小中大
具体文献找不着了，不过文献上看过，在一个conference上也听人报告过。
我觉得比如glycolylation这种修饰，如果程度够大而且改变表面电荷的话，应该可以分离的。但如果位点很少，而且包埋起来了的话当然更困难。
有成功的例子不代表就一定适应您的蛋白。
analytical gel filtration，跟一般SEC是一样的，只是可以分析很少量的样品，如果有autosampler的话，把peak的不同fraction跑一遍，看profile是不是有变化，是不是规律，就知道是不是两种形式的蛋白了。不知道结合质谱能不能要到你想要的结果，没做过。请有经验的战友继续。
楼上战友的建议很不错，同样您可以分析一下潜在的其他修饰位点。
