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标题:【讨论帖】SDS-PAGE电泳求助专用帖

tieshazhang[使用道具]
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请教几个问题:
我买的天为时代的蛋白marker,取10ul直接上样就行,不用再加loading buffer
但我的样品用的上样buffer和它marker的好像不协调,跑浓缩胶的时候,marker的前沿迟迟不动 ,这样前沿挺难看,后来才渐渐齐了,但跑出来的不好看。不同的buffer是否对电泳有影响?
我是浓缩胶80v,分离胶120v,0.75mm的胶两块,bio-rad的电泳槽
上面两个是我跑的,带总是会变宽或窄,带会不一样宽,很难看
下面两个是我从园子里看别人发的,
怎么才能跑到他们那么漂亮呢?
我觉得自己做胶到上样都挺好。
电极那金属线稍微有一点点弯 是否会影响前沿的水平呢?

还有我按1gR250 450ML乙醇 450ml水 100ml醋酸配染液,胶缩得好小 好小了


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2013-6-27 17:15
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taoshengyijiu[使用道具]
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想问一下上样量的问题,走SDS-PAGE时必须保证每个上样孔的上样体积(样品加loading buffer)都一样吗?可是每个样品的蛋白浓度都是不同的,如果要保证每个孔的蛋白含量一致(例如100ug),相应的所上样品的体积就不同,再按1:1加loading buffer就很难让每个孔的总体积都一样呀,可不可以用loading buffer补足体积,而不按比例加laoding buffer,我正要做western-blot,没什么经验,希望大侠们多指点,不胜感激!
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请教大侠一个问题:我转膜时蛋白marker总是不清楚,marker是Fermentas的彩虹marker,上样量3微升,电泳时marker跑得很漂亮。转膜用的缓冲液是按分子克隆上的配方(甘氨酸2.9g,Tris碱5.8g,SDS 0.37g,甲醇200ml,用水定容至1升),转膜电压100V,电流210mA左右。转膜后经常是marker不清楚(别的同学同样的方法效果很好),我一直找不到原因。转好的膜用丽春红染色后蛋白条带还是很清楚的。为什么marker转得不好?
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最近我跑sds-page电泳回收某一分子量的蛋白,坛子上有不少人提到对着分子量切胶再跑水平电泳回收蛋白,请教两问题:

(1)为什么会出现两条带

===========================================================================================================

应该是最底部的两条带吧,这应该是因为你切胶时没有很准确的切下目的条带,而把相邻的条带也切下来的缘故,可以同时多个泳道跑电泳,然后快速染色一个泳道,对照这个位置切余下的胶,不过要十分准确的切胶,这就与你电泳时是否位置一致有关了。
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ukonptp[使用道具]
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请教几个问题:
我买的天为时代的蛋白marker,取10ul直接上样就行,不用再加loading buffer
但我的样品用的上样buffer和它marker的好像不协调,跑浓缩胶的时候,marker的前沿迟迟不动 ,这样前沿挺难看,后来才渐渐齐了,但跑出来的不好看。不同的buffer是否对电泳有影响?
我是浓缩胶80v,分离胶120v,0.75mm的胶两块,bio-rad的电泳槽
上面两个是我跑的,带总是会变宽或窄,带会不一样宽,很难看
下面两个是我从园子里看别人发的,
怎么才能跑到他们那么漂亮呢?
我觉得自己做胶到上样都挺好。
电极那金属线稍微有一点点弯 是否会影响前沿的水平呢?

还有我按1gR250 450ML乙醇 450ml水 100ml醋酸配染液,胶缩得好小 好小了

===========================================================================================================

不知道你加样的时候是怎么加的?看起来好像是样品扩散造成的,建议检查一下是否是加样时间过长和加样泳道两边的泳道为空泳道(如果是,可以用上样buffer加一下,防止样品对周围扩散)。
上样buffer应该都是大同小异的,不会对电泳产生影响。
金属线弯一点没事的。
染色液也没有问题,胶变得小也是正常的,主要是在染色过程中失水引起的,可在脱色后用水浸泡一下就可以了。
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想问一下上样量的问题,走SDS-PAGE时必须保证每个上样孔的上样体积(样品加loading buffer)都一样吗?可是每个样品的蛋白浓度都是不同的,如果要保证每个孔的蛋白含量一致(例如100ug),相应的所上样品的体积就不同,再按1:1加loading buffer就很难让每个孔的总体积都一样呀,可不可以用loading buffer补足体积,而不按比例加laoding buffer,我正要做western-blot,没什么经验,希望大侠们多指点,不胜感激!

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不需要体积都相同,有时为了比较浓度的不同,可以按同样比例稀释样品,然后同样体积的样品,但如果你是为了保证条带的一致性,可计算好同等蛋白量的体积就可以了。loading buffer主要是使蛋白变性的作用,其中的sds和DTT一般都是过量的,肯定可以满足上样蛋白的需要,如果不放心可适当多加点,但最终计算好你加了多少蛋白量就可以了,做weston之前最好摸索一下电泳条件再做。
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不知道你加样的时候是怎么加的?看起来好像是样品扩散造成的,建议检查一下是否是加样时间过长和加样泳道两边的泳道为空泳道(如果是,可以用上样buffer加一下,防止样品对周围扩散)。
上样buffer应该都是大同小异的,不会对电泳产生影响。
金属线弯一点没事的。
染色液也没有问题,胶变得小也是正常的,主要是在染色过程中失水引起的,可在脱色后用水浸泡一下就可以了。

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谢谢 你解除我一些疑惑
加样就是用10ul的枪,加完自我感觉挺漂亮,也没串孔,没有很长时间吧,
一个样一枪。空泳道也加了buffer的。
你看我的样品带比marker带宽了好多,真难看阿,都像marker带就好了,
虽然宽,但又好像没超过那个孔的范围,我用的10孔的,只用中间几个孔,
急需跑出漂亮的带 要毕业了阿
我也不知道该注意什么了,样品就是TCA沉淀的酵母培养上清,
顺便问一下,DOC-TCA中,0.15%的DOC怎么配,用水么?
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谢谢 你解除我一些疑惑
加样就是用10ul的枪,加完自我感觉挺漂亮,也没串孔,没有很长时间吧,
一个样一枪。空泳道也加了buffer的。
你看我的样品带比marker带宽了好多,真难看阿,都像marker带就好了,
虽然宽,但又好像没超过那个孔的范围,我用的10孔的,只用中间几个孔,
急需跑出漂亮的带 要毕业了阿
我也不知道该注意什么了,样品就是TCA沉淀的酵母培养上清,
顺便问一下,DOC-TCA中,0.15%的DOC怎么配,用水么?

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可在你的上样buffer中加些甘油试试。
doc-tca没做过。
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DOC是用水配
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一群?搞本分子克隆的书不就的了,还哪来那么多的鸟问题
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