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标题:【转帖】GE公司於莉女士《定量蛋白质印迹实验的最优化...

shenkunjie[使用道具]
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很好的讲座,再次感谢!
本人有个问题,就是在结果里面经常出现“杂带”,(如下图),请问一下於莉老师对于这个现象您是怎么解释的?出现这个结果的原因是什么?以及有什么好的方法可以排除此类现象?非常感谢!


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2013-11-23 17:40
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您好,首先我需要说明的是采用ECL化学发光蛋白质印迹实验所得到的结果在很多期刊文献上都被正式采用,化学发光蛋白质印记实验已应用多年,只要是做蛋白表达,功能,相互作用等研究方面的实验室大多数都会采用Western blotting作为一种常规技术手段来验证实验结果.作为这样一项传统,稳定但又不断持续发展的技术,western blotting没有停滞不前,近几年得到了多方面的发展,以袮补传统方法上的一些不足和突破新的应用,如:
1 传统的胶片曝光,现在逐渐被采用冷CCD的凝胶成像系统所取代,从而克服了传统胶片有于定量动态范围窄而导致不能精确定量的缺点.而且CCD可以实时成像,避免了胶片易过曝光导致的过饱和信号.
2 现在最新的就是荧光蛋白质印迹实验,ECL Plex (cy2,cy3,cy5).你也提到 荧光标记具有持续时间长、线性关系好、灵敏度高、可多重检测、系统直接成像等优势,这些都可能促使荧光标记比ECL所得结果更加可靠。确实你已经领悟到荧光蛋白质印迹实验最重要的优势就是卓越的定量效果.为什么定量这么重要?如果用化学发光的结果,虽然实验会加入内参蛋白但由于曝光时间的难于控制,导致定量的系统偏差.这是不可避免的.但荧光的本身的光稳定性,宽线性范围,等保证了蛋白的这种相对定量.所以通过western blotting实验我除了可以知道蛋白是否存在以外,更重要得是可以完成精确定量表达差异的蛋白峰度.
3 所以在此基础上经典的western blotting技术又有了更新的应用领域--2D/DIGE Werstern blotting .即在双向电泳/荧光差异双向电泳 胶图上进行蛋白质印记试验,以前由于化学发光检测灵敏度局限,胶的后染色对杂交印记效率的影响,定量的局限性等,在这方面的应用受到了限制.现在采用了荧光蛋白质印迹实验有了很大的突破,参见附件文献(文件太大, 请发邮到lifesciences@ge.com, 我回复的时候会把附件给你)
或:
QUALITATIVE AND QUANTITATIVE INSIGHTS IN VIRUS HOST-CELL INTERACTIONS
INVESTIGATED WITH DIFFERENTIAL PROTEOMICS, MULTIPLEX WESTERN BLOT AND QUANTITATIVE PCR.

FACK, F., KREMER, J., REVETS, D., PIRROTTE, P., AMMERLAAN, W.,

RENAUT, J. *, MULLER, C. P.

Laboratoire National de Santé - Institute of Immunology, Luxembourg.

*CRP-Gabriel Lippman, EVA, Luxembourg.
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我最近在做western的时候一直出现问题,我想向您请教,希望能收到您的回复。我这次新提取的蛋白做western时总是不出条带,连tublin都不出现,后来又用actin来试,条带倒是出来了,但是是在四十多的位置连着出现了好几条带,而且很整齐,但这次的ACTIN我是一抗二抗一块加四度过夜,之后TBST洗三遍后TBS中泡三分钟去爆的光。之前试过一次ACTIN的一抗二抗分开加也是没有条带的,求指教.

