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标题:【专题讨论贴】蛋白质组学研究工作该如何深入?

idea2011[使用道具]
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我觉得我跟plaa站在一边
合作?何其难?想合作?行啊。老板的面子怎么样?够大不?能不能共同第一作者、通讯作者啊?被人找着来合作的人有几个缺钱啊?
找到差异蛋白点,怎么就不能检测mRNA水平的变化啊?如果结果一致说明调控可能是在转录水平,如果不一致说明调控环节可能在翻译环节或者蛋白的降解,无论确定在哪一个环节都是非常有意义的吧?
生物信息学分析?你有本事你就做吧。
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相关疾病:
胃癌肝癌
首先不要拍马屁。其次,你的讲法太消极,要积极地想办法解决问题,抱怨是没有任何用处的。

好的仪器绝对的重要。但最重要的是人的idea。尚永丰做得好,是他问题选的好,做得也深,人家那叫本事。

你谈了半天,讲的三点,都是围绕技术来讲。当然喽,要是有这种想法,铁定是没有前途的。蛋白质组要做什么?蛋白质组要解决问题。每次都用相似的方法,能够解决不同的问题,这才是批量发文章,发好文章的策略。

举个假设的例子,我没做过。现在miRNA挺热的,一帮人做mRNA表达,看看是不是下调某些基因的表达,但是有研究表明,很多miRNA并不影响转录,而是在翻译层面起调控作用。你瞧瞧,转录后这不就出来了?可以做的事情,比如,wild-type和过表达某个miRNA,同时看mRNA的转录和蛋白质的差异表达。当然,后续的验证实验一定要做。这样的工作,档次就不低了。OK,你可以讲,这种文章人家发过了吧?没关系,换个组织,比如人家做胃癌,你就做肝癌,照样是好的工作。

另外,计算做到linux上,是绝对没有前途的。我们有经验,一般来说,Windows和Mac是最常见的,linux也就做计算的玩玩,非专业的是不用的。Windows一般是没钱的学生用,老板,尤其是大老板们,一律Mac。有个朋友去开细胞学的会议,说一眼望过去,全部都是大苹果。所以,计算一定要支持Win和Mac。我们就是做软件的,Linux版本的软件基本上没有人下载,Win和Mac下载的都比较多。

定量和分离都只是方法学的。方法学老做有什么意思?今天好一点,明天好一点。除非有特别大的突破,不然好文章是没戏了。做方法学,要么你像mann那样背景雄厚,要么你像Steven Gygi那样锐不可挡,不然基本上也就玩玩JPR, Analytical chemistry, proteomics;MCP基本上就不要去想了。

总结就是,多想想:Where is your question? 你的技术也好,方法也好,仪器也要,要围绕你的question来转,而不是反之。OK,怎么找到你的question?非常简单,第一步,别人用某方法做A,你就用该方法做B;第二步,建立在第一步的基础上,改进改进方法,再去做C。
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QUOTE:
原帖由 idea2011 于 2013-5-11 17:21 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
我觉得我跟plaa站在一边
合作?何其难?想合作?行啊。老板的面子怎么样?够大不?能不能共同第一作者、通讯作者啊?被人找着来合作的人有几个缺钱啊?
找到差异蛋白点,怎么就不能检测mRNA水平的变化啊?如果结果一致说明调控可能是 ...

所以要想办法。你要找人合作,一定要找有所求的人。既不缺钱,也不缺文章的,什么都不缺的,最好交道都不要打,立马走人。因为你跟这样的人不叫合作,也合作不成。

大多数能合作,或者想合作的,要么是缺钱(这个好像还好,基本上都是不差钱的),要么是缺文章的(这个好像大家都缺,谁不缺几篇重量级文章呢?)

接下来,你就得想办法说服你的潜在合作者,跟你合作。说服工作包括两个部分:

第一,成果怎么分。最好办的就是签个合同,大家同意之后签字花押,事先讲清楚。这个不要指望老板。老板们永远是希望自己拿全部,别人喝西北风。所以,要做的事情很多,你得先说服自己老板,成果要分给别人一部分,当然老板要质疑你的决定,你得摆事实,讲道理,对不对?然后就是说服对方,他们只能拿一部分,当然也要讲道理,不能蛮干。

