蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【讨论帖】SDS-PAGE电泳求助专用帖

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:【讨论帖】SDS-PAGE电泳求助专用帖

zranqi_1[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 77471
精华 0
积分 409
帖子 497
信誉分 100
可用分 3298
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-17
状态 离线
471
 

我的样品是水稻穗子,用TCA丙酮法提取蛋白,裂解液配方为尿素(9M/L),2%CHAPS,50mMDTT,微量PMSF。电泳条件:12%分离胶,5%浓缩胶,25mA恒流,银染。结果蛋白条带不清晰,不知道是因为什么原因,请高手指点!!!!
顶部
bluelake[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 76389
精华 0
积分 382
帖子 444
信誉分 100
可用分 3046
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-4
状态 离线
472
 

请教一个问题,我现在要跑的一个蛋白分子量是289KD,不知道这么大的蛋白用10%的分离胶是否可以分开?电泳的时候用的是130v,最大的marker是116kd,所以等最大的marker跑大底的时候才停止电泳,然后把整张胶都转下来,不知道这样是否能够保证我的目的蛋白能够分开?
转膜用的是湿转,400MA 3小时,这个条件能行吗?
我已经做了几次了,结果都不是很好,第一次条带特别的淡,由于买不到这么大的marker,也不能比对是不是目的条带,顺便请问一下在哪里可以买到这么大的marker?第二次做出来的结果条带虽然有但是条带看起来很模糊,还有弥散和拖带的情况,急盼请指点!
顶部
abc816[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 77362
精华 0
积分 775
帖子 1190
信誉分 100
可用分 6817
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-16
状态 离线
473
 
整个帖子都看了一遍,真是获益非浅啊!我有个问题请教一下:你们做SDS-PAGE时配胶的配方都是参考哪本书的?我看了几处:《分子克隆》、郭尧君《蛋白质电泳实验技术》、汪家政《蛋白质技术手册》。虽然大体意思都一样,但是配胶的方子有很大的不同呢!请问各位有经验的电泳高手,哪一种配方比较好用呢?正在困惑中!谢谢了
顶部
kuohao17[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 77299
精华 0
积分 559
帖子 716
信誉分 101
可用分 4453
专家分 10
阅读权限 255
注册 2011-11-15
状态 离线
474
 
汪家政的《蛋白实验技术》,我认为越经典的方法越实用。

===========================================

整个帖子都看了一遍,真是获益非浅啊!我有个问题请教一下:你们做SDS-PAGE时配胶的配方都是参考哪本书的?我看了几处:《分子克隆》、郭尧君《蛋白质电泳实验技术》、汪家政《蛋白质技术手册》。虽然大体意思都一样,但是配胶的方子有很大的不同呢!请问各位有经验的电泳高手,哪一种配方比较好用呢?正在困惑中!谢谢了
顶部
yapuyapu[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 76072
精华 3
积分 574
帖子 695
信誉分 106
可用分 4338
专家分 30
阅读权限 255
注册 2011-11-1
状态 离线
475
 
《分子克隆》、郭尧君《电泳实验技术》、汪家政《蛋白质技术手册》。虽然大体意思都一样,但是配胶的方子有很大的不同呢!

===========================================================================================================

哈,应该说任何一个都可以,以分子克隆为首,三个都够经典的。但不知你所说方子很大不同在何处?母液不同则方子肯定不同,但缓冲液、SDS终浓度都是一样的。AA母液的比例倒是会有点差别,结果是最佳分辨效果会有差异,但一般为29:1或29.2:0.8,上下比例都可以。Ap和TEMED两个催化所用可以根据凝胶聚合速度随意调整。

郭尧君的因为专门讲电泳,所以在原理和应用方面更加详细。你参见郭的相关章节肯定有详细叙述并可释你所疑。
顶部
hustwb[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 76894
精华 0
积分 463
帖子 524
信誉分 101
可用分 3523
专家分 10
阅读权限 255
注册 2011-11-10
状态 离线
476
 

谢谢各位的精彩回帖。小弟有了很大的受益!!!!
这两天做Western blot,蛋白分子量43kd,我用12%的分离较,5%的积成胶,上样量50ug,用5*loading buffer, 恒压先80V,marker分层后110V,一直跑到底, 转膜用恒流200mA,3h,脱脂牛奶封闭过夜,一抗(1:300;500;600;1000)都试过,室温摇床2h,二抗(HRP)(1:6000;7000;8000)都试过,室温摇床2h,洗都是TBS-T 15min*3,ECL时没有荧光,曝光什么都没,然后用DAB显色也是没有条带,但用丽春红染有明显条带。
请教各位: 1.我的试验过程及条件是否合适,那里需要改进?
2.我的胶跑的自认为还行,没有歪,marker的条带分的很清楚,不知到这样算不算跑胶没问题;
3.丽春红染有条带,DAB无条带,是不是我的目的蛋白没转上,或者转过了?我的首要问题是想知道我的膜上有没有我得目的蛋白,怎么可以知道啊?或者我提蛋白是没有把目的蛋白提出来?
4.会不会是一抗与目的蛋白结合的问题,或者是一抗跟二抗结合的问题,怎么排除?
5.我很菜,做了好几次都没结果,好难过,我一个人在黑暗中摸索,不知道问题出在那里,不知道该怎么尝试,郁闷,希望得到各位的帮助, 给点意见,谢谢啊!!!!
顶部
S6044[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 75117
精华 0
积分 559
帖子 797
信誉分 100
可用分 4821
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-19
状态 离线
477
 
