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标题:【讨论专区】蛋白质组学研究方法

ukonptp[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:17 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【讨论专区】蛋白质组学研究方法


蛋白质组学研究方法专区！请发表高见！
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ukonptp[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:20 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

先介绍一个网站:
cuturl('http://cmbi.bjmu.edu.cn/cmbidata/proteome/index/index.htm')
cuturl('http://cmbi.bjmu.edu.cn/') 中国生物医学信息网
很多的介绍文章.很不错的.
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birdfish[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:21 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

蛋白质组学不需要方法，只需要仪器。用荧光标记的样品跑2D，三维峰形显示分析软件分析，带机器人的workstation全自动实现扫描、抠点、脱色、干燥、酶解、孵育、点样，然后往maldi-tof一扔。一次1152个样品，我就不信做不出成果来！
可惜，这套东东买得起人不多
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xingyi08[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:22 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
我在expasy上下载了Melanie 3，可惜只是个演示版。网上有其它的分析2D胶的免费软件吗？
俺们实验室穷买不起公司的（1万多美金呀），如果哪位大侠的实验室有分析2D胶的软件，不知能否借用一下。小弟不甚感激！
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yyaxw84[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:23 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
请教MALDI-TOF肽指纹图的数据库查询的具体方法？
甚末数据库？
怎末打分？
结果出来怎末分析？
急！！！
先谢了！！！
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remonte[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:23 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
我现在正考虑做这方面的工作，但对蛋白质组的东西一点都不了解。2D电泳的蛋白上样量有多大？提蛋白时有什么要求？做出差异后，胶上的蛋白可否进行质谱分析？质谱分析能估出多少个氨基酸？准确程度有多少？
请不吝赐教。
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jujuba[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:24 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

cuturl('http://ca.expasy.org/sprot/')
搞蛋白不能不知道这个网站，可用以查蛋白氨基酸序列，及domain！
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fqswdzd[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:24 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
推荐《蛋白序列比较与蛋白进化教程》英文版，PDF格式，2.4M
下载网址 cuturl('http://www.people.virginia.edu/~wrp/papers/ismb2000.pdf')
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fqswdzd[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:26 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

整合了生化学家研究蛋白最基本的运算与分析。主要功能有：Amino Acid Analysis, Building Block Sort, Digestion, Elemental Analysis, Mass Fragmentation, HPLC Retention Pattern, Isotopic Profile, Combinatorial Library, Molecular Weight, Sequence Parameters, Charge-pH Profile
下载网址 cuturl('http://www.legend2000.com/aminoXpress/software/amiXControls502.zip')
使用手册 cuturl('http://www.legend2000.com/aminoXpress/software/AmiManual50RTF.zip')
中文使用说明书 cuturl('http://www.bio-soft.net/down/aminoXpressCN.pdf')
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kuohao17[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:27 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

向大家推荐一个国内较好的蛋白质组学网站。
cuturl('http://www.proteomics.com.cn/')
希望对大家有帮助。
上面有好多好好东东，可惜我不搞蛋白质。
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