蛋白质与蛋白组学 » 讨论区 » 经验共享 » 【讨论专区】蛋白质组学研究方法

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标题:【讨论专区】蛋白质组学研究方法

wu11998866[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:42 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

相关疾病：
肿瘤
想作蛋白组学的朋友们可以看看此书
陈主初，梁宋平主编：《肿瘤蛋白质组学》，湖南科技出版社，长沙书价不贵，为22元
该书详细讲述了肿瘤蛋白组学的研究方法和原理，蛋白组学的研究策略。当然也详细给出了作2－DE的蛋白质提取方法，注意事项，是一本不错的参考书。
请大家不要以为我是推销员，我近来也在看蛋白组学相关的内容，有机会看到此书，与大家分享。
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youyou99[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:43 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

个人见解：
1.主流方法凝胶中跑2-D后，收集后蛋白测序，对照数据库。
2.先进行2－D HPLC，然后用32Karat软件进行差异显示，最后用MS进行结构分析。
两者都比较花钱，前者适合纯化后量多的蛋白分析，后者适合微量至痕量蛋白分析。
请问病变细胞与正常细胞的蛋白差异性研究，如何入手？
病人血清蛋白与正常人血清蛋白的差异性研究有意义吗？
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发表于 2014-4-2 22:43 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
请问病变细胞与正常细胞的蛋白差异性研究，如何入手？
病人血清蛋白与正常人血清蛋白的差异性研究有意义吗？

==============================================================================================================

这个概念非常好，实际上蛋白组学的一个很大的课题就是比较不同条件下的蛋白差异性。但是在实践中，蛋白差异性研究非常复杂。蛋白表达有时空两个向量。
按DNA表达的时间向量，主流的pilot实验方法是microarray；然后是PTM比较，经典的方法如你所言2D-gel或新一点的2D色谱或***色谱；
按表达的空间向量，主流的pilot实验方法是荧光标记照相；新一点的用quantitative质谱(比如用同位素标记源自正常细胞的蛋白，来自不同细胞的同一蛋白酶解呔段在谱图上就会有质量差)；
血清中东西太多，建议还是选择特征靶蛋白(群)研究。基於组织的蛋白组研究有报道，但目前还多是展望性研究，或靠大资金支持，throughput很低的。
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发表于 2014-4-2 22:44 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

相关疾病：
结直肠癌
病人血清蛋白与正常人血清蛋白的差异性研究有意义吗？
我们应用SELDI-TOF-MS对大肠癌和健康人以及大肠息肉患者的血清进行了研究，有很多有意义的发现。
cuturl('www.zuci.org')
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greenbee[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:44 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

我这儿有些请看看:
cuturl('http://www.google.com/search?q=%E8%9B%8B%E7%99%BD%E8%B4%A8+filetype%3Appt&ie=UTF-8&oe=UTF-8&hl=zh-CN&lr=')
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TAT[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:45 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
请问你们实验室在哪里?
提供样品检测吗?
收费或是联合?
我的博士课题有部分可能涉及到SELDI-TOF-MS方法检测标本.
谢谢
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ukonptp[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:46 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大


QUOTE:
原帖由 TAT 于 2014-4-2 22:45 发表 bbcodeurl('http://bbs.antpedia.com/images/common/back.gif', '%s')
请问你们实验室在哪里?
提供样品检测吗?
收费或是联合?
我的博士课题有部分可能涉及到SELDI-TOF-MS方法检测标本.
谢谢

在浙江大学肿瘤研究所
提供样品的检测，请问你有多少样品？
由于Ciphergen公司抬高了芯片的价格，所以，我们对样品的检测也提高到每例300元。
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不请自来[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:46 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

推荐一个网站：包含了蛋白质各种信息资源！
cuturl('http://pir.georgetown.edu/')
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coolcool[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:46 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

前段时间有几个双向胶上的蛋白点拿到北京华大基因作MALDI-TOF质谱鉴定，公司的人说角蛋白污染严重，结果不可信。在操作过程中我已做到很小心了。很郁闷啊!请教高手：角蛋白污染主要发生在哪个过程？如何减少角蛋白污染？是不是在整个双向电泳的过程中都必须用进口试剂和MILLI Q水？另外，国内还有哪些单位可作质谱鉴定(价格低点的)。谢谢
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shanzhapia696[使用道具]
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发表于 2014-4-2 22:47 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

相关疾病：
痛风
角蛋白污染也可能发生在样品处理得过程中，例如没有戴帽子或者帽子戴得不好，工作台通风用的filter不干净，一次性手套蘸到了脏的东西等等。不一定是电泳过程中发生的。
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