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标题:【讨论帖】成功过的战友讨论下,你曾经WESTERN...

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做了十多次WB,第一次可笑的错误是,将10*转移缓冲液配成1*时忘了加甲醇(配方是在稀释时加甲醇的)。还有一次是错将1:1000抗体配成1:10000。还有就是将用于化学发光的建议抗体稀释度来做DAB显色,结果什么也没有,用化学发光还是可以做出来的。
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04906[使用道具]
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我的蛋白样品浓度为1.2mg/ml,样品上样量为20,样品是制备好直接上样,可是显色后目标条带非常浅,后来用新的一抗、二抗结果一样。可是以前几次蛋白浓度只有0.2mg/ml时,目标条带都非常清晰,请各位高手指教。
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98776langtao[使用道具]
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还有问一下转膜条件的问题,看到很多资料上用的是恒流200mA转膜,有的资料上则是恒压60V转膜,恒流和恒压有什么区别么?
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greenbee[使用道具]
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请问,用正对照蛋白做点杂交也证明一抗,二抗以及发色系统没有问题,具体是怎么做的啊?我现在想证明是一抗还是二抗出现问题,谢谢啊!
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plaa[使用道具]
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直接用2抗在 纤维膜上dab或ecl显色。
结果可出来 则2抗没问题。
2抗没问题就 可以检测1抗。
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plaa[使用道具]
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求教各位高手,最近我的Western blot经常是出来干干净净,什么都没有,成功率低。经过SDS-PAGE胶考马斯亮蓝染色,证明电泳没有问题,蛋白也没有降解。用正对照蛋白做点杂交也证明一抗,二抗以及发色系统没有问题。
疑点就集中在转膜过程上,因为之前试验正对照蛋白(30KD)的时候用的转膜用的厚吸水纸用完了(“三明治”两侧各一张),换成了薄的滤纸(两侧各三张),自从换了这个以后就一直有问题了,即使正对照也很难做出来。我用的是湿转法,转膜buffer同《分子克隆》上:48mM Tris,39mM 甘氨酸,20%甲醇,0.0375%SDS,转膜条件:4度,200mA稳流一小时,我的蛋白比较大,73KD,这个条件是否合适?转膜结束之后将胶用考马斯亮蓝染色,干干净净,说明已经转走了,将PVDF膜用丽春红染色,也什么也看不到,感觉不太可能转过头,因为之前30KD的蛋白用这个条件也可以的。最近我又将转膜buffer的甲醇比例下调到15%,其他条件相同。结果也是一样失望,各位有什么建议么?

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试一下这个buffer : 甘氨酸1.45 g
tris碱2.9g SDS 0.185g 甲醇100ml 加去离子水补足500ml
室温存放
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lxh031[使用道具]
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做了近一年的WESTERN,刚开始一直没出来,最后改变了变性温度,由90度降至70度,目的带就出来了,所以在蛋白变性这个环节也是很重要的.
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相关疾病:
头痛
自从进实验室就一直做WB,成功失败都经历过,些许经验教训愿与大家分享。
大家都知道WB有几个关键因素,分别是:蛋白,电泳,转膜,一抗,显影(或显色)。其中最重要的我认为是一抗和蛋白问题。
1.蛋白 (1)提取时原则主张使用玻璃匀浆,因超声匀浆可使蛋白降解。但前者耗时较多,即使冰上操作亦会有降解的。实验中发现超声匀浆也不错(2)裂解液 如提取后测蛋白浓度较低可少加一点。不主张加上样缓冲液,因最好每次做之前都测一下浓度。(3) 保存:-20保存的话建议一周内使用
2.电泳 各实验室均有自己的条件,应该都可以。注意的是加样不足十孔时,两侧加同体积上样缓冲液 。加相同蛋白量体积不同时用上样缓冲液补齐,保证相同上样体积
3.转膜 相同分子量的蛋白使用过不同的条件,效果相差不多。注意偏大或偏小的蛋白条件不同即可
4.封闭 做过肾脏和心肌的背景都很深,加大封闭液浓度至8%~10%,加入1%的BSA会好一点
5.一抗 最重要!曾经因为一个指标换过所用的条件就是不出,最后发现是一抗的问题,之前一直被告知抗体很好,所以没考虑。多花点钱买个好的单克隆抗体省时省力,少头痛!
6.显影 用ECL的话,如看到膜上有条带,我们压片十几秒就可以,可以反复多压几张片子。对了,在加发光液时,要注意两侧的条带,不然两侧的条带会较弱或显不出。
以上为个人意见,仅供参考。
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yysr238[使用道具]
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楼主提议不错,浏览一下,收获不小。
本人也有些经验以供分享:
楼上好多提议作WB最重要的是提高蛋白浓度,偶颇有同感,但也有例外。首先要看你实验目的,如果作2D或者低丰度蛋白就必须尽量提高蛋白浓度,一般组织可以达到30ug/ul,细胞可以到10ug/ul(本人经验)。
其次看你作的蛋白的需求量,如果仅需要10ug左右,就不要搞很高的浓度,因为定量时稀释倍数太大,结果就会很差。同时上样量太少误差就很明显。把上样体积定在10-20ul最好。
我做细胞比较多,收集了一些裂解细胞的方法,仅供参考:

1) 全细胞裂解液150mmol/L NaCl, 1mmol/L EGTA, 50mmol/L Tris-HCl(pH 7.4), 1%NP-40, 0.5μg/ml Leupeptin, 0.7μg/ml Pepstatin A, 50μg/ml PMSF, 2.2μg/ml Aprotinin。
在4℃条件下,按5×106个细胞加100ul含有蛋白酶抑制剂的细胞裂解液,蛋白酶抑制剂用前临时加入。在冰上反应30min后,4℃,12000r/min离心10min收集上清,-80℃保存备用。
2)胞浆蛋白、胞核蛋白抽提裂解液及操作步骤:
a)胞浆蛋白抽提液:10 mM HEPES (PH7.8), 15 mMKCl, 10% N P-40, 0.1mM EDTA , 1 mM DTT, 1 mM MgCl2,使用前加蛋白酶抑制剂终浓度为100μg/ml PMSF, 2.35μg/ml aprotinin, and 5μg/ml leupeptin,0.7μg/ml。4℃储存。
b)胞核裂解液:20mM HEPES (7.9),10mM KCl , 1mM EDTA,1mM EGTA,1mM DTT, 20 mM NaF, 1 mM Na4P2O7,1 mMNa3VO4, 420mM NaCl, 20%glycerol, 使用前加100μg/ml PMSF, 2.35μg/ml aprotinin, and 5μg/ml leupeptin,0.7μg/ml。4℃储存
c)蛋白抽提:细胞5x l06,用PBS(PH7.2)洗1次,以下在冰上操作。弃上清,加入100-150μl胞浆裂解液,混悬,冰上肿胀15min,再剧烈震荡涡动10s。10000g,离心20s(4o):仔细吸取全部上清,为胞浆蛋白-80o保存备用。沉淀加核蛋白裂解液50-100μl混悬,冰浴30min,间以搅拌。12000g,5min取上清分装,为胞核蛋白-80o保存备用。
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yysr238[使用道具]
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转自dxy一个配方
裂解buffer:
50mM HEPES ph7.0
1mM 甘油
1mM DTT(还原剂)
7M 尿素,2M硫脲(可以提高膜蛋白的融解)
1mM EDTA(金属鏊合剂)
1mM PMSF,1mg/ml leupeptin,1mg/ml aprotinin,1mg/ml pepstatin(蛋白酶抑制剂)
50mM NaF(ph7.0)(anti hemoaggulating)
1mM Na3VO4(ph7.0)(inhibitor of phosphatases)
2mM benzamidine(inhibitor of trypsin)
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