第二,就是你得把科学问题讲的超级清楚。要做什么事情?要解决什么问题?用到哪些方法,为什么合作是必须的?你做哪些工作,对方做哪些工作?为什么跟你合作是对方最好的选择?你必须让对方感觉到,你是他最好,也是唯一的选择,这才有可能合作。比如,对方文章一大把,就是MCP才一篇,你可以琢磨一个MCP及以上的idea,然后告诉她:你会反对再加一篇MCP吗?当然,对方也必须觉得,跟你合作,起码弄个MCP,琢磨一下,多一篇共第一作者的MCP,比第一作者的JPR两三篇好像还划算,那就可以合作了。

简而言之,合作必须要能够产生利益,而且这份利益必须比各自单独工作来的大的多,人家要是一把的JPR,你再JPR,怎么合作?人家手上要是一把的MCP,那你的idea就必须超级的好。要是人家手上有一把的nature,那就不要合作了。
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以前读研究生的时候,听老板讲尚永丰的事情,就说尚极重视文献阅读,车里放的到处都是最新的文献,文献读多了,消化了,idea自然会有的。当然尚也是极勤奋的人,天道酬勤啊。

我这里讲的,是如何通过合作做更好的工作。如果你学不来怎么合作,一个办法是努力提高自己的能力,基本功一定要超级的扎实,另一个办法就是学着怎么去忽悠。比方说,不管什么帖子,你要是感兴趣,上来就先来个“扯淡”,然后证明贴主的确是扯淡,这忽悠的能力就差不多了。能不能合作主要靠忽悠,嗯。就是骗,当然了,骗完了之后是一定要兑现的,不然以后就再也没有人跟你合作了。一般来说,有好的合作者,人再勤奋一点,预期的东西多数是可以兑现的。
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胃癌肝癌
确切的说是四点,第四点跟你说的一样还是做功能,我做功能的方法不多,基本也就是相互作用鉴定,敲除基因之类的,大家经常能在文章上看到,所以只是提到一些很多人经常注意的问题。
现在很多中国人拿到了结果就发文章,根本不注意实验的质量,老板见了中国的文章就毙掉也不是没有理由的。所以我在这里也说这些。
中国人不缺少想象力,不缺少idea,放卫星的人天天有,每天世界上的人也都在骂中国人的东西没信用,这个问题不解决,你天天放卫星,但是还是要给外国人做嫁衣。

但是我极度bs你这种态度,上来就扯淡,凭啥你就颐指气使的对别人。而且你给大家的都是很笼统加泛泛的建议,然后就是批评,做功能我想大家随便看几篇好文章都知道要做,可是怎么做。你那里有973,有重大专项的支持,你找合作当然底气足了,有什么idea你敢说,人家也相信,可是别人的实验室一穷二白的,别人能信多少?绝大多数在这里的战友大部分还是一些中等以下的实验室,手里不过有几个自然科学基金或者省里面的基金,这样的钱去做大规模的实验还是捉襟见肘的,而且从大家问的问题可以看出都是刚刚起步,没有很多积累的。周围的都是穷人,能合作但是也都有限。所以他们的问题应该是如何在有限的条件下深入蛋白组学??

不过,你在合作采取的策略还是很多人应该学习的,你抓住了别人的弱点,自然人家就跟你走了。

l你说没有用,你用过mac么?mac对linux基本是完全兼容的!但是国内由于盗版的原因基本上win的天下,但是国外的基本开发依然是linux的源码,然后有市场了再做win的打包。你想接触最前沿的研究,还是要混linux的。当然万不得已,你可以用虚拟器在win下跑linux的程序,绝大多数人不过是也是终端的使用者,使用习惯问题,大家随意。我极度厌烦某些学生,拿着一个程序跑完了就说得到怎么样的结果,那个程序为啥那么做,凭啥你就说这样的结果?就跟很多人用kit,然后出问题也不知道为啥一样!封装的太好了,大家都当是黑匣子,全部两眼一抹黑了,这种态度不可取!虽然符合多快好省的出结果,但是长远来看不好!

