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标题:【求助】质谱结果分析

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发表于 2014-6-5 17:12 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

【求助】质谱结果分析

这是我的质谱结果,请帮忙看一下:得分114的unknown我只知道是同源蛋白,但是和哪个蛋白同源呢?是不是和下面的actin同源?
另:质谱图中的噪音很高,怎样消除噪音呢?我提的是膜蛋白,量方面是不很足.
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发表于 2014-6-5 17:12 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大
unkown和actin是一个蛋白质,原因是他们匹配的肽段一模一样,造成这种问题的原因是你搜索的是ncbi库,是一个冗余库,如果你搜swissprot就不会这样了.
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发表于 2014-6-5 17:13 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

谢谢!
那噪音怎样消除呢?
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 小中大
图的噪音可能是盐的干扰,你可以试一下ziptip脱盐柱,另外,你的峰强度太弱,可以提高点样品量.
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发表于 2014-6-5 17:13 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

可是我是跑了PAGE胶后酶切进样的,盐还存在吗?
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发表于 2014-6-5 17:15 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

当然有啦,buffer里的盐离子是不可忽视的,当然这只是其中的一个主要原因,样品量不足也是其中的一个原因
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uuooii[使用道具]
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发表于 2014-6-5 17:15 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

谢谢啊!
可是做酶切的是实验室经典的啊(考染后的酶切),怎么别人做的噪音就很小呢?我是照着别人的步骤做的
真想哭,都要找工作了,实验还在耗着
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yjf1026[使用道具]
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发表于 2014-6-5 17:15 资料 个人空间 短消息  加为好友 

 小中大

别客气,其实噪音也和机器有关, 比如ABI比布鲁克得噪音要小.
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