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标题:【讨论帖】成功过的战友讨论下,你曾经WESTERN...

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我这几个月也做了十多次WB, 最大的感触就是提取高质量的蛋白很关键。
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wu11998866[使用道具]
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相关疾病:
头痛
我最近也一直在做小歪,感觉成功的关键在于封闭之前的步骤,毕竟我们的抗体大都购与大公司,不会有什么问题,定夺也就做个dot blotting摸个比例,
但是蛋白制备,sds page,转膜我认为与个人操作有关,我的同界同学竟然把marker转到膜上后,发现目的蛋白还在胶上(不要怀疑,真的是这样,就是不知道为什么).
还有就是蛋白的位置,我要检测260k的一个蛋白,这个实验目前还没有成功,因为我总是没有办法让它跑到理想的位置.头疼啊
蛋白制备没有什么好说的了,好多方法,不停的实验找到合适自己的就ok
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tie8[使用道具]
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滤纸用的张数对转膜有很大的影响吗?

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我也觉得没有影响,但现在就是非常奇怪。
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tie8[使用道具]
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湿法转移转移的确从来没什么短路的情况,半干转移才要特别注意,不过后者基本上不用,我们做了比较的,稳定性和重复性前者要好得多,当然对于高手来说也无所谓,但我觉得能做湿法的尽量还是用湿法。

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1. 这种情况下我们通常会同时跑两块胶(或者一块胶切成两半),一块染色一块做Western,同步试验才能确保电泳没有问题,不知道你是不是这样做的。
2. 转膜我们一直用的25mM tris 192mM Glycine 15%甲醇(两次一换),各个实验室会用一套比较成熟的系统,如果你们的系统一直很好我觉得你的buffer你也不用怀疑它,只不过要注意check一下你的PH值。一旦摸索出较好的系统后不要轻易更换所使用的试剂厂家。
3. “考马斯亮蓝染色,干干净净,PVDF膜用丽春红染色,也什么也看不到”
的确,73KD这种条件下不会转过,所以我觉得是不是你的电极插线或者是做三明治的夹具放反了,全部转到缓冲液中去了,滤纸不会有什么问题,两种都可以,我们在没有厚的专用滤纸前一直用的是3张普通滤纸。
4. 没有用过的抗体最好有阳性对照,甚至我们每次做都会使用阳性对照,确保我们在出了问题能迅速找到原因
如果手头没有什么成熟的western体系可以向各个做抗体的大公司索要,这些体系都非常常熟,自己练习两次就熟悉了。

1.每次我都是跑一份平行的SDS-PAGE考染的,一切正常。
2.你所说的buffer是半干法的buffer吧,这套湿转膜系统以前本实验室一直用的。
3.这个电极搞反或是三明治搞错是不可能的,我做过n次,以前都是好的,突然就不行了,一直到现在,我每次都仔细检查,若是偶尔一次还有可能,连续多次就不可能了。
4.我前面说了,正对照是有的,点杂交出来,就是western出不来。
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湿法转移转移的确从来没什么短路的情况,半干转移才要特别注意,不过后者基本上不用,我们做了比较的,稳定性和重复性前者要好得多,当然对于高手来说也无所谓,但我觉得能做湿法的尽量还是用湿法。
1. 这种情况下我们通常会同时跑两块胶(或者一块胶切成两半),一块染色一块做Western,同步试验才能确保电泳没有问题,不知道你是不是这样做的。
2. 转膜我们一直用的25mM tris 192mM Glycine 15%甲醇(两次一换),各个实验室会用一套比较成熟的系统,如果你们的系统一直很好我觉得你的buffer你也不用怀疑它,只不过要注意check一下你的PH值。一旦摸索出较好的系统后不要轻易更换所使用的试剂厂家。
3. “考马斯亮蓝染色,干干净净,PVDF膜用丽春红染色,也什么也看不到”
的确,73KD这种条件下不会转过,所以我觉得是不是你的电极插线或者是做三明治的夹具放反了,全部转到缓冲液中去了,滤纸不会有什么问题,两种都可以,我们在没有厚的专用滤纸前一直用的是3张普通滤纸。
4. 没有用过的抗体最好有阳性对照,甚至我们每次做都会使用阳性对照,确保我们在出了问题能迅速找到原因
如果手头没有什么成熟的western体系可以向各个做抗体的大公司索要,这些体系都非常常熟,自己练习两次就熟悉了。