你觉得方法学没有意思,但是你知道这部分每年的利润有多大么?中国一个市场让几家大仪器公司彻底年终利润翻红,几个中国市场的总监那个扬眉吐气啊。但是问题是,你没有方法学的原创,你无论什么时候都要跟在别人后面。但是方法学的探索根本不是几年十几年的功夫,可能是一辈子,是一条路,而且是一条很重要的路,几个做MCP的地方的老板都很重视,可是无奈浮躁之风盛行,很少有人塌下心来的。

你最后说的根据question来转没问题,但是你所说的人家胃癌你肝癌这种投机取巧的思想不可取,你这样的不过是跟风闻屁,不适合长久发展。当然你如果能凑齐好技术,好仪器,好idea当然好,天地人和固然好。但是凑不齐,很多战友也要毕业也要给老板交差的。
大家还是多提一些自己能够成功的经验和例子!
否则这样讨论下去没意义

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扯淡!首先不要拍马屁。其次,你的讲法太消极,要积极地想办法解决问题,抱怨是没有任何用处的。

好的仪器绝对的重要。但最重要的是人的idea。尚永丰做得好,是他问题选的好,做得也深,人家那叫本事。

你谈了半天,讲的三点,都是围绕技术来讲。当然喽,要是有这种想法,铁定是没有前途的。蛋白质组要做什么?蛋白质组要解决问题。每次都用相似的方法,能够解决不同的问题,这才是批量发文章,发好文章的策略。

举个假设的例子,我没做过。现在miRNA挺热的,一帮人做mRNA表达,看看是不是下调某些基因的表达,但是有研究表明,很多miRNA并不影响转录,而是在翻译层面起调控作用。你瞧瞧,转录后这不就出来了?可以做的事情,比如,wild-type和过表达某个miRNA,同时看mRNA的转录和蛋白质的差异表达。当然,后续的验证实验一定要做。这样的工作,档次就不低了。OK,你可以讲,这种文章人家发过了吧?没关系,换个组织,比如人家做胃癌,你就做肝癌,照样是好的工作。

另外,计算做到linux上,是绝对没有前途的。我们有经验,一般来说,Windows和Mac是最常见的,linux也就做计算的玩玩,非专业的是不用的。Windows一般是没钱的学生用,老板,尤其是大老板们,一律Mac。有个朋友去开细胞学的会议,说一眼望过去,全部都是大苹果。所以,计算一定要支持Win和Mac。我们就是做软件的,Linux版本的软件基本上没有人下载,Win和Mac下载的都比较多。

定量和分离都只是方法学的。方法学老做有什么意思?今天好一点,明天好一点。除非有特别大的突破,不然好文章是没戏了。做方法学,要么你像mann那样背景雄厚,要么你像Steven Gygi那样锐不可挡,不然基本上也就玩玩JPR, Analytical chemistry, proteomics;MCP基本上就不要去想了。

总结就是,多想想:Where is your question? 你的技术也好,方法也好,仪器也要,要围绕你的question来转,而不是反之。OK,怎么找到你的question?非常简单,第一步,别人用某方法做A,你就用该方法做B;第二步,建立在第一步的基础上,改进改进方法,再去做C。
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国内现在都是一片赞扬,至少尚的文章在那里摆着。但是也看出很多老板当老板之后不再重视科研。
我知道几个国外的老板,每周还在跟学生交换最新的文献,这是必修课,应该的,没啥好宣传的,但是国内就要被赞赏白天了。

很多人质疑的原因是他有意灌水,按照国外有些大学的规定,博士期间每年的考核是不允许用相同的方法解决问题的,更何况是老板。而尚就用了相同的方法解决不同问题,还多次发表在相似的杂志上。所以很多人认为他胜之不武。

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以前读研究生的时候,听老板讲尚永丰的事情,就说尚极重视文献阅读,车里放的到处都是最新的文献,文献读多了,消化了,idea自然会有的。当然尚也是极勤奋的人,天道酬勤啊。

我这里讲的,是如何通过合作做更好的工作。如果你学不来怎么合作,一个办法是努力提高自己的能力,基本功一定要超级的扎实,另一个办法就是学着怎么去忽悠。比方说,不管什么帖子,你要是感兴趣,上来就先来个“扯淡”,然后证明贴主的确是扯淡,这忽悠的能力就差不多了。能不能合作主要靠忽悠,嗯。就是骗,当然了,骗完了之后是一定要兑现的,不然以后就再也没有人跟你合作了。一般来说,有好的合作者,人再勤奋一点,预期的东西多数是可以兑现的。
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我...是有个973的项目,不过是跟着人家后面玩的,就拿了10万块多一点,还不如个青年科学项目。重大专项我没有。我想有,但是没本事有。我手上的钱,都是我自己一毛一毛挣回来的,没多少钱。但是找合作的时候照样底气足,嗯。是穷人,不表示思想上就可以理直气壮的匮乏。

