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标题:【讨论帖】蛋白质组学与多肽阵列技术答疑专帖

rxcc33[使用道具]
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完全可以用多肽阵列技术,而这个技术的优势也在研究蛋白质相互作用方面。与噬菌体技术最大的区别就在于噬菌体技术依赖于生物系统及编码基因,需要经过生物系统加工。而多肽阵列是直接根据与您感兴趣的靶蛋白相互做用的蛋白序列来设计多肽阵列,就是前面提到过的“overlapping”技术,用原位合成的方式将与靶蛋白发生互做的蛋白以多肽的形式呈列于固相载体上,能够直接找到互做的位点甚至是分析互做的关键AA。所以它不需要基因序列,甚至可以没有序列,根据已有的多肽数据库,合成随机多肽阵列,去发现与你的靶蛋白相互作用的多肽,通量高,省时省力。

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但我个人觉得,我目前的研究主要是需要短肽,多肽阵列技术能满足这种需求么?因为我们的研究并不只是基础研究,我们更希望进入到应用研究方面,所以短肽低免疫源性!

上面划线部分理解的不是很清楚。
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ququer787[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 rxcc33 于 2013-11-8 10:39 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
完全可以用多肽阵列技术,而这个技术的优势也在研究蛋白质相互作用方面。与噬菌体技术最大的区别就在于噬菌体技术依赖于生物系统及编码基因,需要经过生物系统加工。而多肽阵列是直接根据与您感兴趣的靶蛋白相互做用的蛋 ...

您还是不太了解多肽阵列技术,多肽阵列上面的多肽都是长度在8-15个aa的短肽,而且通过这一技术发现的相互作用位点一般都在3-5个aa左右。如果找到与您目标蛋白有反应的肽,可以直接给您提供作用的相互位点序列,直接根据序列大量合成后就可以做后续的工作,这方面有很多成功的例子。所以用它达成你的实验目的完全没问题。建议您直接跟公司联系:010-62988627
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ququer787[使用道具]
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QUOTE:
原帖由 rxcc33 于 2013-11-8 10:39 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
完全可以用多肽阵列技术,而这个技术的优势也在研究蛋白质相互作用方面。与噬菌体技术最大的区别就在于噬菌体技术依赖于生物系统及编码基因,需要经过生物系统加工。而多肽阵列是直接根据与您感兴趣的靶蛋白相互做用的蛋 ...


"所以它不需要基因序列,甚至可以没有序列,根据已有的多肽数据库,合成随机多肽阵列,去发现与你的靶蛋白相互作用的多肽,通量高,省时省力。"
这句话的意思是,可以人工设计肽库,找寻与你的靶蛋白有相互作用的短肽。
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moonlight45[使用道具]
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你好,我们想找某个化合物的目标蛋白,是否可以用这个技术?最后怎么确定这个目标蛋白是什么?谢谢。
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ququer787[使用道具]
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原帖由 moonlight45 于 2013-11-8 10:42 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

你好,我们想找某个化合物的目标蛋白,是否可以用这个技术?最后怎么确定这个目标蛋白是什么?谢谢。

原则上说是可以用的,这个技术可以用于蛋白与蛋白之间,以及蛋白与其它生物大分子之间的相互作用研究。不知道你这个化合物是什么结构,是否有针对该化合物的显色方法。可以将蛋白以多肽点的形式合成在固相载体上面,之后与你的化合物进行结合反应,洗去与多肽阵列不结合的化合物,使用适当的显色方法显色与多肽产生结合反应的化合物,根据与化合物结合多肽的序列信息,获得相应的蛋白信息。
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