小中大要得到3300D的蛋白穿出,则需要至少为10-15kD的膜,而要想截流20000D的蛋白,则膜最大不应该超过5kD的膜。所以,如果要达到在3300 D的样品中没有一丁点的20000 D的蛋白,那就必须以牺牲3300D的蛋白收率为代价,可以选择10kD的膜,降低超滤的透过压,让3300D的蛋白在低压下透过膜。至于厂家,板块式膜堆厂家有Millipore公司和沙多利斯等,中空纤维式的有AmershamPharmacia公司等。特别是AmershamPharma公司,最近新设计了一套超滤科研系统,充分揉和了AKTA设备的功能,有利于进行超滤条件的选择和优化。
我建议你可以试一试其他的层析技术,例如可以先通过离子交换层析进行浓缩和初步纯化,再进行分子筛层析,即可很容易的达到分离目的。
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您的回复正是我想说的,但是我觉得有以下值得商量的地方:
1,“...截流20000D的蛋白,则膜最大不应该超过5kD的膜..."
我在实际工作中遇到的有与您不完全与您说的一致的例子.比如对于形状比较规则的球形蛋白就可以.建议这样的情况最好用实验结果更能说明问题.
2,"...可以选择10kD的膜,降低超滤的透过压,让3300D的蛋白在低压下透过膜..."
TMP是过膜压力,它是取进出口压力之和的一半,减去透过口压力.是过膜压力的平均值,也就是您说的超滤的透过压,它只是近似描述TFF特征的一个参数,实际的情况是,无论您怎么降低,在进口的地方,有最大的TMP, 而在出口处,有最小的TMP,所以您很难降低压力到用10K的膜保证20K的蛋白绝对不透过. 而降低压力意味着牺牲效率,您需要很大的膜面积或者很长的时间去超滤. 在孔径与TMP这对矛盾中,膜的空径的影响可能更大.
3,"...可以先通过离子交换层析进行浓缩和初步纯化.."
要是20KD和3300Da等电点差异很大, 而且小肽容易吸附的话,那用IEC,可能一步就能够达到目的.层析应该是精细纯化,成本也高很多. 我到更觉得用分子筛即Size Exclusion更能够的达到目的.不过需要注意的是,这样的花费可能要大很多.
最简便的办法是,要是小肽耐热,用加热去除大蛋白,可能是最简单最经济的办法.