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标题:【讨论帖】成功过的战友讨论下,你曾经WESTERN...

tudou85[使用道具]
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我最近一直在做,可是碰见一下问题向高手们请教,希望提点改正意见:
1 转膜时,多次出现小分子量的转膜效果不如中分子和大分子量的(用的彩虹MARKER,但14KD的亮黄色的条带仍然在胶上,转膜后的胶染色后小分子量区域的蛋白残留较多。在整张和将不同区域的分别转膜时均出现这种情况。)
2 在暗室里肉眼可以看见发光,可是胶片上一无所有。
3 ECL没有表达,可是用DAB时膜上却出现条带。
4 手工显影时,胶片的显影时间和温度有很大关系吗?显影的时间掌握如何比较恰当?
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mimili_901[使用道具]
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我最近做WB,为了更进一步证实我的目的蛋白,我加了标准品,但也许是我的目的蛋白表达量太少,所以曝光总是很弱,甚至没有,但每回都能将标准蛋白曝光到片子上。另我感到奇怪 的是,每次我曝光后再将膜用丽春红染色,标准蛋白在膜上几乎看不见,但对应的位置却可以看见明显的条带。所以我想问一下各位高手,是否我看到与标准蛋白对应位置的明显条带其实是很多种蛋白的混合物,也许没有我所要的目的蛋白,或者即使有,也是非常少,少得不足以可以曝光在片子上。还有一个问题,如果目的蛋白表达很好的话,加大抗体浓度有用吗?实验很着急,希望尽快回复。多谢了!!!
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nut6694[使用道具]
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新话题:考染胶有目的条带、丽春红染膜有条带和压片有条带这三者之间有什么必然的联系吗?请根据大家的经验谈谈。
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kuaizige[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 nut6694 于 2013-10-17 17:52 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
新话题:考染胶有目的条带、丽春红染膜有条带和压片有条带这三者之间有什么必然的联系吗?请根据大家的经验谈谈。

考染胶有目的条带:说明你的样品中有你要检测的蛋白。
丽春红染膜有条带:说明你的目的蛋白已经成功转移到膜上(有没有完全就不一定,可能也没有必要知道,一定要检查,或者丽春红没有条带,可以将电转后的胶再考染)。
压片有条带:目的蛋白与抗体有特异性反应。
由于检测限是western>考染>丽春红,所以丽春红有条带则考染,压片也应该有,反之则不一定。

再说说我的一些体会。
电转开始,有许多战友会提到短路问题,我觉得从理论到实践都说不通。首先,整块胶都被导电的buffer包围,何来通路、短路?其次,我,包括我们实验室其他人,从来没有按胶的尺寸来剪膜和滤纸。我的做法是剪一块比胶略大的膜(不便宜,省着点用),滤纸则可以同夹板一样大小,干的、湿的从来没有出现过问题。
气泡是最主要的问题,最好将夹胶、膜的操作在buffer液面下进行。
电转buffer最好不要太小气,用3-4次就该换了,反正也不贵,配也简单。
丽春红没有必要每次用,一般电转没有问题。
一抗要是血清的话,可以四℃过夜。
二抗按说明书来基本没有问题。
ECL显色后,尽量将显色液除尽,可以将膜封入一次性手套(封三边,留一边),用吸水纸使劲擦,再封好压片。
要是对曝光时间没有把握,可以一次叠两张胶片,相当于做个梯度。
不当之处望各位指正。
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youyou99[使用道具]
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求教各位高手,最近我的Western blot经常是出来干干净净,什么都没有,成功率低。经过SDS-PAGE胶考马斯亮蓝染色,证明电泳没有问题,蛋白也没有降解。用正对照蛋白做点杂交也证明一抗,二抗以及发色系统没有问题。
疑点就集中在转膜过程上,因为之前试验正对照蛋白(30KD)的时候用的转膜用的厚吸水纸用完了(“三明治”两侧各一张),换成了薄的滤纸(两侧各三张),自从换了这个以后就一直有问题了,即使正对照也很难做出来。我用的是湿转法,转膜buffer同《分子克隆》上:48mM Tris,39mM 甘氨酸,20%甲醇,0.0375%SDS,转膜条件:4度,200mA稳流一小时,我的蛋白比较大,73KD,这个条件是否合适?转膜结束之后将胶用考马斯亮蓝染色,干干净净,说明已经转走了,将PVDF膜用丽春红染色,也什么也看不到,感觉不太可能转过头,因为之前30KD的蛋白用这个条件也可以的。最近我又将转膜buffer的甲醇比例下调到15%,其他条件相同。结果也是一样失望,各位有什么建议么?
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+小生怕怕+[使用道具]
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我做了很久的WB,最大的一个难点感觉在于样品制备上!蛋白的降解有些时候是你想象不到的,可能出奇的糟糕,也可能完全没事~~如果单独做WB的话,感觉以“快速彻底裂解,先变性后保存”的原则比较有效,尽量选择足够强的裂解液,甚至直接给loading buffer裂解,然后取出部分蛋白定量,其余加入loading buffer100度充分变性,再分装保存。有些时候比蛋白酶抑制剂更有效。

