蛋白质与蛋白组学

谢谢LZ提供的宝贵资料。

我有2个问题想请教一下：
1、chip试验中60ul Protein A Agarose/Salmon Sperm DNA这个东西是干什么用的？只能用这个吗？
2、你提到TF和Promoter是生物意义上的结合，我想知道这个“生物意义上的结合”是什么样的一种结合方式，它与化学键的结合有什么区别？是指电子力吗？

多谢指教~

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你好：
1、Protein A琼脂糖和鲑精DNA混合物。鲑精DNA是用来封闭琼脂糖上面的非特异性结合位点，降低背景的。protein A 琼脂糖是结合和抗体之后，把蛋白-抗体复合物沉淀下来的。
2、我认为化学上的结合是有化学键的，比较稳定。生物学意义上的结合，其实就像“酶与底物”之间的结合一样，靠的比较紧而已。

非常感谢楼主。

我记得在哪看过，在交联DNA和蛋白质的时候，可以用甲醛，也可以用一种酶，我当时没留意，给忘了，好像两种方法所适合的范围不同，真遗憾，找了半天也没再查到。。。

还有个问题，可以用组织来进行CHIP吗？

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你好！
交联都是需要甲醛的。在甲醛的作用下，”蛋白-蛋白“，”蛋白-核酸(包括DNA和RNA)“之间会产生化学键。形成比较稳定的复合物。
随后的细胞破碎阶段，可以用超声破碎，也可以用一种酶（具体我也不记得了）。
组织也可以进行ChIP。只是交联的条件可能需要好好摸索下。