蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【讨论帖】蛋白质组学与多肽阵列技术答疑专帖

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标题:【讨论帖】蛋白质组学与多肽阵列技术答疑专帖

ququer787[使用道具]
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发表于 2013-11-8 10:31 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
请问贵单位芯片的容量有多大？一般一张芯片可以放多少个多肽片段？谢谢

===========================================

在一张12cmX8cm的膜上，合成2000个多肽点没有问题。
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avi317[使用道具]
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发表于 2013-11-8 10:32 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

请问，我想检测血清中某些受体的自身抗体：原先是先合成多肽，然后ELISA做，可以用多肽阵列技术吗？这种受体有很多亚型，然后我们要检测上百个血样。多谢！
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ququer787[使用道具]
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发表于 2013-11-8 10:33 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
请问贵单位芯片的容量有多大？一般一张芯片可以放多少个多肽片段？谢谢

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你好！芯片容量8x12cm的膜上，2000个多肽点没问题，一般一张芯片放1000左右的多肽点。
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ququer787[使用道具]
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发表于 2013-11-8 10:34 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
请问，我想检测血清中某些受体的自身抗体：原先是先合成多肽，然后ELISA做，可以用多肽阵列技术吗？这种受体有很多亚型，然后我们要检测上百个血样。多谢！

===========================================================================================================

你好！可以，根据受体蛋白序列，使用“overlapping”技术将受体蛋白分为不同的多肽原位合成于膜上，之后与血清进行反应。根据不同的亚型的蛋白序列制备多肽阵列进行检测，阵列膜可以重复使用。具体实验设计可以联系北京博肽健诺威生物技术有限公司，电话010-62988627。
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utt0989[使用道具]
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发表于 2013-11-8 10:34 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

蛋白质组学，是考虑iTRAQ，还是label free的比较好？
另外，什么方法可以最大程度的得到整个蛋白质组，包括膜蛋白和球蛋白。如果分成膜蛋白和球蛋白分别鉴定的话，则价格太高。
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发表于 2013-11-8 10:36 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

你好！很高兴看到你的这个贴，我想了解的是这和噬菌体表面展示有何区别和优势？
我本想用噬菌体展示法筛选和我现在获取的靶蛋白序列的一段接合力最强的肽段，请问能用你的这个技术么？
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okhaha[使用道具]
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发表于 2013-11-8 10:37 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

三种不同疾病模型小鼠样本，正常组wt，正常组xx基因KO，疾病组wt，疾病组xx基因KO，每组各五只，只用肝脏组织，可以用这种多肽阵列技术分析差异蛋白吗？费用在多少范围以内？
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发表于 2013-11-8 10:37 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


QUOTE:
原帖由 utt0989 于 2013-11-8 10:34 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

蛋白质组学，是考虑iTRAQ，还是label free的比较好？
另外，什么方法可以最大程度的得到整个蛋白质组，包括膜蛋白和球蛋白。如果分成膜蛋白和球蛋白分别鉴定的话，则价格太高。 ...

关键是看你需要什么样的结果，iTRAQ是为了解决传统2D技术的不足而产生的，它解决了最早2D技术没能很好解决的一些问题，比如能发现更多种类及数量的蛋白，而且不需要凝胶，但在胞浆蛋白及蛋白量的变化方面，其不如2D，所以这两个技术是可以互补的。label free是一种进行peptidome分析的研究工具，是否用它取决于你的研究需要。
个人认为更大程度的获得蛋白信息，iTRAQ应该更有优势。
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ququer787[使用道具]
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发表于 2013-11-8 10:38 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


QUOTE:
原帖由 8princess8 于 2013-11-8 10:36 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

你好！很高兴看到你的这个贴，我想了解的是这和噬菌体表面展示有何区别和优势？
我本想用噬菌体展示法筛选和我现在获取的靶蛋白序列的一段接合力最强的肽段，请问能用你的这个技术么？ ...

完全可以用多肽阵列技术，而这个技术的优势也在研究蛋白质相互作用方面。与噬菌体技术最大的区别就在于噬菌体技术依赖于生物系统及编码基因，需要经过生物系统加工。而多肽阵列是直接根据与您感兴趣的靶蛋白相互做用的蛋白序列来设计多肽阵列，就是前面提到过的“overlapping”技术，用原位合成的方式将与靶蛋白发生互做的蛋白以多肽的形式呈列于固相载体上，能够直接找到互做的位点甚至是分析互做的关键AA。所以它不需要基因序列，甚至可以没有序列，根据已有的多肽数据库，合成随机多肽阵列，去发现与你的靶蛋白相互作用的多肽，通量高，省时省力。
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发表于 2013-11-8 10:38 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


QUOTE:
原帖由 okhaha 于 2013-11-8 10:37 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

三种不同疾病模型小鼠样本，正常组wt，正常组xx基因KO，疾病组wt，疾病组xx基因KO，每组各五只，只用肝脏组织，可以用这种多肽阵列技术分析差异蛋白吗？费用在多少范围以内？ ...

可以，根据疾病类型设计随机多肽阵列，提取肝脏总蛋白后与其反应，实验的费用需要根据你所合成的随机多肽阵列所含多肽数量而变化，具体范围不好说。如果您感兴趣可以和公司直接联系。
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