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IPTG诱导蛋白表达的话，一般有下面几个问题：
1.诱导时机，也就是诱导的菌浓。诱导越晚，菌量越大，容易获得高密度；但相对菌体越老，表达蛋白的时间下降，表达量就可能下降。而诱导得早则菌体密度低，细菌从生长阶段进入表达阶段之后，生长减缓，虽然表达时间延长了，但由于总密度低而导致蛋白表达量不高。因此需要对你得菌以及蛋白做个分析，对诱导时机作出合理得选择。
2.诱导剂IPTG的浓度。IPTG的浓度与蛋白表达的速度相关（其本质应该是转录速度加快了吧？），高浓度表达快，低浓度表达慢。但是IPTG同时具有一定的细胞毒性，浓度越高，对细胞的活性越不利。另外，表达速度越快，蛋白越容易形成包含体。常用的浓度在0.1mM到1mM，也有更多或更少的。
3.诱导温度。一般来说，发酵都分为两个阶段即生长阶段和生产阶段。生长阶段用于菌体生长，一般取比较丰富得培养基和适宜的条件来获得最大的比生长速率；而生产阶段也就是诱导表达阶段，一般换做限制性培养基（E.coli一般不换），降低温度来延缓细菌的生长，延长蛋白表达的时间，从而增加外源蛋白质的表达。同时降低温度也可以在一定程度上减少包含体的形成，一般从30度到24度，最低也有18或16度的。
总得来说建议你降低IPTG浓度，同时降低诱导温度，两个条件都可以做一个梯度实验。同时延长一下表达时间。
