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呵呵，首先谢谢楼主对我帖子作出的很快的反应，对于你最后提出的建议，作CO-IP，我已经做个这个实验了，但是因为用的是多克隆抗体，所以得到的免疫共沉淀的结果非常糟糕，条带很多，但是经过WB和取点作MS，没有得到目的蛋白以及可能与目的蛋白形成复合物的任何蛋白，如果想在CO-IP上有所进展的话，可能一是直接制备单抗，二是用抗原来纯化得到的多克隆抗体，以求得到意义上的“单抗”，此工作在进行中。关于膜蛋白的二维电泳，我用其他宿主的膜蛋白（例如大肠杆菌和枯草芽孢杆菌）进行BN/SDS-PAGE时，得到的二维电泳效果很好，点分布清晰，利于鉴定（我不会在这上面贴图)。而用我研究的宿主菌（链霉菌），其膜蛋白在二维电泳后，就出现我上个帖子所描述的结果。我溶膜的buffer的大致成分是：50mM bistris,750mM 6-ACA,1-3% detergent(tritonx-100 or DDM, SB3-10)。我研究的这个细菌是革兰氏阳性菌，产色素，这是与大肠杆菌和芽孢杆菌的主要两个区别。另外，这个经常出现的四条横纹我已经做过MS鉴定，是蛋白条带，属于多重跨膜的transport蛋白，查阅相关资料，的确是很重要的运载蛋白，参与宿主的初级和次级代谢，所以丰度很高，但是想不通的时，为什么在其他两株菌中，应该存在类似的transport蛋白，但没有出现横纹。等我把这个论坛上贴图的方法掌握了，我会把相应的图贴出来，以便讨论起来更容易和有针对性一些。
