蛋白质与蛋白组学

请教楼主：
我电泳时，溴酚兰指示剂总压不成一条带，并且跑到底端时开始变黄，不再泳动了，这是什么原因啊

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这种情况一般都是缓冲液的问题。
1、电极缓冲液使用次数过多，建议重换；
2、凝胶缓冲液pH不正确，建议调准确。

楼主，我想问一下10％分离胶和4％浓缩胶用36mA恒流来跑电泳会不会不适合？是否电流太大了点？
还有，电泳时放把整个电泳槽放在4℃低温下进行电泳是不是合理的？为什么？

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1、应该没有问题，不过可适当减小点，防止过大产热。
2、没必要放在4C，从理论上来说也没什么妨碍，不过可能回使电极上锈。

请教搂主：我最近在跑一个分子量约170KD的蛋白，基层胶和分离胶都是5%，用的是恒压，100V，跑的效果不是很理想，丽春红染色后100KD以下条带都很清楚，但100KD以上就很模糊了，杂抗体后显影出来也是如此。请问有什么办法可以解决吗，除了5%，浓一点的分离胶可以吗？另外，在同一块胶上，我还需要跑分子量为42的内参，不知道如何才能把这两个蛋白都跑出来，我已经失败了N次了，急盼回复，谢谢

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170KD的分子量不算小，你的积层胶用5％可能有点大，可以适当的调低点，比如3％，分离胶可以适当大点，6－8％，试试看吧。
分子量差异比较大，我没有做过，你可用上面的浓度先做一下电泳，看看能不能把你分子量相近的蛋白有效分开。