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标题:【讨论帖】蛋白研究技术答疑专贴

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刚开始做蛋白,我想请教一个基础的问题,望帮助解答。
现在基因的表达一般是表达一个开放阅读框,但是对于一些蛋白表达一个完整的开放阅读框往往没有太大的必要,例如:表达一种蛋白做基因亚单位疫苗,仅仅表达具有免疫原性的一段基因会不会更好些?还有就是用原核表达的蛋白,基因太长表达的蛋白太大容易生成包涵体。因此,优化表达一段基因是非常有必要的。但是如何优化表达?小弟才疏学浅,还请赐教!
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3648755[使用道具]
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补充一下:基因的密码子容易优化,但是 基因的长度如何优化?
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plaa[使用道具]
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您好!
我在Western blot实验过程中发现某蛋白X在细胞内和细胞外蛋白的分子量不一致,细胞内有两条蛋白带,而分泌到细胞外后则只有一条蛋白带。
现在推测:
(1)X蛋白在向细胞外分泌过程中发生了蛋白质翻译后的去修饰,比如磷酸化和乙酰化。
(2)X蛋白在向细胞外分泌过程中蛋白质发生了发生了截断。
那么通过什么手段可以知道蛋白条带1和蛋白条带2之间的变化:蛋白序列变化、蛋白修饰变化。
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您好,版主。我现在做唾液淀粉酶糖基化与非糖基化,以WB分离二者,一个56kD,一个62kD;膜是0.45的PVDF膜。再次请教您下转膜的方法,您上次推荐的是湿转、10V过夜转,那请问这个过夜有没有个时间范围?再一个,我之前以100mA、2.5h,有没有可能转过头(marker很淡、胶考R250染未见残余)?dying 4 ur immediate reply!!!

====================================================================================================

时间范围 8h~14h左右吧,不过以100mA、2.5h,不大可能转过头,但是您说的 “marker很淡、胶考R250染未见残余” 这种情况很难解释了
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您好!我想请教您关于检测蛋白质的乙酰化和甲基化的具体方法,看了文献感觉它的意思是先用一个乙酰化抗体把蛋白质沉淀下来再用该蛋白的抗体对沉淀下来的蛋白进行western检测,但是具体操作还是不懂
谢谢!

======================================================

1、用乙酰化抗体进行沉淀的话相当于是一个用抗体对相应抗原的富集过程
2、沉淀的产物用来进行WB检测
3、具体的操作第一步要了解IP的过程,第二步是做WB检测
搜一些关于IP的protocol吧
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您好!
我在Western blot实验过程中发现某蛋白X在细胞内和细胞外蛋白的分子量不一致,细胞内有两条蛋白带,而分泌到细胞外后则只有一条蛋白带。
现在推测:
(1)X蛋白在向细胞外分泌过程中发生了蛋白质翻译后的去修饰,比如磷酸化和乙酰化。
(2)X蛋白在向细胞外分泌过程中蛋白质发生了发生了截断。
那么通过什么手段可以知道蛋白条带1和蛋白条带2之间的变化:蛋白序列变化、蛋白修饰变化。

=====================

这个蛋白存在修饰情况吗?
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这个蛋白存在修饰情况吗?

=============================================

有文献报道,此蛋白存在乙酰化修饰,而且位点不止一个。
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箭头儿[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 www.1 于 2013-5-22 20:02 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
这个蛋白存在修饰情况吗?

=============================================

有文献报道,此蛋白存在乙酰化修饰,而且位点不止一个。


如果存在修饰的情况
是会出现不同的分子量
如果可能的话
你可以选择这个蛋白的乙酰化抗体进行检测试试
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fox_79[使用道具]
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我还想请教一个问题,做western blot时要切多宽的胶才能保证把目的条带切到呢?我检测一个90kd的蛋白,在marker70稍稍下面一点切胶,曝光后还是有好几个样品的条带被切掉了,从没切掉的条带看也是在紧紧挨着70kd边缘,这是怎么回事呢?如何避免这种情况发生?
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fox_79[使用道具]
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还有不知道有没有哪位前辈做过IGF2这个蛋白的western blot?它只有7.5kd,摸了几次条件,都没有把它跑出来
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