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标题:【讨论帖】生物制药产业化及膜分离技术,下游纯化

fsdd817[使用道具]
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请教楼主一个问题,和超滤有关的,因为自己的数学知识生疏了,特张贴求解!望不吝赐教!
我有1000ml 蛋白溶液要超滤换液,去除其中的3M 尿素,换成PBS。超滤膜截留分子量是10kD,泵的流速是30ml/min,滤出的速度是10 ml/min。装样品的瓶子保持密封状态,滤出多少体积同时就自动的补充多少体积的PBS,即样品的体积保持1000ml。问题是我要多少体积的PBS才能很完全地置换出样品中的尿素(容许残留20000分之一)?
我知道这需要用到微积分方程才可以解答,可是我把所学的一点高数早就全还给老师了。望楼主能告诉我答案和方法!如别的朋友知道也请指点!

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大体上,可以有7个体积达到99,9%去除,也即1/1000保留,要是达到1/20000,那体积是了不得的大啊
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fsdd817[使用道具]
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52
 
各位有没有用羟基磷灰石作为填料纯化蛋白质的?纯化的示哪种蛋白质?

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个人觉得,它作为填料纯化蛋白的文献很多,但是真正的应用于生产的比较罕见。刘国诠先生在《生物大分子分离与纯化》中有过介绍,引用文献也很多。
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is2011[使用道具]
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请教楼主一个问题,和超滤有关的,因为自己的数学知识生疏了,特张贴求解!望不吝赐教!
我有1000ml 蛋白溶液要超滤换液,去除其中的3M 尿素,换成PBS。超滤膜截留分子量是10kD,泵的流速是30ml/min,滤出的速度是10 ml/min。装样品的瓶子保持密封状态,滤出多少体积同时就自动的补充多少体积的PBS,即样品的体积保持1000ml。问题是我要多少体积的PBS才能很完全地置换出样品中的尿素(容许残留20000分之一)?
我知道这需要用到微积分方程才可以解答,可是我把所学的一点高数早就全还给老师了。望楼主能告诉我答案和方法!如别的朋友知道也请指点!

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我也觉得1/20000需要的体积太大了
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fsdd817[使用道具]
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要得到3300D的蛋白穿出,则需要至少为10-15kD的膜,而要想截流20000D的蛋白,则膜最大不应该超过5kD的膜。所以,如果要达到在3300 D的样品中没有一丁点的20000 D的蛋白,那就必须以牺牲3300D的蛋白收率为代价,可以选择10kD的膜,降低超滤的透过压,让3300D的蛋白在低压下透过膜。至于厂家,板块式膜堆厂家有Millipore公司和沙多利斯等,中空纤维式的有AmershamPharmacia公司等。特别是AmershamPharma公司,最近新设计了一套超滤科研系统,充分揉和了AKTA设备的功能,有利于进行超滤条件的选择和优化。
我建议你可以试一试其他的层析技术,例如可以先通过离子交换层析进行浓缩和初步纯化,再进行分子筛层析,即可很容易的达到分离目的。

