蛋白质与蛋白组学

在群友谈到的四点中，基本上都可以实现 “高通量”了，只是money的区别。
最后推荐一篇文章把。相信这也是“高通量”的把。

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我不认为他说的四点都可以实现高通量。高通量的意思是说可以并行同时分析大量样本，比如说现在的pcr基本上可以几百个一起做，这才叫高通量。而蛋白质分析绝对不可能做到这样，即使有钱，也要做很长时间，这也就是你说的那个加拿大国家计划为什么要持续这么长时间的原因。对于蛋白质的结构和功能分析，我现在还没听说过有哪种方法能哪怕是两个一起并行做，现在的技术对分析蛋白的结构或者分析其功能都只能一个一个去做，而且在中国做出一个来就可以让一个博士毕业了，也就是说要经过几年的功夫。这样的分析速度怎么可以称作高通量？
你说的那篇文章我想我应该看过。是不是把果蝇细胞内的好像是3000多个蛋白质的相互作用网络给做出来了，还配有一张很详尽的图。其实我当时只是看到了这张图，并没有看全文，也不确定我看到的是不是就是你说的这篇文章，不过我觉得应该就是。可这样一张网络不是那一个课题组做出来的。果蝇从上世纪三十年代起就作为模式生物进行研究，到现在都八十年了，世界上有数不清的实验室做过果蝇的蛋白质，这张图只不过是把现成的结果给综合了一下罢了。所以说为了这张图，人类一共用了快一百年了，这再怎么说也不能称之为高通量吧。如果要做另外一种生物的这么一张图，不知道还要花多久。况且这张图也没有包括果蝇的所有蛋白质，也没有能够指出所有的蛋白间相互作用，更别提不同细胞，不同生理状态下的具体情况了。

偶也来凑凑热闹。蛋白质组学的研究策略，有两种。一种可称为“竭泽法”，即采用高通量的蛋白质组研究技术分析生物体内尽可能多乃至接近所有的蛋白质，这种观点从大规模、系统性的角度来看待蛋白质组学，也更符合蛋白质组学的本质。但由于蛋白质表达随着空间和时间而不断变化，因此要分析生物体内所有的蛋白质是一个难以实现的目标。另一种策略为“功能法”，即研究不同时期细胞蛋白质组成的变化，如蛋白质在不同环境下的差异表达，以发现有差异的蛋白质种类为主要目标。这种观点更倾向于把蛋白质组学作为研究生命现象的手段和方法。
　　
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呵呵，我想知道这段话是从那里考过来了，在这个话题下已经有至少三个人的贴子里出现了这段话。贴个原文联接吧。

呵呵，我想知道这段话是从那里考过来了，在这个话题下已经有至少三个人的贴子里出现了这段话。贴个原文联接吧。

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呵呵！偶对蛋白组学是一个门外汉，只是平时没事看着玩，这篇文章对蛋白组学讲的很详细，不敢独享，相当于一篇蛋白组学研究进展的一篇综述，感觉很好，贴出来分享！链接如下：
cuturl('http://www.stcsm.gov.cn/learning/lesson/shengwu/20030211/lesson-4.asp')

也就是说要经过几年的功夫。这样的分析速度怎么可以称作高通量？

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是啊，在中国是没法进行高通量，但并不代表着在世界没法进行高通量。说到底还是“钱”得问题啊！
在日本大阪，据说一个蛋白，15KD以下，只要它能用NMR解结构，从得到数据起，1个人15天就可以submit到PDB中去了。

至于那张图，推荐看看全文把，不是简单得综合，而是把全部得interaction都用Y2H验证过了，并且不止原有得，还发现了很多新得。看完你会有所feeling得。

就我所知，现在得蛋白质组研究，如果是以某种病毒为载体（如SARS－CoV），就是把它得所有ORF都找出来，看看结构(genome structure)，所有得interaction，然后再受体啊，抑制剂啊，药物设计啊。只有像人这样得复杂生物，需要得是全世界得能力，例如中国就分到了肝脏。 为此中国投入了多少钱！！！！

至于“比较蛋白质组学”，这只不过是第一步而已，仅仅是能看出初步的“不同状态下细胞蛋白质组的变化” ，能说明为什么吗，能预测吗？

如果你有时间，有兴趣，建议去看看那个肝脏得项目把，我觉得那个项目是中国最好得蛋白质组得项目了！

相关疾病：
肝癌

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是啊，在中国是没法进行高通量，但并不代表着在世界没法进行高通量。说到底还是“钱”得问题啊！
在日本大阪，据说一个蛋白，15KD以下，只要它能用NMR解结构，从得到数据起，1个人15天就可以submit到PDB中去了。

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这好像不光是钱的问题，更多的是技术问题。15kD以下的蛋白占的比例好像并不多，要用NMR解析还要解决溶解问题。就这样还得15天才能搞定一个，并且还是“从得到数据起”15天，那么得这些数据药多久呢，纯化一个蛋白就够做得了。这不是有钱买多少超贵设备就能解决得了的，是技术上存在瓶颈。跟现在已经公认达到高通量分析的核酸一比就知道技术上的差距了。