兽药残留分析由于分析样品的基质为动物样品，含有成千上万种化合物，如蛋白质、脂肪、糖类、核酸、氨基酸、维生素、激素、无机盐、水分等。这些物质的分子结构、分子大小和理化性质各异，许多化合物的性质目前尚不明确，其中任何一种物质的含量可能是药物残留组分的数百倍至数万倍以上，严重干扰着药物的检测。
一般情况下各种动物组织中化学成分复杂，与动物的种类、日粮成分、健康有关。比如肝脏、肾脏、尿液等，作为代谢和排泄器官或代谢物载体，各种药物和基质的残留物浓度高，消除缓慢，会严重影响目标药物残留的测定，并会使回收率降低。复杂生物样品的残留检测，前处理是最为关键的一环，决定着方法的灵敏度和分离度，在整个试验过程中占据着90%甚至更多的工作量。
动物样品处理过程通常包括四项基本内容：提取、净化、浓缩和衍生化。此外由于药物容易与生物基质如蛋白等结合或扼合，因此很多方法中需要酶解步骤。在每个过程中各种参数（温度、pH值、离子强度、组分间的相互作用、时间、浓度等）综合影响常常无法固定。因此，建立一个良好的前处理方法是需要对各种影响因素进行全面的研讨。
在兽药残留分析样品前处理过程中，固相萃取小柱的选择及其萃取步骤是最为关键的。选择不同作用机理基础上的SPE小柱并建立最优化的SPE方法，是在建立兽药残留检测方法中的难点和关键点。
个人经验感觉，兽药残留分析中SPE的使用需要注意事项大体主要有以下几个方面：
一是SPE小柱的选择。
选择什么样的SPE小柱，是决定成功的一半。经常先根据参考文献中前辈们的工作中进行筛选和比较，需要阅读大量的中英文文献，看看相关的科研工作者们如何解决类似的问题。再次分析目标化合物的性质，如分子结构、基团、极性、酸碱性、能否合适衍生化等等。然后再决定几种比较合适的小柱子类型。目前国内外相关公司推出了相应的各种型号的SPE小柱子，国外的有沃特斯、安杰伦等，国内比较全面科技实力比较强的有北京的艾杰尔公司等。它们都推出了高分子聚合物固相萃取填料为代表的各种作用机理的新型SPE小柱子，具有高纯度，高比表面的特点，具有比传统的硅胶基质更强的吸附性，由于吡咯烷酮极性官能团的引入，使得其对各类极性、非极性化合物化合物具有均衡吸附。另外在高分子聚合物的基础上进一步引入其他离子交换集团，形成混合作用机制，优点是可通过两种不同溶液的洗涤得到更干净的样品，从而提高灵敏度。这些混合作用机制的新型SPE小柱子，对于基质样品非常复杂的动物组织中的药物残留检测，具有很好的效果。本人曾试用过北京的艾杰尔公司的PCX小柱子，进行动物组织（肝、肾、肉）和尿液中β2-受体激动剂的多残留检测方法的研究，取得了不错的效果。
二是选定了小柱子之后，先用标准品溶液建立一个合适的SPE方法，或者叫标准溶液SPE方法。在这个方法建立过程中，需要大体几个步骤：1）活化小柱；2）上样；3）淋洗；4）洗脱；其中的3和4是比较关键的两步。淋洗要保证去掉尽可能多的杂质而不影响目标化合物。洗脱是要保证全部的目标化合物洗下来。溶剂的选择、PH值的调整、体积的多少、流速的大小等等都需要考虑在内，可以做一个曲线图考察最佳的实验条件。
三是SPE方法的优化。就是在空白样品（如空白生物体液）添加分析物，然后对此样品进行萃取。如果回收率明显的降低就说明可能干扰物与分析物之间存在很强的作用力，或者干扰物与SPE填料之间存在很强的作用力。这些因素都会降低SPE柱对分析物的吸附能力。
常见问题有：1）分析物回收率低；2）萃取重现性差3）洗脱馏分中含有干扰物；4）SPE柱流速降低或阻塞。需要对上述问题逐一进行分析解决。
