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标题:【讨论帖】关于蛋白质组学“idea”方面的问题

orangecake[使用道具]
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从组学角度研究蛋白,很大程度上依赖于仪器以及生物信息学的发展
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分子式[使用道具]
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分离到了差异蛋白,再以后呢?再接着向下做,将会做什么呢?找到这个蛋白所对应的基因?那由蛋白分析反向推向基因最好的办法是什么呢?
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两头延伸:一方面拿到蛋白所对应的基因,主要是设计引物,基因克隆,基因功能验证 另一方面可以收集大量的蛋白质进行结构分析,作为一些药物设计的靶点
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gmjghh[使用道具]
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但RT后RNA的表达量和蛋白的表达量之间并不是所有的都存在直接的关系
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大脑门儿儿[使用道具]
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“缺少了应用,研究也就失去了价值。”太对了,从小的理想就是做个科学家,可能目标太明确了,从没考虑过自己研究的东西有什么意义,当然文章或者论文中的创新点研究价值意义写了一大堆,但感觉那些好空,最近一直在思考,自己做的东西到底有没有意义,做些什么东西比较实在。
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大脑门儿儿[使用道具]
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感觉大家吵吵闹闹地要作蛋白质组分析, 可是, 好多都是跑胶, 质谱/测序, 完了以后就傻眼了, 不知道怎么分析了. 蛋白质组分析需要很厚的功底, 融会贯通, 不简单. 我以前想得太理想化了, 现在只能一步一步走了

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非常同意你的观点,蛋白质组分析需要很厚的功底, 融会贯通。蛋白质不是那么容易研究清楚的,表达,调控,蛋白功能等等各个环节都很有内容。我们实验室有个博士,她没有从蛋白质组学做(找差异蛋白-。。。),而是先pcr了个功能基因(RNA片段),然后反转录,然后克隆到一个表达系(可能表达不是很准确,就是把DNA转录/转导到低等生物中,例如酵母),表达蛋白,把蛋白提取纯化复活,注射到实验动物中检查该蛋白是否实现原来PCR的基因的功能。感觉还有点意思。
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uaubc[使用道具]
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个人认为DIGE不错,可以研究蛋白质修饰的情况,有些蛋白做定量PCR并没什么差异的
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uaubc[使用道具]
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下一步研究的话,就该RNAi 登场了
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windy+++[使用道具]
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一,从蛋白水平来验证差异蛋白,如免疫组化,western bioting等;
二,从分子水平验证差异蛋白如PCR ,souther,norther 等;但蛋白水平验证是比较可靠的
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tuomu45[使用道具]
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我也有同感,蛋白质质谱测序后,好像再没法继续做,现在大多研究也在这一步,有高人指点以下阿
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