谢谢各位的精彩回帖。小弟有了很大的受益!!!!
这两天做Western blot,蛋白分子量43kd,我用12%的分离较,5%的积成胶,上样量50ug,用5*loading buffer, 恒压先80V,marker分层后110V,一直跑到底, 转膜用恒流200mA,3h,脱脂牛奶封闭过夜,一抗(1:300;500;600;1000)都试过,室温摇床2h,二抗(HRP)(1:6000;7000;8000)都试过,室温摇床2h,洗都是TBS-T 15min*3,ECL时没有荧光,曝光什么都没,然后用DAB显色也是没有条带,但用丽春红染有明显条带。
请教各位: 1.我的试验过程及条件是否合适,那里需要改进?
2.我的胶跑的自认为还行,没有歪,marker的条带分的很清楚,不知到这样算不算跑胶没问题;
3.丽春红染有条带,DAB无条带,是不是我的目的蛋白没转上,或者转过了?我的首要问题是想知道我的膜上有没有我得目的蛋白,怎么可以知道啊?或者我提蛋白是没有把目的蛋白提出来?
4.会不会是一抗与目的蛋白结合的问题,或者是一抗跟二抗结合的问题,怎么排除?
5.我很菜,做了好几次都没结果,好难过,我一个人在黑暗中摸索,不知道问题出在那里,不知道该怎么尝试,郁闷,希望得到各位的帮助, 给点意见,谢谢啊!!!!

===========================================================================================================

1. 转膜用恒流200mA,3h,感觉转移时间有点长了。
2. 看跑胶有没有问题,你可以在做WB之前跑胶看看你的蛋白提出来了没有。最好是在WB时,同时跑两块板,一面用来转膜,一面用来考染。如果样品少,可以在同一块板上进行,然后切开分别操作。
3. 想知道膜上有没有目的蛋白,可以在转膜后封闭前,加立春红染色,就可以看到目标位置是否有蛋白。要知道提蛋白是否把目的蛋白提出来,只能提前进行电泳染色看看。
4. 抗体稀释问题,应该是倍比稀释,像你这种1:300;500;600;1000没有意义,可以这样比如1:200;400;800;1600,自己随便设置。
一抗和二抗的问题,你可以本版搜索一下,以前我们回答过这些问题。可以用点杂交。
5.自己一个人摸索是很郁闷,浪费时间,可以经常来本版搜索一下,有很多这方面的帖子。
顶部
tianmei001[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 73832
精华 1
积分 585
帖子 806
信誉分 102
可用分 4823
专家分 10
阅读权限 255
注册 2011-9-28
状态 离线
478
 
不知道你是帅哥还是美女,我都谢谢您,发自内心的!!
小弟很水,原理知道甚少,如果问题很幼稚请原谅,给点耐心啊,谢谢啦
1:转膜电流我想用2.5h试一试,不知可以否?我已经用1.5h试了下,有marker,但是丽春红染没蛋白条带,我得转膜缓冲液没有SDS,同学说有SDS的只要1h;
2:“看跑胶有没有问题,你可以在做WB之前跑胶看看你的蛋白提出来了没有。”呵呵,我不是很明白,我的蛋白是从组织中提的,转膜后丽春红染色有蛋白条带啊,是不是说我提了蛋白出来的,只是不知道我的目的蛋白在不在里面, “要知道提蛋白是否把目的蛋白提出来,只能提前进行电泳染色看看。”这个不懂,你是说我要用丽春红染,看目标位置是否有蛋白?
3:“想知道膜上有没有目的蛋白,可以在转膜后封闭前,加立春红染色,就可以看到目标位置是否有蛋白” 我然后有很多条带,marker45,目的蛋白分子量43,因为膜从上到下都有条带,目标大致位置也有,而且有一条比其他的蛋白明显,并且粗些,但是还是不好肯定那就是目标蛋白;
4:抗体的比例让各位见笑了,我开始用1:500和1000,几次没结果后改为1:300和600,那我就听老师,
5.此外,老师对我的试验认为还有那里不妥?还需要我提供那些资料,您觉得我的问题大致出在那些地方,我好去改正排除
顶部
PCR[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 74238
精华 0
积分 414
帖子 448
信誉分 100
可用分 3201
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-8
状态 离线
479
 
请问:1、我目的蛋白85kd,一抗说明书写的条带一般在100kd,查分子克隆应该用8%的分离胶;蛋白Marker 7条,最小10几kd,最大117kd,说明书写用12-15%分离胶;8%跑过几次,Marker小分子量的带就丢失了,而且条带有脱尾现象,显影出现过一次目的蛋白,在胶中间位置,我到底该选择百分之几的分离胶? 是否12-15%的胶跑不出来80多kd的蛋白?
2、做WB,加入AB液后荧光条带很清楚显示,可X片却透亮什么条带都没有,显色液刚配,以前用过没问题,曝光时间2-3.5分钟都试过,以前2分钟做相同蛋白出来过条带,大侠指点下什么原因?还有,显色液我的怎么很快蘸2下就得停止,3下就黑了,是否因为新配的,太灵敏了,来不及观察阿
顶部
zzzz[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 74598
精华 1
积分 656
帖子 967
信誉分 102
可用分 5638
专家分 10
阅读权限 255
注册 2011-10-12
状态 离线
480
 

请教楼主一个问题:

我煮过后蛋白样品可以在4度放多久? 下次跑胶的时候,这批样品还需要煮吗?

谢谢!
顶部