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标题:【求助】带his标签的蛋白电泳行为容易改变?

damingxia0904[使用道具]
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1
 

【求助】带his标签的蛋白电泳行为容易改变?

本人表达带六个his的一个蛋白的片断,计算理论分子量是20kDa左右。用NI柱纯化并优化纯化条件,发现主要有约20kDa、约40kDa、约80kDa三条带。后来用anti-his antibody WB检测,表观分子量40kDa的蛋白是目的蛋白。为什么这个表达的蛋白出现在40kDa处?我很想把这个问题搞清楚,但是老板说his是碱性氨基酸,很容易在电泳的时候出现异常,不必浪费时间,还有别的工作等着做。
我的问题是: 各位战友自己的经验或者看到的文献中这种带his的蛋白电泳异常的现象存在吗?如果有,多不多?
另外,各位在做大肠杆菌表达并纯化His标签蛋白的过程中,是不是经常出现一个80kDa左右和镍柱结合比较牢固的杂蛋白?
谢谢各位。
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zwsyrt[使用道具]
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我的30kD左右,电泳条带正常,而且很纯,我是用novagen的一次性小柱,但是重复用10次左右。
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wmp1234[使用道具]
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我的蛋白纯化也是用NI柱纯化的,电泳条带正常,很纯,从来没有出现杂蛋白。我们组里一直都是用NI柱做纯化的,目标蛋白也没有出现什么异常的,建议把你的蛋白去掉his表签看看。
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mod=8048[使用道具]
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4
 
我用的也是novagen的NI纯化试剂盒,但是纯化的感觉总是不是很纯,二次过柱子后就没有东西了。还有感觉纯化效率不高,200ml的细菌总是只能得到2-3毫升的纯化产品。不知道你们是怎么做的,效率怎么样?
还有,融合蛋白蛋白有没有活性?
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66小飞侠[使用道具]
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5
 

我估计是蛋白形成了多聚结构(我以前也碰到过),估计那三条带均为表达条带,而只是2聚体是有活性的
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ritou1985[使用道具]
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6
 
1 除了his标签外,载体上还附带有别的标签在你的目的蛋白上吗?
2 jackey0318战友所提的二聚体值得考虑.
3 测序了吗?
4 目的蛋白是否富含脯氨酸?是否富含碱性氨基酸?如果是,可能出现表观分子量与计算分子量不符的现象.
个人意见.
Bless
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damingxia0904[使用道具]
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7
 
谢谢各位。
蛋白上没有别的标签。
二聚体的话在8M Urea 溶解,再加上还原性SDS-PAGE电泳不可能打不开吧。
我是刚到的另一个实验室,以前我有纯化天然组织中的蛋白的经验。这个实验室其他人没有蛋白纯化的经验。所以我就接手他们构建的载体往下做。以前他们只是用镍柱粗糙的纯化一下,因为有很多杂带,他们还一直想当然的那个20kDa的蛋白就是目的蛋白。并且他们用很不纯的蛋白样品(其中包括40那条)做了多抗,抗体的效果看起来还不错。我开始纯化的的时候也是想当然的以为那个20kDa 的蛋白就是。浪费了两个星期之后我发现,那条20kDa的蛋白在镍柱上的结合力还没有40和80的强。改变binding buffer后那条20的蛋白就没有了。郁闷几天之后,我找到了anti-his的抗体,WB结果以出来发现搞错蛋白了。
呵呵,蛋白确实很有趣,不象DNA那么循规蹈矩。写出这个折腾了两个星期的教训供其他站友借鉴。
我已经决定继续钻这个牛角尖了,1,试试其他的电泳缓冲系统,看表观分子量是多少2,把可溶的纯化出来,用分子筛测测分子量; 3,用MS的方法看看分子量。4,检查别人构建的这个质粒。
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damingxia0904[使用道具]
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WB 显示只有40kda 一条带,20和80的都没有信号。
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