【求助】单倍型分析求助

目前在做一项SNP与疾病关联性的研究,数据分析阶段遇到如下难题:



下面附图为A基因的9个SNPs的连锁不平衡分析图,图上显示的数值为R2,想请教如何进行后续的单倍型分析。

我的疑问是应该按照Block为单位来分析每个Block构成的单倍型与疾病的关联呢?还是应该根据LD的结果,选出不连锁的SNP构建单倍型,再分析与疾病的关联?




忘各位大侠赐教,如果大家有什么好的心得也希望能够交流