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标题:【讨论帖】成功过的战友讨论下,你曾经WESTERN...

阿k[使用道具]
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其实大的步骤大家应该都没有问题,我说说细节的问题!
1、蛋白的提取:组织的蛋白由于比较杂,不太好做,细胞的相对好做些!蛋白提取时一定要注意在冰上操作,组织的提取我直接研磨后取上清(什么也没有加,也可以出来!)。buff处理煮沸后冻存,使用的时候一定要再次煮沸,因为蛋白有可能在保存的时候复性!

2、配胶:不论基层还是分离胶一定要注意给足充分的聚合时间(一个小时),否则胶聚合不均匀跑出来的是扭曲的条带!TEMED一般不会出问题,AP一定要新鲜的一周之内的(使用时闻闻,如果有刺鼻的气味就说明没有过期)!

3、封闭:封闭的时间最好常一点,我们采用室温摇床4h,出来的背景非常干净(超敏发光液的也很干净)!

4、一抗:个人感觉非常重要,抗体经量买国外的(并没有贬低国产的意思),使用时一定要分装,多次冻融后抗体很容易降解!孵抗体的时间最好4度过夜,冰箱取出来后室温在放置1h。(我们实验室几乎不用封闭袋是用的湿盒,是把膜平铺在蜡板上表面滴上抗体,要表面张力的那种,非常节省抗体!)

5、转膜也很重要:我们采用湿转,湿转不容易把蛋白转过!转膜时一定注意温度,在转之前把电转液冰箱里冻着,使用的时候在加!另外转移槽外面要加冰块冷却,很多情况下由于问题过高会导致效果很差!

6、洗膜:不要怕浪费TBST,也不要为了省时间少洗!我们都是15min,4次!出来的背景很好!

7、发光:发光液配好后用小盒子装,把膜泡在里面30s,要全部浸在里面,直接上凝胶成像仪。(发光液直接滴在膜上的经常会发光不均匀)!

以上是一点心的,欢迎大家讨论!
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shenkunjie[使用道具]
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我做了不少次WB,失败的时候占多数,汗,有很多失误的地方,最主要的影响因素还是一抗问题,一抗浓度要合适,我最近做跑GRP78,总是不出来,很淡,做了几次才明白一抗有点失效了,郁闷之极。还有一些细节问题,比如剪膜,显影时间等...相信大家都遇到过。
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BOSS2011[使用道具]
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呵呵我也来说两句!刚做WB的时候,丁香园的一个前辈曾说:WB最关键的步骤是(1)蛋白提取;(2)电泳;(3)转膜;(4)显影。后来实验过程中发现这几个点真的很重要!好了,我来说说我的感受:
1、蛋白提取问题。
一般的蛋白提取,按照标准的操作应该问题不大,组织蛋白的降解没有我想像的那么“脆弱”。我们在-80度保存将近1年的组织,也可以做出来结果,当然还是尽快提取蛋白最为保险!但是,针对核蛋白、膜蛋白或者线粒体蛋白等特殊的蛋白,采用专门的裂解液是很有必要的,蛋白提取不好后面的步骤无法进行。蛋白提取后变性过程中,注意上样缓冲液的问题!以前我们购买的劣质缓冲液严重影响蛋白变性,导致考马斯亮蓝R-250染胶的结果很差,后来自己配置上样缓冲液就解决问题了。证明蛋白提取没问题(排除了其他的因素),是劣质缓冲液不能满足实验要求。所以这个问题也需要引起大家的注意。
2、蛋白电泳失败。
电泳我遇到的问题不多,主要是电泳液的ph值要保证,重复使用的次数也就2-3次,不要怕麻烦而耽误了后面的实验。
3、转膜问题:转膜不充分,过转,温度过高导致蛋白结构改变等。
转膜是最关键的,转膜的条件因为大家的仪器不同(即使是同一厂家同一款产品条件也会产生差异),很难有个同一 的标准,因此需要大家摸索。一般每个实验室都会有做过WB的前辈,只好参照他的条件自己再摸索。
转膜完毕立春红染色不是很可靠,没有染上的也可以做出来,建议大家坚定信心还是坚持做下去。
4、抗体问题。
主要是一抗!这个问题不好说!需要点运气,我们实验室有人使用420元的国产抗体做的效果很好,但我们不敢保证下一次他还会有这么好的运气。经济能力许可建议买好的抗体(就是价格高的抗体),可以提高效率节省时间,而且好的抗体其稀释比例不需要摸索很久,一般按照说明书的操作就可以了。注意二抗的稀释比例不能太高,否则背景会深,我们一般1:5000!我们一般固定二抗的稀释比例(1:5000),搭配不同稀释比例的一抗来摸索抗体搭配条件。
如果一抗是羊抗,背景可能会很高,我们采用10%牛奶封闭过夜后,背景比较干净,这个方法可以试试!
5、显影问题。
环境温度是个问题!冬天我们做内参,条带显影都不够黑,而且显影时间会延长!有意思的是,吹口热气可以让荧光亮一些!这个和温度有关!可以开空调提高显影室的温度。我们实验室有人把显影液实验水浴箱37度孵育一下,也可以帮助显影。
显影的时候,如果荧光肉眼可见,压片时间以秒计算。如果荧光似有似无,压片时间以分钟计算。这个还得实战体会摸索一下。
6、其它。
建议大家蛋白提取后先做考马斯亮蓝R250染色,初步判定蛋白质量。
建议大家无论何时都要先做内参,保证WB体系没问题,然后再调整转膜条件、抗体比例、显影时间的细节。
这两点都是磨刀不误砍柴的细节,希望大家先做!
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INK[使用道具]
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严重同意蛋白的重要性,actin的WB正常,并不代表sample合格。
我上个月做WB做了半个月,目的条带就是出不来。后来改做ACTIN,很容易条带就出来了。但换回目的蛋白的一抗还是出不来。开始怀疑是一抗的问题,换了一瓶一抗仍没有效果。后来同一个膜同时跑了 actin和目的蛋白,同样是actin条带出的很好,目的蛋白出不来。
后来考虑是sample的问题,重新提取了蛋白,用同样的方法做,目的蛋白很明显就出来。
所以,actin能出来,并不代表sample里的蛋白没有降解,尤其是目的蛋白含量不高的时候。

