蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【求助】 6X His标签蛋白的纯化求助

采购询价

点击提交代表您同意 《用户服务协议》 《隐私政策》

 
需要登录并加入本群才可以回复和发新贴

标题:【求助】 6X His标签蛋白的纯化求助

yueban-1147[使用道具]
四级
Rank: 4


UID 75776
精华 0
积分 692
帖子 1064
信誉分 100
可用分 6113
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-10-27
状态 离线
41
 


QUOTE:
原帖由 NBA 于 2014-2-22 20:43 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

盐酸胍干扰电泳,需要去掉才能跑电泳。复性没确切的方案,只能自己摸索。

那么如何除去盐酸胍呢?透析?有没有快速除去的方法?以便于检测啊
顶部
NBA[使用道具]
五级
Rank: 5Rank: 5


UID 75229
精华 6
积分 2497
帖子 4006
信誉分 114
可用分 20946
专家分 70
阅读权限 255
注册 2011-10-20
状态 离线
42
 
三氯乙酸沉淀,直接稀释沉淀都可以.
顶部
mingming0638[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 107986
精华 1
积分 331
帖子 357
信誉分 102
可用分 2541
专家分 10
阅读权限 255
注册 2013-4-27
状态 离线
43
 

第一张图中,从左边起第四孔道(包括marker),有一很浓的条带,可是比目的条带(基本在46KD处)多了那么几个KD。第三条MARKER是48KD,
左边起第二孔道是我的上样液,第三孔道是结合后的流出液,第四孔道是洗脱液(Elute),第五孔道不用管,是我另外一个与本实验无关的样品。
我们老师说,如果那条很浓的条带与46KD相符合的话,那这个纯化结果就算很成功的了。
我说,要不先做个透析,然后测个酶活?他说,可以的。
我很着急啊,时间很紧迫,特来求教于战友们。下一步该如何做?
顶部
mingming0638[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 107986
精华 1
积分 331
帖子 357
信誉分 102
可用分 2541
专家分 10
阅读权限 255
注册 2013-4-27
状态 离线
44
 
左边起第二和三孔道是elute后的流出液,第四孔道是wash后的流出液(如果那条浓条带是目的蛋白的话,那wash的条件很不好啊,洗掉了这么多目的蛋白),第五孔道是结合后的流出液,第六孔道是上样液。
顶部
mingming0638[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 107986
精华 1
积分 331
帖子 357
信誉分 102
可用分 2541
专家分 10
阅读权限 255
注册 2013-4-27
状态 离线
45
 

第三张图是我以前在细胞中表达了目的蛋白后,做的western blot的结果,目的蛋白与预期的相符合。
所不同的是,前面两张是在蚕体里面表达蛋白后,加以纯化,然后跑的blot的图,这一张是在细胞里面的表达,没有进行纯化。
疑惑啊,同样的蛋白在同样的载体里面,带着同样的HIS标签,理应大小一致啊。难道是由于纯化带进了咪唑等杂质,导致marker和样品跑的不一样快?然后marker失去了它的指示大小的作用??还请朋友们指点一二。。多谢了。。
顶部
taoshengyijiu[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 77450
精华 0
积分 467
帖子 614
信誉分 100
可用分 3876
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-17
状态 离线
46
 
看了你的贴子觉得很有意思。可以互相学习。按理说(我自己的实验中证实)镍柱纯化过程对目的蛋白在电泳上的影响不会这么明显。对于前两张图中纯化产物是否为目的蛋白的怀疑其实完全可以用Western去检测一下啊,电泳条带与预期条带大小不符是很常见的事情,与很多因素有关。但是如果Western证实是你的条带,那么是否可以不再怀疑了。纯化前的您做了一张Western,那么这张图在电泳时和前两张图的电泳条件是否完全一致啊,上样量肯定应该不同了吧,前两张图有没有加一点还原剂啊?另外还有一点建议,跑电泳时将胶分成两部分,一部分割下来染色作SDS-PAGE,另外一部分上了同样的样品去转膜,这样也有一个比较,否则出现问题也很难分析了。一点拙见,仅供参考。
顶部
mingming0638[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 107986
精华 1
积分 331
帖子 357
信誉分 102
可用分 2541
专家分 10
阅读权限 255
注册 2013-4-27
状态 离线
47
 


QUOTE:
原帖由 taoshengyijiu 于 2014-2-22 20:56 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
看了你的贴子觉得很有意思。可以互相学习。按理说(我自己的实验中证实)镍柱纯化过程对目的蛋白在电泳上的影响不会这么明显。对于前两张图中纯化产物是否为目的蛋白的怀疑其实完全可以用Western去检测一下啊,电泳条带与 ...

