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标题:【讨论帖】western blotting试验技术讨论

@花开花落@[使用道具]
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原帖由 dreaming 于 2013-5-14 13:36 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

3、电泳
从历届师兄以及个人实验,我觉得蛋白样品在浓缩胶时的电压为80V,时间为20min左右,在分离胶时可以提升到110V,直至溴酚蓝将抛出为止,整个电泳时间大概在120min左右,当然分离胶浓度不同的话时间会有所差别。
4、转膜
...

我用的恒流转膜,根据膜面积来确定转膜时间,比如面积为8.5x10.5cm2,200mA,转膜30分钟即可,另外要更加精确的话,建议只将目的蛋白处的胶转膜,因为整张膜转的话分子量小的会先转完,大的则需要较长的时间,等大的全部转完小的可能已转至滤纸上了。我转过43KD的,膜面积12cmx5cm,96mA,32',基本可以。
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dreaming[使用道具]
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原帖由 @花开花落@ 于 2013-5-14 13:37 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')


我用的恒流转膜,根据膜面积来确定转膜时间,比如面积为8.5x10.5cm2,200mA,转膜30分钟即可,另外要更加精确的话,建议只将目的蛋白处的胶转膜,因为整张膜转的话分子量小的会先转完,大的则需要较长的时间,等大的全部转完小的可能 ...

谢谢您的回复
这种方法还可以省膜,下次试试看
那92KD那个应该转多久呢
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箭头儿[使用道具]
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算起来我做WESTERN也有一年了,中间经历了很多,下面我也来谈谈;
自己做了近100次wb,说下体会
1,样品:样本一定要好,也就是说造模型一定要严格控制条件,只有模型成功了才能有好的结果,否则后面即使WESTERN条带做得再好看也得不到好的趋势图。再次就是提蛋白,一定要注意在冰上操作,使用的裂解液我用过biyuntian的RIPA(强,中,弱)还有p0013b,c都用过,有时蛋白做不出来我一个样同时用好几种裂解液提蛋白,分别作western,看那种裂解液效果好,然后找到一个相对好的就一直用了。
2.定量:开始做western时每次都做BCA蛋白定量,后来发现做得曲线拟合度特别好,做完后内参还是不一致。后来干脆都不定量了,开始时对组织一定要称量,以前不称量发现有的发光后相差好几倍,所以一定要称量,这也相当于定量,使数量级一样。现在我基本上不定量,每次提完样先每个加5ul做一次内参,然后根据内参曝光结果再做微调。不过有时调2,3次还调不奇,最郁闷的是同样的上样量,今天做和明天做都不太一样。有时候一起跑的二块胶结果都不一样。所以得到一个一致的内参真是可遇不可求。可能是我的方法不成熟,或是westernt体系不稳定,欢迎大家指点如何调内参一致。
3,灌胶:用过博士德的AR0138很便宜,也很好用,也用过碧云天的配胶试剂盒,稍微比博士德贵点,康为世纪的相对很贵,300多,听说他们的定位是中国的abcam,定位为高端产品,质量不错,由于考虑价格,我还没用过,不过听别人说很不错,因为他们的东西都是用进口的。
4,上样,样品我现在一般煮10min,效果不错,用得是碧云天的5乘上样缓冲液
5,跑胶,理论上电压越小,分离得越好。我一般,浓缩80,分离120。也试过90,130,或者100V跑完全程,效果都可以,我觉得关键在于胶要配好,电泳液要配好。
6,转膜,半干转,湿转我都做过,由于湿转花的时间太长,我现在一般半干转,开始时我们科一般用恒压25v,30min做100KD,用得是0.45PVDF膜,但是特别容易转过,有时转20min都转过了,后来一次偶然的机会一个同学发现0.2um的PVDF转的效果特别好,转不过,后来我们就一直用0.2的了。为了摸转膜条件,我经常25V,分别转30min,45min.60min,75min,分别试分别染胶染膜看效果,也是过30v,35v恒压转30min,45min,50min,虽然伯乐半干转要求不能超过25V,但实际上超过了也没事,但就是转完后膜有一些发热。后来一次机会到别的科师姐那做半干转(她们用的是六一半干转),他们做了很多100以上的分子,都是横流,膜面积*5,做得都不错,我在我们科做130左右的蛋白一直做不好,那次用他们的转膜方法作出条带了,所以他别高兴,后来就一直用横流了,他们m膜面积*5用的是普通滤纸,我们用的是伯乐超厚滤纸,后来我在伯乐半干转上用普通滤纸,横流膜面积*5,50min,也能作出130左右的蛋白了,现在我又做了一些改进,用超厚滤纸,横流,膜面积*5,35min做100一下的蛋白,效果不错。三明治各层之间不要有起泡,
7,封闭,5%的脱脂或者3%的bsa ,我现在一般37°,90min,效果不错,背景很少,但背景与一抗好不好,洗膜等有关
8 孵育,有封口袋加静音混合器4度过夜摇法,以及膜倒扣法,有时想快点出结果,我试过一抗RT90,60min,都可以,但4°过夜效果好一些
9洗脱,一般6in*3次,PBST
10,显影,用的是伯乐的曝光系统,很方便The immunoblotting was visualized with ChemiDocXRS (Bio-Rad Laboratory, Hercules,CA
欢迎大家指正
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@花开花落@[使用道具]
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原帖由 dreaming 于 2013-5-14 13:37 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')