我上来就说扯淡,因为你讲的确实是扯淡。你又不了解情况,就在那里批评愤青,猜测跟着老板混,猜测拿了很多钱。没钱就不能讲扯淡的东西是在扯淡?非得是愤青,才能讲扯淡?不跟着老板混,就没资格批评本来就是错误的东西?所以说,扯淡的东西,我说扯淡,是没有错的。

怎么做我讲的很清楚了,多看文献多思考,锻炼口才忽悠人,基本技术要扎实。完了。不明白?不明白那就没办法了。

最后,“给老板交差”,这就是扯淡。你是为你老板活啊,还是为自己活?老板要交差,还要靠你?有这种扯淡思想的,科研是绝对做不好的。
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对于老板来说,两件事情,搞钱,招好学生。至于看文献的事情,应该放给学生,第一,学生可以跟踪最新的文献,第二,老板不必花太多精力看文献。没什么好赞赏的,时间要节约着用。

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国内现在都是一片赞扬,至少尚的文章在那里摆着。但是也看出很多老板当老板之后不再重视科研。
我知道几个国外的老板,每周还在跟学生交换最新的文献,这是必修课,应该的,没啥好宣传的,但是国内就要被赞赏白天了。

很多人质疑的原因是他有意灌水,按照国外有些大学的规定,博士期间每年的考核是不允许用相同的方法解决问题的,更何况是老板。而尚就用了相同的方法解决不同问题,还多次发表在相似的杂志上。所以很多人认为他胜之不武。
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越说你还越上瘾了,
你的忽悠不是从现在开始的,从研究生就开始了吧,那个时候仗着你就没少忽悠了其他人了。都说出来就没啥意思了。
你一个人投机取巧,忽悠忽悠也就算了,别在这里误导所有人!

大家自己手里的工作怎么样,大家心里清楚,你说的多看文献多思考,都是废话,长脑子的都知道,还用你说。
从头到尾的建议你除了在否定别人,就是提虚的建议。

你说老板就是搞钱和找好学生,典型的学术政客的做法,这么搞,你好意思让学生叫你老师??你这么做跟放羊的有啥区别?好学生在哪里都能做好,几千块钱自己就做出5以上的文章我也见过,最后老板居然说他教育的好,恶心到家了!这样的教授还不如“叫兽”,除了会叫唤还不如野兽。

上梁不正下梁歪,你这样空手套白狼的老板还不如去做生意,省的误人子弟!你不说话没人把你当哑巴!


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我...是有个973的项目,不过是跟着人家后面玩的,就拿了10万块多一点,还不如个青年科学项目。重大专项我没有。我想有,但是没本事有。我手上的钱,都是我自己一毛一毛挣回来的,没多少钱。但是找合作的时候照样底气足,嗯。是穷人,不表示思想上就可以理直气壮的匮乏。

我上来就说扯淡,因为你讲的确实是扯淡。你又不了解情况,就在那里批评愤青,猜测跟着老板混,猜测拿了很多钱。没钱就不能讲扯淡的东西是在扯淡?非得是愤青,才能讲扯淡?不跟着老板混,就没资格批评本来就是错误的东西?所以说,扯淡的东西,我说扯淡,是没有错的。

怎么做我讲的很清楚了,多看文献多思考,锻炼口才忽悠人,基本技术要扎实。完了。不明白?不明白那就没办法了。

最后,“给老板交差”,这就是扯淡。你是为你老板活啊,还是为自己活?老板要交差,还要靠你?有这种扯淡思想的,科研是绝对做不好的。
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这个帖子,我想大家希望讨论的问题是:“蛋白质组学研究工作该如何深入”。对不对?题目如此。你可以抱怨不公啊,困难啊,但应该会希望听到正面的解答。抱怨有用吗?石康的小说里讲:不要告诉别人你今天难过,因为说了也没有用。

抱怨体制啊,抱怨老板啊,这些都解决不了任何问题。凡事要考虑怎么解决,而不是找客观理由来推卸自己的无能。就这样的体制,这样的条件,能做的好的还是大有人在。所以说呢,学坏容易学好难。

另外,1000块钱发篇5分的文章几乎不可能。我从事的领域,和我知道的蛋白质组领域,5分以上的杂志,是需要版面费的。谁出这笔钱?另外,发一两篇5分文章也没什么,第一,自己研究的东西要形成一个体系,或者说,一个完整的story;第二,要持续不断的发好文章。
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