另一个感觉就是样品中目的蛋白的量,限于WB的检测下限问题,一般目的蛋白量最好别低于1ng(虽然ECL法下限是0.1ng,即100pg),最好在10ng以上为好。这就要求在做WB之前必须充分考虑目的蛋白的可能丰度,最好充分的准备工作然后再设计细胞量或者组织量,千万别把样品搞稀了,否则就不好办了。

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师兄或师姐,你说的意思是直接把提取的蛋白液加入loading buffer煮沸变性后直接保存,然后蛋白电泳时直接拿出来上样就可以吗?那样保存可以吗?加入loading buffer 变性后的蛋白样放几度保存?四度就行还时-20或时-80度?
第二,你说的是加样量少可能检测不到,那么如果加样量非常多,对实验是不是也会又很大影响?
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+小生怕怕+[使用道具]
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我就跑胶和转膜谈一点儿自己的体会
1、跑胶 电泳Buffer重复利用的时候要注意,不能混浊,有时候能用个3-4次,有时候第二次都不行了,事先前预电泳一下,看看气泡的均匀度;Buffer一定要淹过梳子孔,否则就会发现今天的蛋白不会跑;跑的时候先用低电压跑过浓缩胶,再换高电压跑分离胶,不要追求速度,慢慢跑条带会分离的更好,特别是对于高分子量的目的蛋白;
2、转膜 我用的是湿转,Buffer一定要预冷,最好提前一天配好放4度;滤纸不要大过PVDF膜,防止短路;胶在负极,膜靠近正极,放入Tank前检查一遍会使你免以体会放反的痛心疾首;膜要标记好正反面;转膜过程中,经常过去看看,防止意外,如电泳仪接触不好。
就这些了,请各位指正

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滤纸不要大过PVDF膜??哎,,到底滤纸,膜.胶的大小顺序是什么啊 怎么每个人说法都不一样啊
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+小生怕怕+[使用道具]
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谢谢战友!我的感觉是电泳跑胶时buffer的利用,如果蛋白跑出胶外,那下次一定就要更换,如果没有的话还能用一两次.

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什么叫蛋白跑出胶外呢?我每次都把兰色那条带跑出胶,蓝色那条跑到快底部,那算是蛋白跑出胶外吗?我的蛋白样是组织提取液
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+小生怕怕+[使用道具]
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换成了薄的滤纸(两侧各三张),自从换了这个以后就一直有问题了,正对照也很难做出来。

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滤纸用的张数对转膜有很大的影响吗?
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S6044[使用道具]
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湿法转移转移的确从来没什么短路的情况,半干转移才要特别注意,不过后者基本上不用,我们做了比较的,稳定性和重复性前者要好得多,当然对于高手来说也无所谓,但我觉得能做湿法的尽量还是用湿法。

1. 这种情况下我们通常会同时跑两块胶(或者一块胶切成两半),一块染色一块做Western,同步试验才能确保电泳没有问题,不知道你是不是这样做的。
2. 转膜我们一直用的25mM tris 192mM Glycine 15%甲醇(两次一换),各个实验室会用一套比较成熟的系统,如果你们的系统一直很好我觉得你的buffer你也不用怀疑它,只不过要注意check一下你的PH值。一旦摸索出较好的系统后不要轻易更换所使用的试剂厂家。
3. “考马斯亮蓝染色,干干净净,PVDF膜用丽春红染色,也什么也看不到”
的确,73KD这种条件下不会转过,所以我觉得是不是你的电极插线或者是做三明治的夹具放反了,全部转到缓冲液中去了,滤纸不会有什么问题,两种都可以,我们在没有厚的专用滤纸前一直用的是3张普通滤纸。
4. 没有用过的抗体最好有阳性对照,甚至我们每次做都会使用阳性对照,确保我们在出了问题能迅速找到原因
如果手头没有什么成熟的western体系可以向各个做抗体的大公司索要,这些体系都非常常熟,自己练习两次就熟悉了。
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