蛋白质与蛋白组学

根据发表在5月1日《柳叶刀》（The Lancet）杂志上的一篇研究论文，自二月以来一直在感染中国人群的新型H7N9病毒至少从四种不同的鸟类病毒处获取了基因。在这篇文章中，由中科院高福（George F Gao）研究员领导的一个中国科学家小组，通过检测从感染患者处分离的四种不同病毒株的序列，确定了病毒的起源和多样性。

这种H7N9病毒于一个多月前被首次发现，根据世界卫生组织的最新数据，其导致了126人感染，24人死亡。它被发现存在于活动物市场中的鸡、鸭和人工圈养鸽子体内，因此人们怀疑H7N9是在这些动物市场内感染了大量的受害者。

流感病毒名称中的Hs和Ns分别来自两种蛋白：血凝素（hemagglutinin ,HA）和神经氨酸酶（neuraminidase ,NA）。HA蛋白有助于病毒结合宿主细胞，而NA蛋白则是病毒复制后从细胞出芽的必要条件。病毒由HA、NA和内部序列构成，它们的基因之间可以进行重新洗牌，这一过程就称之为重组（reassortment）

中国的科学家们尝试将这些病毒的元件序列与从前来自动物的测序流感病毒株进行匹配。他们发现病毒的H7元件有可能来自鸭子的禽流感病毒，与浙江省的鸭子关系最密切。而病毒的N9元件则与取样自2011年韩国野生鸭子的禽流感病毒NA蛋白最密切匹配。这些动物已知在中国和韩国之间进行定期迁徙。

科学家们认为，携带H7和N9病毒的野生鸟类有可能将它们传播给了驯养的家禽，在家禽体内它们重组为了如今感染人类的H7N9病毒。

此外，病毒的内部基因似乎来自于中国鸡的两种不同的H9N2病毒。而帮助病毒复制的聚合酶基因，似乎与来自一种叫做燕雀的野生候鸟的病毒有关联，这暗示着存在更早期的重组事件。

比利时病毒学家Marc Van Ranst 和Philippe Lemey 在这篇Lanet文章后发表了注评：“在禽类宿主中的低致病性使得病毒能够在家禽和野生鸟类中悄悄蔓延。鉴于中国家禽和野生鸟类种类的数量巨大，控制这种隐藏的大流行有可能非常具有挑战性。”