小中大ChIP是ChIp（染色质免疫沉淀），不是楼主说的Co-IP（免疫共沉淀），二者是风马牛不相及的两个试验和概念，原理和目的都不一样，楼上很多人将二者搞混了.
染色质免疫沉淀的作用是鉴定蛋白与DNA的结合，相当于EMSA（凝胶滞留试验）的体内试验。
基本原理是用抗体将目标蛋白及其它可能结合的DNA沉淀下来，然后用引物扩增DNA的序列。因此这个目标蛋白通常具备转录调节功能，能够结合DNA，目前也有做结合RNA的Chip。
免疫共沉淀的作用是鉴定蛋白与蛋白的相互作用。用抗体将蛋白(A）及其可能结合的目标蛋白（B）沉淀下来。因此这个A蛋白可以是任何蛋白。“共”指反过来用B的抗体也能将A/B复合物沉下来。如果是单向的，通常叫免疫沉淀。
===========================================================================================
我打算做蛋白和miRNA的免疫共沉淀，这个和蛋白与蛋白或chip具体步骤上有哪些不一样吗？希望高手可以指点一下！
