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看了些资料,发到自己的帖子上面,呵呵。
菌体/细胞裂解法:
一、反复冻融法:
1、将细胞在-20度以下冰冻,室温融解,反复几次,由于细胞内冰粒形成和剩余细胞液的盐浓度增高引起溶胀,使细胞结构破碎。
2、至少3次以上冻溶。
3、IFCC推荐法:
收集细胞悬液,4℃低温离心(3000rpm,5min),弃上清,加入一定量PBS(200ul),轻轻吹打混匀,-200C 冷冻30 min,370C 解冻,如此反复3次,可形成细胞裂解液。
步骤如下:
1) 收集细胞悬液
2)40C 低温离心(3000rpm,5min)
3)弃上清,加入一定量PBS(200ul),轻轻吹打混匀,-200C 冷冻30 min,
370C 解冻,如此反复3次,可形成细胞裂解液。
4、用液氮冻融三四次就可以了,细胞冻住后,取出放37度水浴,溶解后震荡,再冻
二、超声波处理法
1、要设定好超声时间和间隙时间,一般超声时间不超过5秒,间隙时间最好大于超声时间,这些都有利于保护酶的活性。我的实验超声时间5秒、间隙时间10秒、工作次数20次。
注意事项:
1)、一个细胞超声仪可以配备不同尺寸的探头,根据你实验中收集细胞的容器大小选择合适规格的探头。
2)、另外冰浴非常重要,空化效应会局部产热,从而使细胞内酶失活,所以我通常将收集细胞的离心管置于冰盒中。
3)、要设定好超声时间和间隙时间,一般超声时间不超过5秒,间隙时间最好大于超声时间,这些都有利于保护酶的活性。我的实验超声时间5秒、间隙时间10秒、工作次数20次,镜下观察细胞破碎效果很好,供参考。不同细胞实验条件得具体摸索。
4)、最后好好看仪器说明书,探头到液面下的距离及与容器底部的距离都有要求。
2、每个样本超声时间5秒,每个间隔5秒,粉碎5次。
3、100ml菌液离心,用8ml缓冲液悬浮,加8mg溶菌酶,冰浴30min,然后超声处理。750W 40%功率。5秒超声,9秒间隔。超声至少90min。超声完毕后,菌液应该是澄清的,略显油状。
4、综合冻融和超声的方法:
1500g离心,弃除上清。冰上,用小体积PBS重悬细胞。
将重悬液集中,1500g离心浓缩,弃除上清。液氮骤冷。用约5倍体积的PBS缓冲液重悬细胞,并搅拌。
可选择:4℃下超声破碎细胞。加入终浓度为0.25M的KCl,15mM的DTT。4℃下111500g×60min离心裂解液。取出上清。过柱子。
三、渗透法:
冰冷的20 mmol/L Tris-Cl(pH8.0),2.5 mmol/L EDTA处理,冰浴放置10min。
《精编分子生物学实验指南》
四、裂解液处理法:
1、细胞裂解液:50 mmol/L Tris-Cl pH 6.8,100 mmol/L DTT,2% SDS,0.1%溴酚蓝,10%甘油。SDS是阴离子型表面活性剂、极易促溶、强变性作用。
2、在loading buffer加SDS,100度5分钟,是变性方法。SDS与蛋白等量结合,可以通过条带位移判断蛋白大小,考染不会影响结果。
3、如果是做小量菌液,跑PAGE胶看其表达情况的话,可以直接加蛋白loading buffer煮沸5分钟即可,需注意的是上样前要离心12000rpm至少5分钟,然后上样时,枪头别吸最底下的。
4、20毫升细胞裂解液配方:40 μL 0.5M EDTA (PH8.0),4 ml 10% SDS,1 ml 1M Tris-cl(PH6.8),14.96 ml 蒸馏水。可以适当加入几种蛋白酶的抑制剂,如PMSF,leupeptin等。
5、检测蛋白诱导:
从培养的不同时期各取出1ml,12000g×1min离心。将沉淀重悬于100ul 1×SDS上样缓冲液(50mM Tris-Cl(pH6.8),100mM DTT,2%SDS,0.1%溴酚蓝,10%甘油)中,100℃加热3min,然后12000g×1min离心。上样15ul,6%SDS-PAGE电泳。
《分子克隆》P826
7、5-10秒离心,弃除上清,用50ul蒸馏水重悬沉淀。加入1ul PMSF,再加入50ul热的2×SDS上样缓冲液(100℃加热)。迅速混匀后100℃加热3-5min。将样品冰上放置(或-20℃放置),然后再溶解,煮沸1min。离心30秒。上样5ul进行SDS-PAGE电泳。
2×SDS上样缓冲液:250mM Tris-Cl,6.2%(w/v)DTT,8%SDS,0.002%(w/v)溴酚蓝,40%甘油。
Purification of GST-Fusion Proteins from E. coli。