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标题:【讨论帖】蛋白质组学研究到底有多大意义?

pencil菲[使用道具]
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这让我想起了哲学中的一种说法,万物从起点开始,最后还是要回到这个起点。我们想想吧,最初,我们只能根据某一生物的外在表型来区分差异,选择优良,后来,出现了经典的孟德尔遗传定律,人们认识到了基因的存在及其重要的作用,于是开展了轰轰烈烈的人类基因组研究,再后来,又意识到基因必须经过转录,变成RNA然后才能发挥作用,于是又有了转录组学的出现,现在的蛋白质组学,是不是也是一个过度时期呢?因为表型是生物体所有性状的总和,那最后,我们是不是还是会回到研究表型性状呢?

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“黑格尔式的重返”?!
cuturl('http://www.dxy.cn/bbs/thread/826811')

这个帖子也谈了相关得思路,值得一看!
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qhyu[使用道具]
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看了各位DX的贴子很长见识,我个人认为一个新技术、新概念的出现总会遇到这样那样的不同看法,但时间会证明一切。自从人类基因组的完成和新技术的出现,人类关于生命科学的研究别无选择进入到蛋白质研究的领域。这也是人类的进步。也象hongbaowang 战友所说的事物发展的一般规律。毕竟蛋白质是生命现象最直接的载体。
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dog002[使用道具]
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^_^个人认为,不管这个组还是那个组,其本质都是为了研究生命。

研究基因组时,当时的人们认为,DNA决定了一切,可以解释像人是怎么创造出来的,生命是如何制造的,从而人造生命。

结果发现DNA序列并不能解释这些问题!

进入后基因时代,即蛋白质组时代,DNA就4种,而蛋白质至少有20种。不同物种之间,它们的DNA序列可以相差的不多,但是蛋白质层面上就差了很多了。就估计是蛋白质的“制造”和“分配”产生了生命,于是蛋白质组就开始了。

所以蛋白质组学的意义就是:
1。通过蛋白质组的研究造出一个生命来,比如把一些蛋白的表达DNA联起来,人为的造出一个病毒来,可以自由复制和传播的。
2。或者证明通过蛋白质组学的研究不能完成step 1。寻找下一个可能完成这个目标的研究项目!^_^
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veiwu[使用道具]
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楼上说的有道理。不过我觉得你说得其实是蛋白质组学的最终目标,也就是把细胞在某一状态下的所有蛋白质一起研究,以此来加深人们对生命的理解。不过实现这个目标有个手段的问题,这才是我开启这个话题的原因。想法,或者说是目标可以有很多,但是能不能实现很重要。我的感觉是现在的技术手段离这个目标差得很远,所以我才会说现在的蛋白质组好像有意义的只有差异表达的检测。
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yueban-1147[使用道具]
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发表拙见,以期抛砖引玉:
愚以为目前很多实验室都把蛋白质组技术当成一个独立的技术平台在运作,从提样品到鉴定一直就在这个圈内,并且如前面各位所说质谱鉴定的科学性和可靠性也是让人质疑的,给人的感觉就是王婆卖瓜了。那么我们最需要的就是将这种可以说是化学的鉴定手段与传统的经典的生物学实验手段结合起来,一来验证质谱鉴定的结果,二来把这些结果真正与生命本身联系起来,从微观和宏观两个方面共同探讨一些蛋白的意义。
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831226[使用道具]
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现在的蛋白质组好像有意义的只有差异表达的检测。

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^_^也许应该是“差异表达”的入门门槛比较低把。只要有钱,把一堆仪器一买,钱越多,结果越好,反正都有protocol。
蛋白质组还是有其他方面的。
eg:
Design of a novel globular protein fold with atomic-level accuracy.
Science. 2003 Nov 21;302(5649):1364-8.
PMID: 14631033 [PubMed - indexed for MEDLINE]
利用电脑设计蛋白结构。 也许以后就像”终结者“一样,生命也是可以设计的。

Evolution and evolvability of proteins in the laboratory.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Mar 23;101(12):3997-8. Epub 2004 Mar 15. No abstract available.
PMID: 15024102 [PubMed - indexed for MEDLINE]
这是一个commentary,介绍了在实验室内改造protein来应用。^_^也许生物武器就是这样来的!

还有其他很多方面,感觉上就是把生物当成一台机器,把上面的零件拆下来研究研究,看看能不能改进!^_^
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star#room[使用道具]
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从2-DE 到MS完成实验周期一般是多长?
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PINK[使用道具]
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从我个人来看,蛋白质组研究的潜力还是很大的,在药物靶标筛选、重大疾病治疗还是有一定作用的,至少有些潜力还有待于进一步发掘。但是目前我最深刻的体会就是:没钱千万别淌蛋白质组这道河。
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veiwu[使用道具]
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^_^也许应该是“差异表达”的入门门槛比较低把。只要有钱,把一堆仪器一买,钱越多,结果越好,反正都有protocol。
蛋白质组还是有其他方面的。
eg:
Design of a novel globular protein fold with atomic-level accuracy.
Science. 2003 Nov 21;302(5649):1364-8.
PMID: 14631033 [PubMed - indexed for MEDLINE]
利用电脑设计蛋白结构。 也许以后就像”终结者“一样,生命也是可以设计的。

Evolution and evolvability of proteins in the laboratory.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2004 Mar 23;101(12):3997-8. Epub 2004 Mar 15. No abstract available.
PMID: 15024102 [PubMed - indexed for MEDLINE]
这是一个commentary,介绍了在实验室内改造protein来应用。^_^也许生物武器就是这样来的!

还有其他很多方面,感觉上就是把生物当成一台机器,把上面的零件拆下来研究研究,看看能不能改进!^_^

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你说的这些好像不是蛋白质组吧,应该说是蛋白质工程才对。蛋白质工程就是认为改造天然蛋白质,创造出自然界没有的,但是性能比天然蛋白更出色的人造蛋白质。
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8princess8[使用道具]
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相关疾病:
肿瘤
为什么不是??
抱歉,我对概念历来理解的不好,^_^考试的时候,名词解释总是错误一堆。
个人认为:蛋白质工程应该属于蛋白质组

像我一个朋友,他的课题是:研究某遗传性癌症的机理,并进行药物研究。现在发现当某个蛋白中的某个AA发生突变的时候,癌症的几率会大大的提高,现在他的目的是研究那个蛋白的结构和功能,以及mutant的结构和对功能的影响,最后达到设计基因药物的地步。

这个课题应该算蛋白质组中的蛋白质工程的应用。
总不能说他开始用蛋白质组学确定了病变蛋白,然后用蛋白质工程。。。。
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