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标题:【讨论帖】冷冻复性

tangxin_80[使用道具]
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1、相同的包涵体样品做过其他方式的复性试验吗,如透析,稀释,G25换液?
2、蛋白收率如何?除去那一小部分早期融化的液体,余下的主要样品部分怎么办?

个人认为此方法只是利用了变性剂在低温环境下溶解度较低,除去变性剂而已。相同样品如果用这种方法做可以复性的话,那么用稀释法应该也是可以完成复性的。

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稀释法的缺点就是样品后来体积大。

楼主的方案除了低温去除变性剂外,还有一个作用恐怕就是利用低温固化蛋白质的互相作用和碰撞接触,降低复性过程中因蛋白互相粘合形成的沉淀
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tangxin_80[使用道具]
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也会有点的,但是应该不多,所以提到了用预冷的缓冲液稀释一下防止干扰。

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楼主有做过试验么?液体中残留的尿素大概在多少摩尔
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ukonptp[使用道具]
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稀释法的缺点就是样品后来体积大。

楼主的方案除了低温去除变性剂外,还有一个作用恐怕就是利用低温固化蛋白质的互相作用和碰撞接触,降低复性过程中因蛋白互相粘合形成的沉淀

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恐怕不是固化。“我做的复性仪能直接析出变性盐而不明显冻结试剂”

我猜测是利用低温,但不是很低温条件,可能是在0到-5度左右,Urea、盐酸胍高浓度的变性剂由于温度下降而析出。为了防止溶液冻结,还可能加入了一些盐类,如NaCl,或甘油之类防冻剂。

透析复性的缺点是不均匀,透析袋壁处的变性剂浓度变化太快。
稀释复性也有浓度变化太快问题,另外体积也是太大。
这个冷冻法如果控制好温度的变化,好像可以均匀地控制变性剂的析出,且样品溶液均一性好。
不管这项技术是否真的能够实现,操作方面也不一定比透析、稀释好(温度控制,常规的试验室没有精确低温控制设备),但思路方面是可以试一试的。
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dhpbj[使用道具]
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发张麻省联系信函的截图,以证所言!

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我想看的不是这张图。
我想看的是电泳图。虽然我知道复性得到的蛋白质浓度可能很低,但是应该浓缩一下,测一下浓度,做个电泳。
另外,我有个问题,您说"早期融化的液体,其中就应该有已经复性的蛋白",这个“早期”是多早?多少体积算早期?
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QUOTE:
原帖由 dhpbj 于 2013-11-5 23:32 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
发张麻省联系信函的截图,以证所言!

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我想看的不是这张图。
我想看的是电泳图。虽然我知道复性得到的蛋白质浓度可能很 ...

很遗憾,您问的一切我都没法给您清晰的答案!不是我不想,是现实没给我这种机会(本人正在失业中,已经3年。做生物研发不是个人能承受的,虽然我曾竭力去尝试……)。坦率的说用冷冻复性的蛋白浓度一点不低,甚至由于变性盐的析出,导致溶液体积骤减,蛋白浓度较初始几乎翻倍。
个人感觉做探索有时是跟着感觉走的,想来“早期”就是够您测活一次的量即可。
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寻梅[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 ukonptp 于 2013-11-5 23:31 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
稀释法的缺点就是样品后来体积大。

楼主的方案除了低温去除变性剂外,还有一个作用恐怕就是利用低温固化蛋白质的互相作用和碰撞接触,降低复性过程中因蛋白互相粘合形成的沉淀

====================================== ...

多谢版主!
稍微更正一点,目前采用的方式不是用-5度这种方式。-5会析出一部分盐的但是距离复性的要求应该还是比较远的。
在设备设计上是把冷冻面放在液体底部,盐(尿素,盐酸胍)密度是1.3左右,所以是沉淀在底部的。越浓的溶液比重越大,包涵体密度也是1.3左右。这样的好处是“废物”都在底部……
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寻梅[使用道具]
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楼主有做过试验么?液体中残留的尿素大概在多少摩尔

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我冻过8M的尿素溶液,冰块架在滤纸漏斗上室温融化的结果是下图。很抱歉,没称重估算溶液里面剩余的尿素。您自己有条件估算一下吧!


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2013-11-5 23:34
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finger[使用道具]
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非常感兴趣同时也比较困惑。
该方法的实质是一个缓慢降低尿素浓度进行复性的过程,对某些蛋白也许管用,但估计其普及性是不好的,复性的方法如同纯化一样,是没有固定方式可循的。
1、温度对蛋白的折叠有一定的帮助的,有许多的复性就是在18度左右进行的,所以低温有时可能却是一种阻碍;
2、复性缓冲液的组成是相当重要的,楼主使用的配方很简单(当然简单有时也是最适合的),但是我想这样子肯定对许多其他蛋白的作用不大,特别是含有半胱氨酸的;
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寻梅[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 finger 于 2013-11-5 23:34 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

非常感兴趣同时也比较困惑。
该方法的实质是一个缓慢降低尿素浓度进行复性的过程,对某些蛋白也许管用,但估计其普及性是不好的,复性的方法如同纯化一样,是没有固定方式可循的。
1、温度对蛋白的折叠有一定的帮助的,有许多 ...

坦率的说表面上看复性方式是没啥规律可循的,可是有一点是不变的规律——就是变性盐的去除和缓的达到一个临界点复性即开始(蛋白复性始终为两种力量左右,其一是变性盐产生的变性力量,另一是存在于一级结构中的复性力量。这两种力量都有益于复性。变性力能破坏错误折叠,给正确复性以机会;复性力能指引正确折叠。)。这个过程越和缓越具有复性的优势……
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yyaxw84[使用道具]
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我们意外发现这个现象也已经有3年了,但是由于觉得没法放大,无法应用于生产,所以没能继续进行相关研究。
不过我们用的是2M的尿素,实验过程和你的方法略有异同

知音啊。。。

我们当时还想开发复性试剂盒呢,有空咱多讨论下
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