谢谢您的回复
这种方法还可以省膜,下次试试看
那92KD那个应该转多久呢


92KD的带我没单独转过,只是以前整张膜转的时候转过,大概10cmX12cm,200mA,45-50min,具体的只能自己摸索了,如果不需要整张转的话建议只转目的带大小的胶,不过切胶的时候注意别把目的带切掉了。可以隔一段时间掀开看下,看胶上marker还有不。
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@花开花落@[使用道具]
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确定胶上蛋白转完与否,可以转膜之后对胶做个考染,看目的蛋白处还有条带不,也可以更好地确定转膜时间。
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89tongzijun[使用道具]
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最近做western比较郁闷,目的条带背景较高,不清楚,而内参条带清楚,请大家帮忙分析下原因。
我们实验室是半干转,封闭3h后一抗孵育4度过夜,二抗一般孵育半小时。
还有就是压片时看着条带清楚,怎么压出片来看却很模糊呢?
请高手指点。谢谢!急!急!急!
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@花开花落@[使用道具]
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原帖由 89tongzijun 于 2013-5-14 13:41 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

最近做western比较郁闷,目的条带背景较高,不清楚,而内参条带清楚,请大家帮忙分析下原因。
我们实验室是半干转,封闭3h后一抗孵育4度过夜,二抗一般孵育半小时。
还有就是压片时看着条带清楚,怎么压出片来看却很模糊呢?
请高手 ...

背景高有几个原因:二抗浓度高;洗二抗时间不够;在显影液中显影时间长;胶片曝光了。
压片时如果看到荧光很强,曝光时间就要降低,我有一次只曝了15秒,显影后条带还很黑,条带模糊是压片时间过长,导致荧光也把条带周围的区域曝光了。用灵敏度低一点的蓝色胶片会好一点。
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两种蛋白分子量相差多大可以进行一次电泳或是混合一抗?
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flower-201[使用道具]
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WB,我要用到LC3抗体,想知道LC3A/B/C是怎么回事啊?
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问大家个问题:
如果同一批蛋白,做几个不同的指标,每次上样量都一样,每一次做目的蛋白的同时都要做内参嘛,还是内参只做一次就可以了,或者内参做个2-3次如果重复性很好以后的其他目的蛋白就不用做内参了?因为看好多文献做许多目的蛋白但是只给一次内参条带,不知道是为了节省文章容量少放点图还是实际实验操作中就是只做一次内参的。
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