谢谢战友的意见!!我今天发的这三张图全是Western的图,而不是蛋白电泳图!关键是Western做出来的条带和预期大小有出入啊。不然我可以斩钉截铁的说,这就是我的目的条带!目前我很是怀疑哪里出了问题。
另外,SDS-PAGE蛋白电泳的条件基本是一致的。当然肯定不会完全一样,比如说你提到的上样量啊(但我最多也只是加了10微升),还有浓缩胶的长度,有时长,有时短,但都维持在1厘米到2厘米之间。因为在蛋白电泳过程中有一个现象,纯化过程中各个阶段的样品好像永远不能压缩成一条细线,我估计应该和盐浓度以及咪唑浓度有关吧?一开始情况还要糟糕,似乎完全不能压缩,经过稍微加长浓缩胶长度以及配制新鲜电泳缓冲液,情况有所好转,但还是有个2-3毫米那么粗,跑出浓缩胶后,顶在最前面的不是溴酚蓝,而是红色的不知道什么指示剂,它与溴酚蓝之间大概有个1厘米稍微不到一点的距离。
你指的还原剂是什么物质呢?
“另外还有一点建议,跑电泳时将胶分成两部分,一部分割下来染色作SDS-PAGE,另外一部分上了同样的样品去转膜,这样也有一个比较,否则出现问题也很难分析了。”
这个我会尝试一下!谢谢
顶部
mingming0638[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 107986
精华 1
积分 331
帖子 357
信誉分 102
可用分 2541
专家分 10
阅读权限 255
注册 2013-4-27
状态 离线
48
 
现在碰到了非常头疼的事情。
SDS-PAGE电泳时,纯化好后的蛋白没有经过透析直接上样,结果还没跑完浓缩胶,就见溴酚蓝参差不齐,东倒西歪,另外,浓缩不成一条直线。简直可以用大花脸来形容,图我就不上了,情况就是这样的。
我唯一能确定的是所制的浓缩胶是没有问题的,其他的线索就是:我的蛋白样品中含有PMSF(用乙醇溶解),较多的氯化钠,一定量的2-ME以及NP-40,说到NP-40,我昨晚纯化的时候,发现树脂结块现象,我估计是NP-40捣的鬼。
做了一个通宵的实验,身心俱疲啊!如果是蛋白电泳正常跑完后,发现纯化结果不好,我也就算了,可以重新摸索纯化条件,可现在连蛋白电泳都不能正常去跑,实在让我失落啊。请战友们指点迷津!
回答上述问题: 电泳跑不出来,条带发生扭曲,是因为样品中盐浓度过高,建议脱盐后再跑电泳.
......

===============================================================================================================

我已经停止使用PMSF和NP-40了,另外氯化钠浓度不变,2-ME浓度适当减少。具体细节可参见上楼。“建议脱盐后再跑电泳.”想了想,还得买脱盐柱,所以就没实施战友的建议~:)))
问了其他一些实验室的人,他们说咪唑对蛋白电泳的影响应该不大,不然就不会透析前就去跑蛋白电泳了。
顶部
taoshengyijiu[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 77450
精华 0
积分 467
帖子 614
信誉分 100
可用分 3876
专家分 0
阅读权限 255
注册 2011-11-17
状态 离线
49
 

前面的帖子没有仔细看,只是从你的图看起了,发现你用了2-ME,也就是我说的还原剂,加了还原剂后蛋白条带在电泳时泳动速度会变慢,就向你在图一和图二中的那样,当然如果还原不彻底,就是加的还原剂剂量不够的话,可能图二和图三中的条带都会出现,彻底不加还原剂,理论上应该是图三的条带。个人见解,仅供参考。
顶部
mingming0638[使用道具]
三级
Rank: 3Rank: 3


UID 107986
精华 1
积分 331
帖子 357
信誉分 102
可用分 2541
专家分 10
阅读权限 255
注册 2013-4-27
状态 离线
50
 


QUOTE:
原帖由 taoshengyijiu 于 2014-2-22 20:58 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')

前面的帖子没有仔细看,只是从你的图看起了,发现你用了2-ME,也就是我说的还原剂,加了还原剂后蛋白条带在电泳时泳动速度会变慢,就向你在图一和图二中的那样,当然如果还原不彻底,就是加的还原剂剂量不够的话,可能图二和图三中 ...

图三的确是彻底没加还原剂!!
“加了还原剂后蛋白条带在电泳时泳动速度会变慢”??难道真的是这个原因导致图一和二的特异性条带看起来跑得比图三的要慢??
顶部