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标题:【讨论帖】蛋白芯片技术答疑帖

eric930[使用道具]
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发表于 2013-4-24 17:18 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
小弟才入蛋白之门，想多问个问题

我正是通过IP拿到A+X（X是附着在A上的一个蛋白），可是您说再用IP把X拉下来

因为X是未知蛋白，怎么拉它下来呢？谢谢您的答复

==============================================================================

其实最好的方法就是IP将A+X拉下来，然后SDS-PAGE,切胶走质谱，知道这个蛋白了再去做验证。
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831226[使用道具]
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发表于 2013-4-24 17:20 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

有没有用于筛选疾病标志物的商业化蛋白芯片？哪儿有？谢谢
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dragonkilly[使用道具]
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发表于 2013-4-24 17:21 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
有没有用于筛选疾病标志物的商业化蛋白芯片？哪儿有？谢谢

==============================================================================================================

用于筛疾病标志物的芯片应该说是有一些的，例如Full Moon公司的ASB600芯片，覆盖了656个蛋白质，Raybiotech公司的一系列细胞因子芯片等等。

就我所知，已经有一些研究者在使用上述芯片进行疾病标志物筛选了，而且也有些文献发表的。

您需要哪种芯片关键还是要看您的实验设计。
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发表于 2013-4-24 17:21 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
小弟才入蛋白之门，想多问个问题

我正是通过IP拿到A+X（X是附着在A上的一个蛋白），可是您说再用IP把X拉下来

因为X是未知蛋白，怎么拉它下来呢？谢谢您的答复

=======================================================================================

楼上战友的回答是正确的。既然X和A有相互作用，那么IP可以将他们的复合物拉下来，然后电泳质谱鉴定了。

关于IP，我想您应该有A的抗体了吧？方法学方面就不在这赘述了，站里面搜索一下应该有很多的。
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发表于 2013-4-24 17:21 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
蛋白芯片确实是个好东西，理论方面很完美，多数用的是荧光标记吧，我在医院实习中用时，由于步骤较多，操作时间也长，再加上膜孔多，技术不熟练，每次都不能得到好的结果，我们用的是手工法。要做这么多个检测项目，怎么保证，每个项目灵敏性都好。
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发表于 2013-4-24 17:22 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
蛋白芯片确实是个好东西，理论方面很完美，多数用的是荧光标记吧，我在医院实习中用时，由于步骤较多，操作时间也长，再加上膜孔多，技术不熟练，每次都不能得到好的结果，我们用的是手工法。要做这么多个检测项目，怎么保证，每个项目灵敏性都好。

===========================================================================

蛋白芯片现在还是用于科研的多一些，如果是用于临床，还是要开发配套仪器实现自动化才可以。

我想临床医生或者检验科的医生们是没有兴趣单个孔去加样检测的。

较成功国内产品可参考数康的C12。
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发表于 2013-4-24 17:22 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

现在知道蛋白A，也知道它在膜上的受体，但是不知道与受体作用的蛋白，筛选这些未知蛋白可用蛋白质芯片不？
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dragonkilly[使用道具]
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发表于 2013-4-24 17:23 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
现在知道蛋白A，也知道它在膜上的受体，但是不知道与受体作用的蛋白，筛选这些未知蛋白可用蛋白质芯片不？

=============================================================================================

与受体作用的蛋白，是指受体下游的信号通路？还是类似引起离子通道改变的受体？

若筛选哪些信号通路相关，可以选择信号通路抗体芯片，筛选究竟是哪个信号通路发生调变，这个方法也比较成熟了。

若是直接引起离子通道、渗透压改变等等作用，是否用IP的方法来鉴定一下比较好呢？
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发表于 2013-4-24 17:23 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
与受体作用的蛋白，是指受体下游的信号通路？还是类似引起离子通道改变的受体？

若筛选哪些信号通路相关，可以选择信号通路抗体芯片，筛选究竟是哪个信号通路发生调变，这个方法也比较成熟了。

若是直接引起离子通道、渗透压改变等等作用，是否用IP的方法来鉴定一下比较好呢？

===================================================================================

是信号通路的蛋白，该受体是G蛋白偶联受体，是想弄明白该受体与配体结合后下游信号分子？初步推测，

可能有多个分子参与下游信号传导。可以用蛋白芯片吗？

那个公司做的比较可靠？
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dragonkilly[使用道具]
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发表于 2013-4-24 17:24 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
是信号通路的蛋白，该受体是G蛋白偶联受体，是想弄明白该受体与配体结合后下游信号分子？初步推测，
可能有多个分子参与下游信号传导。可以用蛋白芯片吗？

那个公司做的比较可靠？

==============================================================================================================

我们认为现在进行信号通路筛选的蛋白芯片，美国Full Moon公司的磷酸化抗体芯片系列比较可靠，该芯片的特点一个是通量高（包括1318种抗体，涉及接近600个磷酸化位点），二是这些位点均有文献报道过，三是每个位点通过芯片上的一对抗体可直接计算出该位点的磷酸化水平（一个抗体识别磷酸化状态，一个抗体识别对应非磷酸化状态）。

1楼有相关的文献下载，第一页也有一篇相关文献解析。

Full Moon授权的技术服务商是上海生物芯片有限公司，我把联系方式站内短信发送给您。
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