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尝试回答:
关于western做不出条件的影响因素很多:比如抗体的产品质量、抗体的稀释度、蛋白转膜条件、ECL试剂盒的质量等因素都会影响条带的有无。根据您提供的这种情况看来,由于是新提蛋白,建议您先从此次提取蛋白的试剂找原因,请问您此次提取的蛋白浓度测定结果如何?如果说蛋白浓度正常,上样量也没问题的话,请确认ECL试剂盒的质量和使用方法。一抗二抗一起加出现的条带可能是非特异性结果,所以可以判断的是化学发光的试剂应该没问题,如果actin和tubin没出来那就要好好检查其他试剂. 还要检查一下转印用预染marker,或转印完染一下胶,看转印是否完全!
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成像系统、荧光标记的二抗、低荧光的膜、与荧光兼容的洗液。。。。。
请问一下于丽老师,能比较一下不同方法的成本吗?
如果按最便宜的方案计算,要完善这样的一套系统大概要多少?
谢谢,应该来说我们很熟了:)
蛋白质组学的问题没少给你打电话。

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感谢关注讲座, 尝试解答你的问题
因为设计到不同的配置,所以很难给出具体的成本计算,如果需要算上成像系统,所以肯定比普通的化学发光贵,但从长远来看,可以多重检测,可以不需要显影定影和胶片,而且可以拿到更加精确的定量结果,差异比对结果.肯定是值得的!
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我最近在做western的时候一直出现问题,我想向您请教,我做的western时总是模糊条带,想尽办法,也做不出来清晰地条带.偶尔有清晰的条带,但相同条件做,又作不出来.很郁闷!热切期盼您的答复.谢谢!

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感谢你对讲座的关注,希望能对你有帮助。
关于western产生模糊条带的原因,最有可能的一个因素就是电泳条件的影响。如果在电泳中出现控温不好的情况,会影响条带的效果。所以针对此现象,建议尝试电泳缓冲液温度4度过夜使用。使用新鲜配置的电泳缓冲液也会有很好的效果。
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很好的讲座,再次感谢!
本人有个问题,就是在结果里面经常出现“杂带”,(如下图),请问一下於莉老师对于这个现象您是怎么解释的?出现这个结果的原因是什么?以及有什么好的方法可以排除此类现象?非常感谢!

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不用客气, 希望讲座对大家的试验有帮助。
关于western结果中出现杂带的原因,通常是由于使用的抗体不是单克隆抗体的缘故。因为western的原理是特异性检测存在于印记膜上的某种蛋白,而如果使用的一抗特异性程度不高的话,会引起杂带的出现。
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很好的讲座,再次感谢!
本人有个问题,就是我做westblot中,sds-page的一步我是设置的恒压,但是电流总是随着时间的流逝而逐渐变小,0.1ma/5s大概,请问这是正常的吗,我跑出来胶的条带还可以。
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你是不是重复多次使用了缓冲液,离子强度有变化,建议更换缓冲液

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於莉老师您好,我是丁香园会员secret_05,我对于您的这次讲座很感兴趣。
很好的讲座,再次感谢!
本人有个问题,就是我做westblot中,sds-page的一步我是设置的恒压,但是电流总是随着时间的流逝而逐渐变小,0.1ma/5s大概,请问这是正常的吗,我跑出来胶的条带还可以。
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不用客气, 希望讲座对大家的试验有帮助。
关于western结果中出现杂带的原因,通常是由于使用的抗体不是单克隆抗体的缘故。因为western的原理是特异性检测存在于印记膜上的某种蛋白,而如果使用的一抗特异性程度不高的话,会引起杂带的出现。

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非常感谢於莉老师快捷准确的答复。谢谢!本人还有个问题要麻烦您一下,我有个结果是这样的,条带还算比较单一,而且背景也不高。但是分子量与Marker比较的话差很多,我的目的条带分子量是29KD,但跑出来的位置却在50KD-60KD之间。请问於莉老师,这个条带是其它的蛋白,还是确实就是我的目的蛋白?如果是,为什么跟Marker不一致?希望於莉老师能给解答一下,感激不尽!
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最近做 Western检测的目的蛋白是个膜蛋白,基因库中显示分子量为47KD,以二聚体形式具有功能,Santa Cruz 抗体说明书上标注的分子量为92-99kDa,好几篇文献做细胞的显示的是56kDa,因为是多克隆抗体,出现了许多杂带,搞不清楚到底哪条带是我需要的,我们跑的是变性胶,请你帮我分析一下目的蛋白的条带究竟在哪。另外,还有一个问题请教一下:从脑组织中提取离子通道膜蛋白的方法?热切期盼您的答复!谢谢!
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