6
积分 2497
帖子 4006
信誉分 114
可用分 20946
专家分 70
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
90
 

蛋白折叠状态不同,表面电荷分布确实会有差异。
但我估计,主要是由于所选的pH不合适,或盐浓度过高。
顶部