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您的回复正是我想说的,但是我觉得有以下值得商量的地方:
1,“...截流20000D的蛋白,则膜最大不应该超过5kD的膜..."
我在实际工作中遇到的有与您不完全与您说的一致的例子.比如对于形状比较规则的球形蛋白就可以.建议这样的情况最好用实验结果更能说明问题.
2,"...可以选择10kD的膜,降低超滤的透过压,让3300D的蛋白在低压下透过膜..."
TMP是过膜压力,它是取进出口压力之和的一半,减去透过口压力.是过膜压力的平均值,也就是您说的超滤的透过压,它只是近似描述TFF特征的一个参数,实际的情况是,无论您怎么降低,在进口的地方,有最大的TMP, 而在出口处,有最小的TMP,所以您很难降低压力到用10K的膜保证20K的蛋白绝对不透过. 而降低压力意味着牺牲效率,您需要很大的膜面积或者很长的时间去超滤. 在孔径与TMP这对矛盾中,膜的空径的影响可能更大.
3,"...可以先通过离子交换层析进行浓缩和初步纯化.."
要是20KD和3300Da等电点差异很大, 而且小肽容易吸附的话,那用IEC,可能一步就能够达到目的.层析应该是精细纯化,成本也高很多. 我到更觉得用分子筛即Size Exclusion更能够的达到目的.不过需要注意的是,这样的花费可能要大很多.
最简便的办法是,要是小肽耐热,用加热去除大蛋白,可能是最简单最经济的办法.
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阿司匹林[使用道具]
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我想请问一下,我的20kd的目的蛋白,要摸最佳的IPTG浓度,诱导时间&诱导温度,想跑page电泳后来根据浓度分析,不知道行不行,行的话应该用什么软件分析条带的浓度呢?
万分的感谢!
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QUOTE:
原帖由 阿司匹林 于 2013-4-25 16:16 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

我想请问一下,我的20kd的目的蛋白,要摸最佳的IPTG浓度,诱导时间&诱导温度,想跑page电泳后来根据浓度分析,不知道行不行,行的话应该用什么软件分析条带的浓度呢?
万分的感谢! ...

膜分离技术以外的问题请到外面发贴,谢谢
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fsdd817[使用道具]
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原帖由 阿司匹林 于 2013-4-25 16:16 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

我想请问一下,我的20kd的目的蛋白,要摸最佳的IPTG浓度,诱导时间&诱导温度,想跑page电泳后来根据浓度分析,不知道行不行,行的话应该用什么软件分析条带的浓度呢?
万分的感谢! ...


抱歉,我确实不能够回答您的问题。
您可以将之提交到分子生物学哪个版块或者上游版块去讨论。
这里讨论的是下游技术。
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版主和各位蛋白质技术的高手,我是一位蛋白质研究的新手,碰到了一个难题,想向各位请教,我的目标蛋白是19kD,是胞内表达的干扰素alpha-2b,以前的时候都是用ELISA进行活性检测的,只是用Lowry法测总蛋白,但是现在发现,一些变异的干扰素,包括氧化的产物等,竟然仍有活性,所以仅仅依靠ELISA法来监控含量已经不够,所以我想开发一个RP-HPLC的方法,想直接检测菌体中的干扰素含量,但是不知道那么杂的样品进样,分离度怎么样,所以想请教一下各位,我是想,先试一下,如果不行,再想别的办法,还有不知道超滤对样品的要求高不高?就是说菌体的提取物能不能直接用超滤来除去大部分的杂蛋白?而对我的目标蛋白的量不会造成损失呢。
还望各位大侠赐教。
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is2011[使用道具]
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ELisa来说并不是一个测活的方法,这一点要明确。
确定有些变体有没有活性,应进行相应的生物活性检测。与天然状态不同的变体不仅要证明有活性,还有证明对人体没有副作用。

RPC可能会与一部分的失活有关联,但也不能完全说明问题。你可以查一下罗永章的文章,可能会有所启发,但应该还是没有一个普遍的方法,因蛋白而异的。

样品太杂作RPC效果肯定不好,要是有血清培养就更复杂了。
以上是个人意见。
超滤的问题就等wym前辈来回答吧
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搂主提到的ELISA测定活性指的是体外活性,我的一种蛋白由细胞培养得到的,在纯化前要对培养液进行体外活性测定,这样可以计算最后纯化后的收率,而且Lowry法测定蛋白含量的干扰因素太多,一般得到纯品后才用该方法测定含量!
再有楼主提到用RP-HPLC测定,虽然正如版主所说可能会使样品失活,看你的目的了,如果只监测含量变化,还是可行的,用一纯品作为标准,外标法,但是非常值得注意的是,你的样品成分很复杂,在进样前务必要过滤,尽管这样对你的柱子的寿命还是有影响,最好可以把一些大分子,核酸之类去掉或在进样之前,有一定的预处理对你的样品。
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