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标题:【讨论帖】最近做原核表达的几点教训和体会

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LZ确实细心。以前做过很长时间的表达,与LZ比较起来,真实惭愧,很多问题都没有细细钻研,往往想当然认为怎么样怎么样了。所以谢谢LZ,一方面是这么细致的心得,另一方面是对待实验中出现的问题的钻研态度哈。
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LZ确实细心。以前做过很长时间的表达,与LZ比较起来,真实惭愧,很多问题都没有细细钻研,往往想当然认为怎么样怎么样了。所以谢谢LZ,一方面是这么细致的心得,另一方面是对待实验中出现的问题的钻研态度哈。
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关于分子量我觉得大一点是正常的,这个里面牵涉到修饰问题,虽然是原核表达但是也存在一定的修饰,所以实际的分子量往往都是比理论上的大一点。
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tianmei001[使用道具]
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转接的时候,需要那么小的比例呀,都1/500!?我做的是kan抗性,用1/100(按制备感受态的要求做的),行吗?我问别的同学,还用过1/25呢,要求严格吗?
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ukonptp[使用道具]
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kan抗性1:100没问题。但1:25我觉得高了点。因为过夜培养的菌里有部分死菌,对转接后生长不利;否则直接用过夜培养的菌就可以了,何必要转接?转接后高速培养(大约220 rpm)就是让细菌在较短的时间内达到对数生长期,达到活力最佳状态。否则

Amp的问题在首贴里已经提了。

谢谢讨论
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结论:培养基中确实很可能存在lactose。而且应该是造成阴性对照有表达的原因。

对你的这个问题我想发表一下自己的想法,你培养基中的乳糖含量应该是微乎其微的,而且即使有微量的不足以引起诱导表达。我认为你的阴性对照中的表达蛋白是你在上样的过程中溢出来的。我曾经作出过,阴性对照和阳性菌株蛋白图谱完全一样的电泳图。最终试验结果证实,主要是上样品的过程中不够细心,溢出造成。
再一个就是,你要做一个空表达载体的阴性对照,更有说服力。
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结论:培养基中确实很可能存在lactose。而且应该是造成阴性对照有表达的原因。

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对你的这个问题我想发表一下自己的想法,你培养基中的乳糖含量应该是微乎其微的,而且即使有微量的不足以引起诱导表达。我认为你的阴性对照中的表达蛋白是你在上样的过程中溢出来的。我曾经作出过,阴性对照和阳性菌株蛋白图谱完全一样的电泳图。最终试验结果证实,主要是上样品的过程中不够细心,溢出造成。
再一个就是,你要做一个空表达载体的阴性对照,更有说服力。
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很高兴一起讨论。同意您提出的阴性对照问题。谢谢!

关于前面的问题,

1. 我用的是DYT培养基,比LB中的tryptone含量高一倍。
2. BL21 Star DE3是一种优化的表达菌株,invitrogen网站上有一张图片,用该菌株做表达,产量要高于未突变的DE3,因为前者是某(些)蛋白降解酶的突变菌株。
3. T7 promoter 具有很强的可诱导性。在表达毒性蛋白的时候常用到glucose或者pLysE 菌株。前者抑制蛋白的本底表达;后者能产生一种酶使得在T7 promoter控制下的基因表达得到抑制。这些都是因为培养基能诱导一些本底表达。

所以,您用的是什么菌株呢?表达量跟菌株,外源片段,加IPTG的时间等等都有关系。从图上您可以看到,我这个蛋白的表达是非常高的。除了加入的lysozyme (14k 左右的那条带),目的蛋白在总蛋白中的量恐怕要达到80%了。所以微量的lactose很有可能诱导出较多的蛋白。

关于漏样的问题。胶上有说明,18 wells,30 ul。我都是点10 ul样。另外,同样的操作,在第三张胶图中看不到漏样的现象。(可以比较positive control旁边的带)。

Anyway,我的这个结论缺乏直接的证据。所以我用的描述是”培养基确实很可能存在lactose,而且应该是造成阴性对照表达的原因“。

要证明这个问题,可以用不含tryptone的培养基,比如Minimal培养基和DYT做个对比。这样也能说明问题。也许等下次做蛋白表达的时候会考虑做一个,到时候再把结果贴上来

再次感谢您的讨论。
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dongdongqiang[使用道具]
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毒性蛋白表达非常不稳定
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ukonptp[使用道具]
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毒性蛋白表达非常不稳定 您的毒性蛋白表达protocol发一个
多谢

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表达毒性蛋白也有不同的毒性level。园子里关于毒性蛋白表达的帖子肯定不少。

一般的来说,将菌培养到高OD(要用丰富培养基,比如TB),OD600到4-5,甚至有人做14-16的,然后用低浓度IPTG短时间诱导(如0.4 mM 1 h)。具体的最优化条件,我认为不同的蛋白应该摸索不同的条件(诱导时细菌状态,时间等)。

也可以用表达毒性蛋白的strain,很多公司都有卖的。如BL21(DE3)pLysS.
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