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我做的是磷酸化的STAT3,活化后应该都往细胞核里跑了,但我提的是细胞总蛋白,做了之后目的条带没出来,actin是有的,是不是一定要提核蛋白才行呀,还是p-stat3 本身丰度就太低了呀,求救ing!~
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bs4665[使用道具]
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我一开始做western是显影液有问题。片子发白,就好像没曝光一样。
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queen[使用道具]
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我感觉膜的处理和转膜的电压选择很重要。
我第一次做时,我的目的蛋白53kDa,实验室的technician给我的protocol中转膜条件是23v 30min。结果转完后一看胶上的marker条带还很清楚,后来我查了资料,改为80v 60min,效果很好。

我用的膜是PVDF膜,第2次做时没用methanol处理,结果膜上有一片透明的区域,当时不知为什么,后来在园里咨询了后才知道是没处理的原因,后来每次都用methanol浸泡2-5min,然后浸在转移夜里直到用时,效果很好。

贴张图大家看看区别。


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queen[使用道具]
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我感觉膜的处理和转膜的电压选择很重要。
我第一次做时,我的目的蛋白53kDa,实验室的technician给我的protocol中转膜条件是23v 30min。结果转完后一看胶上的marker条带还很清楚,后来我查了资料,改为80v 60min,效果很好。

我用的膜是PVDF膜,第2次做时没用methanol处理,结果膜上有一片透明的区域,当时不知为什么,后来在园里咨询了后才知道是没处理的原因,后来每次都用methanol浸泡2-5min,然后浸在转移夜里直到用时,效果很好。

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gogo[使用道具]
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刚刚开始做WB,第一次做的时候只是封闭的时间特别长,几乎有一天了(5%WB专用脱脂奶粉封闭)。第一次做的时候还出现了显色的条带(DAB+HRP显色),但是大小不对且对照和材料都有。后面做的时候就没有出现过条带了,但是PVDF膜上都会倍染成蓝色到蓝紫色的,不知道是怎么回事。
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mysmdbl[使用道具]
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我用的是博奥森的抗体,多克隆的,目的条带44KD,封闭一小时,抗体4度过夜,二抗一个小时,可是除了目的条带以外,都出的了,目 的条带却一次都不出,请教各位高手,原因有哪些,如何解决?
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www.1[使用道具]
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这个帖子怎么没人继续跟了,我做了将近一年western,最近遇到很诡异的问题,排除不了原因,但是也还是有点心得,跟大家分享一下
关于显影定影,我看前面的各位说的很少,实际上这个也很关键,我们实验室有很长一段时间做不出来,经过这种查找排除最后发现问题就出在这里
冬天天冷,ECL发光液跟二抗反应发光需要一定的温度,开始我们都是暗示直接压片,暗示没空调,大概3-4度的样子,一直做不出来,后来就把暗盒放到30度的培养箱中放一个小时
然显影液和定影液也预热了一下,出来的片就很好
后来我发现显影液和定影液温度太高和太低都会导致片子不清亮,还是要一定的温度,秋天的气温很适合

希望可以帮到大家
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