小中大“SDS-PAGE,特别是等点聚焦和PAGE结合（双向电泳）也是检测蛋白质结构变化的很好的方法。”这是《血液制品去除灭活病毒技术方法及验证指导原则》中的一句话，目的想考察蛋白质制品灭活病毒前后的结构变化。
我公司产品情况：冻干制品（主要含有纤维蛋白原，另有少量的凝血因子、白蛋白）。
我公司依照《血液制品去除灭活病毒技术方法及验证指导原则》的建议，想采用SDS-PAGE进行蛋白质制品灭活病毒前后的结构变化研究。那么是采用还原SDS-PAGE（加入巯基乙醇），还是非还原SDS-PAGE呢？
另外，2010版药典三部附录IV C SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法中写道：“非还原电泳凝胶经扫描进行纯度分析；还原电泳凝胶中分子量标准，经扫描获得分子量标准曲线，计算供试品的分子量。”
我是否可以这样理解 ：我公司产品含有三种蛋白，是混合物，因此不适合用非还原SDS-PAGE，因为非还原电泳凝胶是进行进行纯度分析的，无法分析混合物。然而如果用还原SDS-PAGE，就破坏了蛋白质的结构，无法进行灭活病毒前后蛋白质结构变化对比。我是不是理解错了？
针对我公司的这种实验目的，选择哪一种实验方式更合理呢？
