【专题讨论贴】蛋白质组学研究工作该如何深入？ - 经验共享

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标题:【专题讨论贴】蛋白质组学研究工作该如何深入？

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发表于 2013-5-11 17:04 资料个人空间短消息加为好友

小中大

蛋白质组的研究手段现阶段主要还是双向电泳，而双向电泳说到底仅仅就是个技术，无论做多深，无非就是把技术做的好一些。每年硕士博士一毕业，得到的双向电泳数据一大堆，可有用的又有几个？
组学到底给我们带来了什么？仅仅就是一个概念、一种技术加上一大堆越来越多的不知道意义的数据？
我的 God!

remenb[使用道具]
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发表于 2013-5-11 17:05 资料个人空间短消息加为好友

小中大

Well, if trained well, an undergraduate or a technician can do 2DE or 2DLC quite well just like you can, but what's essential is the data mining, hypotheses establishment and validation, from which you draw important biological conclusions, and that's what a Ph.D or postdoc about.

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发表于 2013-5-11 17:06 资料个人空间短消息加为好友

小中大

还是可以深入的
如果你得到很多差一点
那么可以使用通路分析软件，分析
是那个通路在其中有重要作用，就如基因芯片一样
如果点少，这种情况多，就看那些点变化最明显
在看文献，就能找到与他相关的东西，或许就有些有价值的东西

冰儿0109[使用道具]
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发表于 2013-5-11 17:06 资料个人空间短消息加为好友

小中大

作蛋白质组学一定可以发SCI吗,我做蛋白质磷酸化的鉴定可以发什么样的文章呢?另外,请教proteomics的影响因子是多少?还有哪里作蛋白质磷酸化鉴定比较好,价钱公道!!谢谢

fsdd817[使用道具]
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发表于 2013-5-11 17:07 资料个人空间短消息加为好友

小中大

一些蛋白质组学相关的SCI收录杂志：
PROTEOMICS IF: 5.483
rapid communications in mass spectrometry 2.75 (这个期刊审稿特别快，一个月基本上就有结果了，快的时候一两周就有回音)
analytical chemistry 5.45 （这个期刊偏重于新技术新方法）
Journal of Proteome Research IF 6.917 （这个期刊偏重于新技术新方法）
Molecular & Cellular Proteomics IF 9.624 （这个期刊偏重于生物学意义）
BBA-PROTEINS PROTEOM 3.311
COMP BIOCHEM PHYS D (无) Immediacy Index: 0.80. IF估计在4-5。
EXPERT REV PROTEOMIC 2.991
Electrophoresis 4
BBA protein and proteomics 2.1

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发表于 2013-5-11 17:07 资料个人空间短消息加为好友

小中大

相关疾病：
肿瘤
总之，我认为对基因和蛋白的研究
要基于解决临床问题。其实，要是没有肿瘤没有疾病的话，咱做什么信号通路是没有饭吃的。所以做实验真的不要苛求什么通路，什么相互作用，谁磷酸了谁，只要能够真的对解决实际问题有帮助，那才是真正的研究。
呵呵，研究疾病是为了世界上没有疾病，没了疾病，也就没了疾病的研究。

biabiade[使用道具]
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发表于 2013-5-11 17:07 资料个人空间短消息加为好友

小中大

QUOTE:

原帖由 fsdd817 于 2013-5-11 17:07 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
一些蛋白质组学相关的SCI收录杂志：
PROTEOMICS IF: 5.483
rapid communications in mass spectrometry 2.75 (这个期刊审稿特别快，一个月基本上就有结果了，快的时候一两周就有回音)
analytical chemistry 5.45 （这个期刊 ...

这些东西在哪里查呀,Molecular & Cellular Proteomics IF 9.624 有这么高吗？和我查得不太一样呢

glass[使用道具]
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发表于 2013-5-11 17:08 资料个人空间短消息加为好友

小中大

有人把蛋白质组学分为三大块：
1. expression proteomics
2. function proteomics
3. structure proteomics
目前大多数人处在第一块，也就是最基础的那一块，而且多数是2-DE+MS。这部分可能越来越多地成为类似Microarray这样的工具，当然，发现基因、与代谢组学联系等等是很重要的。第二块是目前一些基础较好的实验室正在进行的工作。可以解释很多复杂生物学过程，是传统的功能基因组学所不能代替的。第三块则需要昂贵的仪器以及生物数学模拟等关键技术，只有少数实验室在进行。还有systems biology也离不开proteomics

yhz1973[使用道具]
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发表于 2013-5-11 17:08 资料个人空间短消息加为好友

小中大

相关疾病：
肿瘤
看见这个帖子，还是想讨论一下。
有个困惑的问题：假设是肿瘤，在得到2-DE的数据以后，如果发现有spots的变化，那么如何用充足的数据来证明这个变化是与肿瘤相关的？这应该是2-DE之后最先需要阐明的问题，是否筛查正常人的pool就可以说明问题呢？还是需要进一步的功能研究？望不吝赐教。

NBA[使用道具]
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发表于 2013-5-11 17:09 资料个人空间短消息加为好友

小中大

需要前人的文献
我发现了一些点
做到了一些有意义的东西
发现了一些新的功能
我觉得看与点有关的文献
非常重要
蛋白质组只不过是一个工具

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