小中大关于胰蛋白酶酶自解和角蛋白的污染，献上小弟的心得一则，欢迎各路高手指点！
（四） 关于胰蛋白酶酶自解和角蛋白的污染
首先，要尽量降低蛋白酶酶自解,减少角蛋白的污染，因它们“额外”的肽段会干扰质谱检测得到的数据的分析，主要的防护措施有以下几点：
1. 使用TPCK-Trypsin(质谱级)，Promega和Roche公司均有较好产品
2. 在加酶使胶块吸胀后，一定要打掉多余酶液，不要认为这样会影响酶解的效率
3. 酶解时间不宜过长，不要超过24小时
4. 电泳的玻璃板、染胶的器皿等用前洗净
5. 所用试剂和溶液的纯度要高，以便达到质谱分析的要求
6. 尽量使用干净的乳胶手套和洁净的EP管及Millipore H2O
7. 尽量减少不必要的操作步骤，简化操作程序
8. 要有一个洁净的操作环境
但有时蛋白酶酶自解和角蛋白的污染还是难以避免的，那么有必要在数据存储或采集数据时将它剔除，提高搜库的有效性和准确性，同时它们也可以作为内标准物校准仪器(Porcine Trypsin：842.5100和2211.1046，M+H+)，相对外标准物有更高的精确度，下面两个列表表示porcine(表16.1)和bovine(表16.2)胰蛋白酶酶自解理论肽谱(中性，相对分子质量值)。porcine和bovine胰蛋白酶的全序列参考cuturl('http://biochem.roche.com/pack-insert/1418475a.pdf')以及华盛顿大学生物化学系的关于胰蛋白酶的文献[17]。
常见的对质谱影响较大的角蛋白有以下四种：角蛋白1(皮肤)、角蛋白2E(头皮屑)、角蛋白9(皮肤)、角蛋白10(头皮屑)，介于篇幅，不再展开讨论。详情请参见：cuturl('http://www.matrixscience.com/') Help Topic Index：Protein chemistry中autolysis和contaminants选项。
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兄弟出手,必是精品,兄弟是不是在夏其昌老师那里?
cuturl('http://www.matrixscience.com/') Help Topic Index：Protein chemistry中autolysis和contaminants选项。这个网站尽管偶经常上,但偶还从来没有注意到角蛋白理论方面的东西,经您提醒,万分感谢!