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1.每次我都是跑一份平行的SDS-PAGE考染的,一切正常。
2.你所说的buffer是半干法的buffer吧,这套湿转膜系统以前本实验室一直用的。
3.这个电极搞反或是三明治搞错是不可能的,我做过n次,以前都是好的,突然就不行了,一直到现在,我每次都仔细检查,若是偶尔一次还有可能,连续多次就不可能了。
4.我前面说了,正对照是有的,点杂交出来,就是western出不来。
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greenbee[使用道具]
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我做western开始条带不出来,但帮别人做的全部出来了,后来发现是一抗坏了,好容易说动老板重新买一抗,发现不能太帮老板省钱,要不辛苦倒霉的还是自己。
后来做stripper,开始的时候都能出来,后来一次偷懒,自己没配用了别人配的,结果就做不出来了,发现做实验一点不能马虎,东西最好全部自己配置,还要及时换新的。
western做多了,几个同时做,还出现过拿错二抗的事情,呵呵,当时就纳闷怎么很熟练的条件突然一点条带也没有了。
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但是蛋白制备,sds page,转膜我认为与个人操作有关,我的同界同学竟然把marker转到膜上后,发现目的蛋白还在胶上(不要怀疑,真的是这样,就是不知道为什么).

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你说marker 转到膜上了 目的蛋白还在胶上 这样的情况很正常啊
我们实验室很多师姐就遇到过这样的情况 她们做的蛋白大的时候好象尤其这样 最近我也有过这样的情况 做42KD的蛋白还总是偶尔压片出来带时 转膜都是marker已经转没了  
到是marker清晰可见在膜上时 多次还压不出带呢
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yayya[使用道具]
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我这几个月也做了十多次WB, 最大的感触就是提取高质量的蛋白很关键。

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那么你现在是否有提取高蛋白质量的方法呢? 分享一下吧
我看很多人似乎都用组织匀浆器来提取组织总蛋白
比如匀三秒停三秒 共匀15秒 什么的
有的又提倡最好别用组织匀浆器 因为产热大 而且不易控制不起沫
我们实验室一直用玻璃匀浆器 迅速冰上进行
但是我自己做起来 总觉得"迅速"这两字做起来好难啊
尤其在组织剪碎不完全的情况下 最后发现组织块根本就匀不碎了
所以最后我得出的教训就是:一定要在匀浆之前把组织块充分匀碎
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yayya[使用道具]
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我做western开始条带不出来,但帮别人做的全部出来了,后来发现是一抗坏了,好容易说动老板重新买一抗,发现不能太帮老板省钱,要不辛苦倒霉的还是自己。
后来做stripper,开始的时候都能出来,后来一次偷懒,自己没配用了别人配的,结果就做不出来了,发现做实验一点不能马虎,东西最好全部自己配置,还要及时换新的。
western做多了,几个同时做,还出现过拿错二抗的事情,呵呵,当时就纳闷怎么很熟练的条件突然一点条带也没有了。

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想问你 你stripper 用的溶液与步骤?
谢谢
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moonlight45[使用道具]
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个人感觉做wb首要的一步也是最关键的一步就是提蛋白,相对于细胞蛋白来说,组织的蛋白更难提取一些(蛋白的纯度和降解方面不易控制),上面的战友也提到了组织匀浆器和玻璃匀浆器迅速冰上进行的方法,个人感觉为避免蛋白的降解最好采用液氮研磨的方法,组织块不用剪的太碎也可以,研磨过程中注意补充液氮就可以了,不受时间的限制,唯一的缺点就是对组织有一定的损失。
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