如何判断同一基因的两个不同突变位点在同一染色体上

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标题:如何判断同一基因的两个不同突变位点在同一染色体上

奇蒙kate[使用道具]
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发表于 2013-12-20 13:10 资料个人空间短消息加为好友

小中大

背景是人的某基因，上面有两个不同的突变位点，相隔较远，PCR无法一次扩增出来，因此无法通过TA克隆判断是否在同一条染色体上，还有没有其他方法能判断这两个突变位点，是在同一条染色体上？还是在不同的染色体上呢？

mybioon[使用道具]
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发表于 2013-12-20 13:13 资料个人空间短消息加为好友

小中大

难道你的这个基因是基因家族里面的成员吗？如果不是的话一个基因就应该再一条染色体上吧！

mybioon[使用道具]
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发表于 2013-12-20 13:14 资料个人空间短消息加为好友

小中大

可以将PCR产物和载体TA克隆后摇菌，挑单菌落测序，

如果2个突变点在同一条染色体上，则单菌落克隆测序的结果是会出现2个突变都有的和没有突变的

如果2个突变点不在同一条染色体上，则单菌落克隆测序的结果是会出现各有1个突变的

iii_ii[使用道具]
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发表于 2013-12-20 13:15 资料个人空间短消息加为好友

小中大

一般情况还是要检测家系的其他成员，特别是父母双方的突变情况，若父母各携带一个突变，那么完全可以视为是位于两条染色体上。可能为该病的遗传病因，为combined mutation。如果家系成员完全不能找到，那么可是找一下突变位点附近有没有SNP位点，如果有,可将SNP位点与突变位点一起PCR扩增出来，通过TA克隆测序分析SNP，也许可以分析出是否在同一条染色体上。

奇蒙kate[使用道具]
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发表于 2013-12-20 13:15 资料个人空间短消息加为好友

小中大

回复 #2 mybioon 的帖子

不是基因家族成员，是一个隐性致病基因。

现在测序结果是两个突变位点都是杂合状态，也就是说其中一个染色体上有碱基突变，但这两个位点的碱基突变分别在两个染色体上？还是在同一条染色体上？现在无法确定。但这影响到结果判断，如果分别在两条染色体上，那蛋白产物都是有缺陷的；如果在同一染色体上，还有一半蛋白产物是正常的。这是人的标本，无法通过经典的孟德尔规律杂交分析，也无父母的信息，即便是有父母的信息，也不敢保证子代两个突变位点之间不会发生交换。

那如何判断这个基因的两个不同突变位点在同一染色体上呢？

奇蒙kate[使用道具]
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发表于 2013-12-20 13:16 资料个人空间短消息加为好友

小中大