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标题:【讨论帖】蛋白质组学研究到底有多大意义？

veiwu[使用道具]
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发表于 2013-6-3 15:09 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
蛋白质组研究在国内已经成为一种时尚和潮流，从最近的蛋白质组大会的论文上可以看出，国内蛋白质组研究已经遍布生物学各领域，动物，植物，微生物，育种，繁殖，发育。而且还有一些试验技术的改进和探索。我觉得其实大家不要一窝蜂的把自己的研究成为蛋白质组研究，有的就是生物质谱而已。我觉得生物研究应该以试验目的为核心，围绕这个目的来选择试验方法作为工具。现在生物质谱用起来很方便，大家不妨结合原有的技术联用一下生物质谱，可能会起到意想不到的效果。
蛋白质组研究并不是越大，越全则越好，试验思路好的话，瞄准一个小的目标，用生物质谱技术攻克，就能发一篇不错的文章。关键是思路。蛋白质组的优势是解决别的技术不能或者不好解决的问题，而不是万金油，哪都能抹一抹。
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kuaizige[使用道具]
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发表于 2013-6-3 15:10 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

我觉得蛋白质组学本身是有意义的,做蛋白质组是无可厚非的,是要做的,但不是一哄而上,蛋白质组现在是泡沫,有其国内的人都开始赶时髦,好多单位都要做,国家真有这么多钱吗?但最后做的怎么样?大家都可以看见,简直又回到50年代,大炼钢铁了! 我只是对目前这种科研状态表示忧虑.
我觉得蛋白质组的意义在于分析一个细胞或组织在不同的生理状态下整个蛋白质的变化情况, 来全面了解蛋白质的的行为. 所以,蛋白质组必须走向定量化, 分析蛋白量的变化. 大家应该都知道国际上作蛋白质组最牛的人吧. 南丹麦大学的Matthias Mann, 他的研究基本上在引领蛋白质组的发展方向
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u76mp[使用道具]
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发表于 2013-6-3 15:11 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

本人虽是个门外汉，但也认为讨论这个问题的确很有必要。从各位的讨论中学到了不少东西。目前从未做过蛋白组学方面的研究，但可能准备在这一方面开展血管方面的研究作为本人的博士课题。
cryptic写道：
“蛋白组学可以分为“完全蛋白组学”和“差异蛋白组学”，完全蛋白组学的意思就是类似基因组学的研究一样，把所有的蛋白都鉴定出来建成数据库，但目前的蛋白组学技术十分不成熟，所以不现实。因此，差异蛋白组学的现实意义就很大了，简单说就是通过比较“正常”和“异常”，处理前后....，得出有意义蛋白，鉴定就只能一个一个的来了。 ”
就我目前浅显的水平认识从“差异蛋白组学”进行研究比较有临床意义，也比较容易实现，通过比较正常组织和异常组织的蛋白差异，可以发现疾病的特异表达蛋白，这对于某个疾病的早期诊断或提供药物治疗的靶目标应该说具有重要的意义。
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发表于 2013-6-3 15:14 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

应该说做蛋白质组是一个历史的必然。我蛋白质是生命活动的具体执行者。从蛋白质入手上可以达到DNA,RNA水平，下可以和生理活动联系起来。
完全的蛋白质组研究和差异蛋白质组研究其实是从两个方面走向一个终点。就如同爬山，一个从南坡爬一个从北坡爬。有了完全的蛋白组学我们可以知道一个生物正常发育。差异的蛋白组学可以让我们找到如何去应对各种不良因素的挑战（包括自然的和非自然的，包括动植物和人本身）
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发表于 2013-6-3 15:14 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
我觉得大家似乎不是担心蛋白质组学的研究有无意义，而是都对蛋白质组学的研究进展过缓或者说伪“高通量”感到不满。我个人觉得抛开前人对各个体蛋白质的研究来谈纯粹的高通量有点不可思议，因为没有对个体蛋白质的研究谈何一个细胞甚至一个组织整体活性蛋白质的了解？更不必说各种活性蛋白质之间的互作了！所以这种时候谈功能蛋白质组条件未必成熟，而对表达蛋白质组进行研究是一种切实可行的策略。就像以前DNA序列的研究一样，后来出现的各种数据库都是总结的前人的工作不断充实和改进的结果，我想蛋白质组学的研究也应该是一个这样的过程，想一蹴而就是不现实的。像前面说的那个果蝇蛋白质组互作图，这是一篇很为人津津乐道的出色工作，我也看过，我觉得虽然可以肯定这个图只是一个大致，甚至以后会发现里面必然有不少错误，但是它并不妨碍人们把它看成一件出色的工作，它也确确实实代表了一种蛋白质组的研究策略或者说目标。个人认为现在研究单个的基因和单个的蛋白质对人类来说已经是一件很轻松的事情了，但是基因的调控机制和蛋白质之间的互作就另当别论了，而这也是人类最终解码生命奥秘和疾病治疗以及创造新的生命体的必须跨越的难题，任何一种新的技术，甚至还没有发现的将出现的技术，都是为了这一目标服务的，前人以及今人的工作也是为了以后的这一目标服务的。
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发表于 2013-6-3 15:15 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

蛋白质组学，很大程度上是一种或者一类技术，具体用这种技术研究什么以及发现什么有意义的信息，要看设计者的思路以及这项技术本身功底的深厚程度。就象是PCR，这个化时代的技术手段，给人们带来的不只是基因序列的扩增一样。
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 小中大

看了各位的高见,心里颇有感受,我认为蛋白质组学是生物技术发展到这一阶段的产物,目前关键的问题不是研不研究的问题,而是怎么样来改进研究方法更好的研究的问题
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yueban-1147[使用道具]
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发表于 2013-6-3 15:15 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

对不起,必须纠正一下,蛋白质组研究的一个策略鸟枪法的英文名是shotgun,不是shortgun,蛋白质组专业的朋友们不能犯这个错误！
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阿凡提[使用道具]
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发表于 2013-6-3 15:16 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

看了各位的高见,心里颇有感受,我认为蛋白质组学是生物技术发展到这一阶段的产物,目前关键的问题不是研不研究的问题,而是怎么样来改进研究方法更好的研究的问题
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yueban-1147[使用道具]
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 小中大

利用蛋白质组的手段，找差异，是其中的一个重要的方面。这种差异即体现在量上（表达量的高低），也表现在质上（有，或者无）。但是，仅仅是把蛋白质组研究局限于此，那就有失偏驳了。正如haoyw战友所说的，利用蛋白质组的手段，进行整体的分析蛋白的表达规律和行为特点，把细胞乃至集体的信息点（如，相互作用，信号通道等）以相对更加概括的手段连接起来，形成一个信息网络，或者说生活活动规律的信息有机体，这可能更是蛋白质组多追求的重要目标。诚然，蛋白质组发展还只是刚刚开始不久，很多新的技术手段还有待开发和完善，目前所能解决的问题可能还相对有限，但，把它放入科技发展的长河中一看，可能会对它发展的看法更加积极和乐观。 抛一砖。。。。。。。
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